RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526269.2

SENCR-201, smooth muscle and endothelial cell enriched migration/differentiation-associated lncRNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SENCR, Length 1,298 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENCR-201ENST00000526269 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.97■■■■■ 6.55
SENCR-201ENST00000526269 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.13■■■■■ 5.62
SENCR-201ENST00000526269 ABCC9O60706 1549 aa49.72■■■■■ 5.55
SENCR-201ENST00000526269 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.54■■■■■ 5.2
SENCR-201ENST00000526269 NACADO15069 1562 aa47.28■■■■■ 5.16
SENCR-201ENST00000526269 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.14■■■■■ 5.14
SENCR-201ENST00000526269 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.73■■■■■ 5.07
SENCR-201ENST00000526269 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
SENCR-201ENST00000526269 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.4■■■■■ 5.02
SENCR-201ENST00000526269 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.31■■■■■ 5
SENCR-201ENST00000526269 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.27■■■■■ 5
SENCR-201ENST00000526269 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.16■■■■■ 4.98
SENCR-201ENST00000526269 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.03■■■■■ 4.96
SENCR-201ENST00000526269 SCRIBQ14160 1630 aa45.7■■■■■ 4.91
SENCR-201ENST00000526269 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.56■■■■■ 4.88
SENCR-201ENST00000526269 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
SENCR-201ENST00000526269 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.93■■■■■ 4.78
SENCR-201ENST00000526269 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.76■■■■■ 4.76
SENCR-201ENST00000526269 SMARCA4P51532 1647 aa43.61■■■■■ 4.57
SENCR-201ENST00000526269 NCAPD3P42695 1498 aa43.6■■■■■ 4.57
SENCR-201ENST00000526269 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.52■■■■■ 4.56
SENCR-201ENST00000526269 SMARCA2P51531 1590 aa43.49■■■■■ 4.55
SENCR-201ENST00000526269 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
SENCR-201ENST00000526269 HMGXB3Q12766 1538 aa43.36■■■■■ 4.53
SENCR-201ENST00000526269 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.51
SENCR-201ENST00000526269 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.16■■■■■ 4.5
SENCR-201ENST00000526269 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.12■■■■■ 4.49
SENCR-201ENST00000526269 ERCC6Q03468 1493 aa42.98■■■■■ 4.47
SENCR-201ENST00000526269 NESP48681 1621 aa42.79■■■■■ 4.44
SENCR-201ENST00000526269 CUX2O14529 1486 aa42.73■■■■■ 4.43
SENCR-201ENST00000526269 WIZO95785 1651 aa42.64■■■■■ 4.42
SENCR-201ENST00000526269 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.61■■■■■ 4.41
SENCR-201ENST00000526269 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.37■■■■■ 4.37
SENCR-201ENST00000526269 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
SENCR-201ENST00000526269 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.31■■■■■ 4.36
SENCR-201ENST00000526269 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
SENCR-201ENST00000526269 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.28■■■■■ 4.36
SENCR-201ENST00000526269 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.19■■■■■ 4.34
SENCR-201ENST00000526269 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SENCR-201ENST00000526269 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.97■■■■■ 4.31
SENCR-201ENST00000526269 CFTRP13569 1480 aa41.9■■■■■ 4.3
SENCR-201ENST00000526269 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.9■■■■■ 4.3
SENCR-201ENST00000526269 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
SENCR-201ENST00000526269 WDR62O43379 1518 aa41.83■■■■■ 4.29
SENCR-201ENST00000526269 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.63■■■■■ 4.25
SENCR-201ENST00000526269 PRDM2Q13029 1718 aa41.58■■■■■ 4.25
SENCR-201ENST00000526269 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
SENCR-201ENST00000526269 TOPBP1Q92547 1522 aa41.09■■■■■ 4.17
SENCR-201ENST00000526269 ABCC8Q09428 1581 aa41.08■■■■■ 4.17
SENCR-201ENST00000526269 IFT140Q96RY7 1462 aa41.03■■■■■ 4.16
SENCR-201ENST00000526269 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41■■■■■ 4.15
SENCR-201ENST00000526269 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
SENCR-201ENST00000526269 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SENCR-201ENST00000526269 OSCARQ8IYS5 282 aa40.82■■■■■ 4.13
SENCR-201ENST00000526269 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
SENCR-201ENST00000526269 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
SENCR-201ENST00000526269 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
SENCR-201ENST00000526269 TRIM41Q8WV44 630 aa40.59■■■■■ 4.09
SENCR-201ENST00000526269 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.55■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.52■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 SOGA1O94964 1423 aa40.52■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.51■■■■■ 4.08
SENCR-201ENST00000526269 CUX1P39880 1505 aa40.5■■■■■ 4.07
SENCR-201ENST00000526269 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.06
SENCR-201ENST00000526269 WDR97A6NE52 1622 aa40.37■■■■■ 4.05
SENCR-201ENST00000526269 CHD1O14646 1710 aa40.35■■■■■ 4.05
SENCR-201ENST00000526269 FBLN2P98095 1184 aa40.29■■■■■ 4.04
SENCR-201ENST00000526269 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.25■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.25■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.25■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.2■■■■■ 4.03
SENCR-201ENST00000526269 ARHGEF11O15085 1522 aa40.16■■■■■ 4.02
SENCR-201ENST00000526269 GRIN2BQ13224 1484 aa40.15■■■■■ 4.02
SENCR-201ENST00000526269 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
SENCR-201ENST00000526269 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.06■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 PBRM1Q86U86 1689 aa40.04■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.02■■■■■ 4
SENCR-201ENST00000526269 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.99■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 TOP2BQ02880 1626 aa39.98■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 SYNJ2O15056 1496 aa39.97■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.97■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 SYNJ1O43426 1573 aa39.95■■■■□ 3.99
SENCR-201ENST00000526269 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.86■■■■□ 3.97
SENCR-201ENST00000526269 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.83■■■■□ 3.97
SENCR-201ENST00000526269 ARAP1Q96P48 1450 aa39.78■■■■□ 3.96
SENCR-201ENST00000526269 ADAMTS12P58397 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
SENCR-201ENST00000526269 GRIN2AQ12879 1464 aa39.62■■■■□ 3.93
SENCR-201ENST00000526269 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.59■■■■□ 3.93
SENCR-201ENST00000526269 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.57■■■■□ 3.92
SENCR-201ENST00000526269 NUP160Q12769 1436 aa39.45■■■■□ 3.91
SENCR-201ENST00000526269 CEP170Q5SW79 1584 aa39.44■■■■□ 3.9
SENCR-201ENST00000526269 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
SENCR-201ENST00000526269 KIF27Q86VH2 1401 aa39.25■■■■□ 3.87
SENCR-201ENST00000526269 SHROOM2Q13796 1616 aa39.24■■■■□ 3.87
SENCR-201ENST00000526269 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.23■■■■□ 3.87
SENCR-201ENST00000526269 CUL7Q14999 1698 aa39.13■■■■□ 3.85
SENCR-201ENST00000526269 IGF1RP08069 1367 aa39.1■■■■□ 3.85
SENCR-201ENST00000526269 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.09■■■■□ 3.85
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