Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX6Q9UPM6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LHX6Q9UPM6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LHX6Q9UPM6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LHX6Q9UPM6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms