RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435510.6

NRBF2-202, Transcript of nuclear receptor binding factor 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NRBF2, Length 1,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRBF2-202ENST00000435510 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.3■■■■■ 7.08
NRBF2-202ENST00000435510 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.17■■■■■ 5.94
NRBF2-202ENST00000435510 ABCC9O60706 1549 aa49.79■■■■■ 5.56
NRBF2-202ENST00000435510 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.7■■■■■ 5.55
NRBF2-202ENST00000435510 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.15■■■■■ 5.46
NRBF2-202ENST00000435510 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.95■■■■■ 5.43
NRBF2-202ENST00000435510 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.87■■■■■ 5.41
NRBF2-202ENST00000435510 NACADO15069 1562 aa48.73■■■■■ 5.39
NRBF2-202ENST00000435510 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.47■■■■■ 5.35
NRBF2-202ENST00000435510 SCRIBQ14160 1630 aa47.7■■■■■ 5.23
NRBF2-202ENST00000435510 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.61■■■■■ 5.21
NRBF2-202ENST00000435510 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.42■■■■■ 5.18
NRBF2-202ENST00000435510 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
NRBF2-202ENST00000435510 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.72■■■■■ 5.07
NRBF2-202ENST00000435510 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.05■■■■■ 4.96
NRBF2-202ENST00000435510 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
NRBF2-202ENST00000435510 SMARCA4P51532 1647 aa45.75■■■■■ 4.92
NRBF2-202ENST00000435510 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.73■■■■■ 4.91
NRBF2-202ENST00000435510 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
NRBF2-202ENST00000435510 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
NRBF2-202ENST00000435510 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
NRBF2-202ENST00000435510 WIZO95785 1651 aa45.31■■■■■ 4.84
NRBF2-202ENST00000435510 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.31■■■■■ 4.84
NRBF2-202ENST00000435510 SMARCA2P51531 1590 aa45.18■■■■■ 4.82
NRBF2-202ENST00000435510 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.17■■■■■ 4.82
NRBF2-202ENST00000435510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.12■■■■■ 4.81
NRBF2-202ENST00000435510 NCAPD3P42695 1498 aa44.94■■■■■ 4.79
NRBF2-202ENST00000435510 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
NRBF2-202ENST00000435510 HMGXB3Q12766 1538 aa44.86■■■■■ 4.77
NRBF2-202ENST00000435510 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
NRBF2-202ENST00000435510 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.52■■■■■ 4.72
NRBF2-202ENST00000435510 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.36■■■■■ 4.69
NRBF2-202ENST00000435510 CFTRP13569 1480 aa43.73■■■■■ 4.59
NRBF2-202ENST00000435510 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.7■■■■■ 4.59
NRBF2-202ENST00000435510 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.56■■■■■ 4.56
NRBF2-202ENST00000435510 PRDM2Q13029 1718 aa43.53■■■■■ 4.56
NRBF2-202ENST00000435510 NESP48681 1621 aa43.47■■■■■ 4.55
NRBF2-202ENST00000435510 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.21■■■■■ 4.51
NRBF2-202ENST00000435510 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.2■■■■■ 4.51
NRBF2-202ENST00000435510 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.18■■■■■ 4.5
NRBF2-202ENST00000435510 ABCC8Q09428 1581 aa43.14■■■■■ 4.5
NRBF2-202ENST00000435510 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.03■■■■■ 4.48
NRBF2-202ENST00000435510 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.02■■■■■ 4.48
NRBF2-202ENST00000435510 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.48
NRBF2-202ENST00000435510 SYNJ1O43426 1573 aa42.86■■■■■ 4.45
NRBF2-202ENST00000435510 TRIM41Q8WV44 630 aa42.85■■■■■ 4.45
NRBF2-202ENST00000435510 CUX1P39880 1505 aa42.83■■■■■ 4.45
NRBF2-202ENST00000435510 TOP2BQ02880 1626 aa42.81■■■■■ 4.44
NRBF2-202ENST00000435510 ERCC6Q03468 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
NRBF2-202ENST00000435510 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.8■■■■■ 4.44
NRBF2-202ENST00000435510 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.73■■■■■ 4.43
NRBF2-202ENST00000435510 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
NRBF2-202ENST00000435510 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.7■■■■■ 4.43
NRBF2-202ENST00000435510 TOPBP1Q92547 1522 aa42.66■■■■■ 4.42
NRBF2-202ENST00000435510 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
NRBF2-202ENST00000435510 WDR62O43379 1518 aa42.54■■■■■ 4.4
NRBF2-202ENST00000435510 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.47■■■■■ 4.39
NRBF2-202ENST00000435510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
NRBF2-202ENST00000435510 SOGA1O94964 1423 aa42.21■■■■■ 4.35
NRBF2-202ENST00000435510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.18■■■■■ 4.34
NRBF2-202ENST00000435510 CUX2O14529 1486 aa42.17■■■■■ 4.34
NRBF2-202ENST00000435510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.14■■■■■ 4.34
NRBF2-202ENST00000435510 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
NRBF2-202ENST00000435510 WDR97A6NE52 1622 aa42.1■■■■■ 4.33
NRBF2-202ENST00000435510 EEA1Q15075 1411 aa42.07■■■■■ 4.33
NRBF2-202ENST00000435510 IFT140Q96RY7 1462 aa42.07■■■■■ 4.32
NRBF2-202ENST00000435510 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.03■■■■■ 4.32
NRBF2-202ENST00000435510 KIF27Q86VH2 1401 aa42.01■■■■■ 4.32
NRBF2-202ENST00000435510 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
NRBF2-202ENST00000435510 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.87■■■■■ 4.29
NRBF2-202ENST00000435510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.28
NRBF2-202ENST00000435510 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.79■■■■■ 4.28
NRBF2-202ENST00000435510 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
NRBF2-202ENST00000435510 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.77■■■■■ 4.28
NRBF2-202ENST00000435510 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.261e-7■■■□□ 15
NRBF2-202ENST00000435510 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
NRBF2-202ENST00000435510 IGF1RP08069 1367 aa41.68■■■■■ 4.26
NRBF2-202ENST00000435510 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.65■■■■■ 4.26
NRBF2-202ENST00000435510 PBRM1Q86U86 1689 aa41.62■■■■■ 4.25
NRBF2-202ENST00000435510 GRIN2BQ13224 1484 aa41.58■■■■■ 4.25
NRBF2-202ENST00000435510 KIF21BO75037 1637 aa41.56■■■■■ 4.24
NRBF2-202ENST00000435510 PRXQ9BXM0 1461 aa41.55■■■■■ 4.24
NRBF2-202ENST00000435510 CUL7Q14999 1698 aa41.53■■■■■ 4.24
NRBF2-202ENST00000435510 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.45■■■■■ 4.23
NRBF2-202ENST00000435510 GOLGA3Q08378 1498 aa41.4■■■■■ 4.22
NRBF2-202ENST00000435510 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.39■■■■■ 4.22
NRBF2-202ENST00000435510 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.37■■■■■ 4.21
NRBF2-202ENST00000435510 ADAMTS12P58397 1594 aa41.36■■■■■ 4.21
NRBF2-202ENST00000435510 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.36■■■■■ 4.21
NRBF2-202ENST00000435510 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
NRBF2-202ENST00000435510 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
NRBF2-202ENST00000435510 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.27■■■■■ 4.2
NRBF2-202ENST00000435510 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
NRBF2-202ENST00000435510 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
NRBF2-202ENST00000435510 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.11■■■■■ 4.17
NRBF2-202ENST00000435510 GRIN2AQ12879 1464 aa41.06■■■■■ 4.16
NRBF2-202ENST00000435510 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
NRBF2-202ENST00000435510 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.93■■■■■ 4.14
NRBF2-202ENST00000435510 CHD1O14646 1710 aa40.91■■■■■ 4.14
NRBF2-202ENST00000435510 FBLN2P98095 1184 aa40.9■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms