RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579755.1

CDKN2A-214, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDKN2A, Length 1,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-214ENST00000579755 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.45■■■■■ 6.95
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CDKN2A-214ENST00000579755 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.59■■■■■ 5.53
CDKN2A-214ENST00000579755 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.45■■■■■ 5.51
CDKN2A-214ENST00000579755 NACADO15069 1562 aa49.33■■■■■ 5.49
CDKN2A-214ENST00000579755 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.73■■■■■ 5.39
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CDKN2A-214ENST00000579755 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.27■■■■■ 5.32
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CDKN2A-214ENST00000579755 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.72■■■■■ 5.07
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CDKN2A-214ENST00000579755 SMARCA2P51531 1590 aa45.38■■■■■ 4.86
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CDKN2A-214ENST00000579755 WIZO95785 1651 aa44.52■■■■■ 4.72
CDKN2A-214ENST00000579755 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.44■■■■■ 4.71
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CDKN2A-214ENST00000579755 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.21■■■■■ 4.67
CDKN2A-214ENST00000579755 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.09■■■■■ 4.65
CDKN2A-214ENST00000579755 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.09■■■■■ 4.65
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CDKN2A-214ENST00000579755 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.72■■■■■ 4.59
CDKN2A-214ENST00000579755 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.7■■■■■ 4.59
CDKN2A-214ENST00000579755 WDR62O43379 1518 aa43.6■■■■■ 4.57
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CDKN2A-214ENST00000579755 TOPBP1Q92547 1522 aa42.9■■■■■ 4.46
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CDKN2A-214ENST00000579755 IFT140Q96RY7 1462 aa42.82■■■■■ 4.45
CDKN2A-214ENST00000579755 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.78■■■■■ 4.44
CDKN2A-214ENST00000579755 OSCARQ8IYS5 282 aa42.72■■■■■ 4.43
CDKN2A-214ENST00000579755 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
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CDKN2A-214ENST00000579755 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
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CDKN2A-214ENST00000579755 WDR97A6NE52 1622 aa42.06■■■■■ 4.32
CDKN2A-214ENST00000579755 CHD1O14646 1710 aa42.06■■■■■ 4.32
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CDKN2A-214ENST00000579755 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.96■■■■■ 4.31
CDKN2A-214ENST00000579755 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.96■■■■■ 4.31
CDKN2A-214ENST00000579755 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.95■■■■■ 4.31
CDKN2A-214ENST00000579755 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
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CDKN2A-214ENST00000579755 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.84■■■■■ 4.29
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CDKN2A-214ENST00000579755 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.82■■■■■ 4.29
CDKN2A-214ENST00000579755 PBRM1Q86U86 1689 aa41.74■■■■■ 4.27
CDKN2A-214ENST00000579755 TOP2BQ02880 1626 aa41.73■■■■■ 4.27
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CDKN2A-214ENST00000579755 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.71■■■■■ 4.27
CDKN2A-214ENST00000579755 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.7■■■■■ 4.27
CDKN2A-214ENST00000579755 SYNJ1O43426 1573 aa41.67■■■■■ 4.26
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CDKN2A-214ENST00000579755 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.54■■■■■ 4.24
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CDKN2A-214ENST00000579755 CEP170Q5SW79 1584 aa41.14■■■■■ 4.18
CDKN2A-214ENST00000579755 KIF27Q86VH2 1401 aa41.03■■■■■ 4.16
CDKN2A-214ENST00000579755 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.93■■■■■ 4.14
CDKN2A-214ENST00000579755 IGF1RP08069 1367 aa40.92■■■■■ 4.14
CDKN2A-214ENST00000579755 SHROOM2Q13796 1616 aa40.89■■■■■ 4.14
CDKN2A-214ENST00000579755 JPH4Q96JJ6 628 aa40.89■■■■■ 4.14
CDKN2A-214ENST00000579755 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
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