RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400525.6

TXNRD2-205, Transcript of thioredoxin reductase 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TXNRD2, Length 1,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2-205ENST00000400525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.01■■■■■ 7.04
TXNRD2-205ENST00000400525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.04■■■■■ 5.92
TXNRD2-205ENST00000400525 ABCC9O60706 1549 aa50.49■■■■■ 5.67
TXNRD2-205ENST00000400525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.41■■■■■ 5.5
TXNRD2-205ENST00000400525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.29■■■■■ 5.48
TXNRD2-205ENST00000400525 NACADO15069 1562 aa48.8■■■■■ 5.4
TXNRD2-205ENST00000400525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.72■■■■■ 5.39
TXNRD2-205ENST00000400525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.72■■■■■ 5.39
TXNRD2-205ENST00000400525 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.63■■■■■ 5.37
TXNRD2-205ENST00000400525 SCRIBQ14160 1630 aa47.76■■■■■ 5.24
TXNRD2-205ENST00000400525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.64■■■■■ 5.22
TXNRD2-205ENST00000400525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.4■■■■■ 5.187e-7■■■■□ 25.6
TXNRD2-205ENST00000400525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.38■■■■■ 5.18
TXNRD2-205ENST00000400525 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.2■■■■■ 5.15
TXNRD2-205ENST00000400525 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.98■■■■■ 4.95
TXNRD2-205ENST00000400525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
TXNRD2-205ENST00000400525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.69■■■■■ 4.9
TXNRD2-205ENST00000400525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.68■■■■■ 4.9
TXNRD2-205ENST00000400525 SMARCA4P51532 1647 aa45.64■■■■■ 4.9
TXNRD2-205ENST00000400525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.61■■■■■ 4.89
TXNRD2-205ENST00000400525 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.55■■■■■ 4.88
TXNRD2-205ENST00000400525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
TXNRD2-205ENST00000400525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.22■■■■■ 4.83
TXNRD2-205ENST00000400525 SMARCA2P51531 1590 aa45.17■■■■■ 4.82
TXNRD2-205ENST00000400525 WIZO95785 1651 aa45.13■■■■■ 4.82
TXNRD2-205ENST00000400525 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.81
TXNRD2-205ENST00000400525 NCAPD3P42695 1498 aa45.03■■■■■ 4.8
TXNRD2-205ENST00000400525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
TXNRD2-205ENST00000400525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.79
TXNRD2-205ENST00000400525 HMGXB3Q12766 1538 aa44.85■■■■■ 4.77
TXNRD2-205ENST00000400525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
TXNRD2-205ENST00000400525 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.15■■■■■ 4.66
TXNRD2-205ENST00000400525 NESP48681 1621 aa43.88■■■■■ 4.62
TXNRD2-205ENST00000400525 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.84■■■■■ 4.61
TXNRD2-205ENST00000400525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.74■■■■■ 4.59
TXNRD2-205ENST00000400525 CFTRP13569 1480 aa43.68■■■■■ 4.58
TXNRD2-205ENST00000400525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.49■■■■■ 4.55
TXNRD2-205ENST00000400525 ERCC6Q03468 1493 aa43.47■■■■■ 4.55
TXNRD2-205ENST00000400525 PRDM2Q13029 1718 aa43.36■■■■■ 4.53
TXNRD2-205ENST00000400525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.36■■■■■ 4.53
TXNRD2-205ENST00000400525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.32■■■■■ 4.53
TXNRD2-205ENST00000400525 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.23■■■■■ 4.51
TXNRD2-205ENST00000400525 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.97■■■■■ 4.47
TXNRD2-205ENST00000400525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
TXNRD2-205ENST00000400525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.86■■■■■ 4.45
TXNRD2-205ENST00000400525 ABCC8Q09428 1581 aa42.84■■■■■ 4.45
TXNRD2-205ENST00000400525 WDR62O43379 1518 aa42.76■■■■■ 4.44
TXNRD2-205ENST00000400525 TOPBP1Q92547 1522 aa42.72■■■■■ 4.43
TXNRD2-205ENST00000400525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.71■■■■■ 4.43
TXNRD2-205ENST00000400525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.69■■■■■ 4.43
TXNRD2-205ENST00000400525 CUX1P39880 1505 aa42.67■■■■■ 4.42
TXNRD2-205ENST00000400525 CUX2O14529 1486 aa42.56■■■■■ 4.4
TXNRD2-205ENST00000400525 SYNJ1O43426 1573 aa42.55■■■■■ 4.4
TXNRD2-205ENST00000400525 TOP2BQ02880 1626 aa42.46■■■■■ 4.39
TXNRD2-205ENST00000400525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.44■■■■■ 4.39
TXNRD2-205ENST00000400525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.42■■■■■ 4.38
TXNRD2-205ENST00000400525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
TXNRD2-205ENST00000400525 TRIM41Q8WV44 630 aa42.36■■■■■ 4.37
TXNRD2-205ENST00000400525 SOGA1O94964 1423 aa42.31■■■■■ 4.36
TXNRD2-205ENST00000400525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
TXNRD2-205ENST00000400525 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.26■■■■■ 4.35
TXNRD2-205ENST00000400525 IFT140Q96RY7 1462 aa42.24■■■■■ 4.35
TXNRD2-205ENST00000400525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
TXNRD2-205ENST00000400525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
TXNRD2-205ENST00000400525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
TXNRD2-205ENST00000400525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42■■■■■ 4.31
TXNRD2-205ENST00000400525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.97■■■■■ 4.312e-7■■■■■ 28.7
TXNRD2-205ENST00000400525 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
TXNRD2-205ENST00000400525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
TXNRD2-205ENST00000400525 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.8■■■■■ 4.28
TXNRD2-205ENST00000400525 KIF27Q86VH2 1401 aa41.76■■■■■ 4.28
TXNRD2-205ENST00000400525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.75■■■■■ 4.27
TXNRD2-205ENST00000400525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.67■■■■■ 4.26
TXNRD2-205ENST00000400525 GRIN2BQ13224 1484 aa41.67■■■■■ 4.26
TXNRD2-205ENST00000400525 PBRM1Q86U86 1689 aa41.63■■■■■ 4.25
TXNRD2-205ENST00000400525 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
TXNRD2-205ENST00000400525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
TXNRD2-205ENST00000400525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.5■■■■■ 4.23
TXNRD2-205ENST00000400525 FBLN2P98095 1184 aa41.49■■■■■ 4.23
TXNRD2-205ENST00000400525 IGF1RP08069 1367 aa41.49■■■■■ 4.23
TXNRD2-205ENST00000400525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
TXNRD2-205ENST00000400525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
TXNRD2-205ENST00000400525 EEA1Q15075 1411 aa41.37■■■■■ 4.21
TXNRD2-205ENST00000400525 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.35■■■■■ 4.21
TXNRD2-205ENST00000400525 ADAMTS12P58397 1594 aa41.32■■■■■ 4.2
TXNRD2-205ENST00000400525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.31■■■■■ 4.2
TXNRD2-205ENST00000400525 SYNJ2O15056 1496 aa41.3■■■■■ 4.2
TXNRD2-205ENST00000400525 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.29■■■■■ 4.2
TXNRD2-205ENST00000400525 CUL7Q14999 1698 aa41.27■■■■■ 4.2
TXNRD2-205ENST00000400525 CHD1O14646 1710 aa41.24■■■■■ 4.19
TXNRD2-205ENST00000400525 GRIN2AQ12879 1464 aa41.14■■■■■ 4.18
TXNRD2-205ENST00000400525 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.13■■■■■ 4.18
TXNRD2-205ENST00000400525 OSCARQ8IYS5 282 aa41.1■■■■■ 4.17
TXNRD2-205ENST00000400525 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.1■■■■■ 4.17
TXNRD2-205ENST00000400525 PRXQ9BXM0 1461 aa41.08■■■■■ 4.17
TXNRD2-205ENST00000400525 CEP170Q5SW79 1584 aa40.9■■■■■ 4.14
TXNRD2-205ENST00000400525 KIF21BO75037 1637 aa40.89■■■■■ 4.14
TXNRD2-205ENST00000400525 NUP160Q12769 1436 aa40.87■■■■■ 4.13
TXNRD2-205ENST00000400525 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
TXNRD2-205ENST00000400525 GOLGA3Q08378 1498 aa40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms