RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.12■■■■■ 6.41
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.52■■■■■ 5.52
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC9O60706 1549 aa49.49■■■■■ 5.51
CDKN2A-210ENST00000530628 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.14■■■■■ 5.14
CDKN2A-210ENST00000530628 NACADO15069 1562 aa46.79■■■■■ 5.08
CDKN2A-210ENST00000530628 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.61■■■■■ 5.05
CDKN2A-210ENST00000530628 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.38■■■■■ 5.02
CDKN2A-210ENST00000530628 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.13■■■■■ 4.97
CDKN2A-210ENST00000530628 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.11■■■■■ 4.97
CDKN2A-210ENST00000530628 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.07■■■■■ 4.97
CDKN2A-210ENST00000530628 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.71■■■■■ 4.91
CDKN2A-210ENST00000530628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
CDKN2A-210ENST00000530628 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.53■■■■■ 4.88
CDKN2A-210ENST00000530628 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.11■■■■■ 4.81
CDKN2A-210ENST00000530628 SCRIBQ14160 1630 aa45.1■■■■■ 4.81
CDKN2A-210ENST00000530628 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.72■■■■■ 4.75
CDKN2A-210ENST00000530628 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
CDKN2A-210ENST00000530628 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.58■■■■■ 4.73
CDKN2A-210ENST00000530628 NCAPD3P42695 1498 aa43.17■■■■■ 4.5
CDKN2A-210ENST00000530628 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
CDKN2A-210ENST00000530628 SMARCA4P51532 1647 aa43.02■■■■■ 4.48
CDKN2A-210ENST00000530628 SMARCA2P51531 1590 aa42.95■■■■■ 4.47
CDKN2A-210ENST00000530628 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
CDKN2A-210ENST00000530628 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.44
CDKN2A-210ENST00000530628 ERCC6Q03468 1493 aa42.75■■■■■ 4.43
CDKN2A-210ENST00000530628 CUX2O14529 1486 aa42.66■■■■■ 4.42
CDKN2A-210ENST00000530628 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
CDKN2A-210ENST00000530628 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.64■■■■■ 4.42
CDKN2A-210ENST00000530628 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.58■■■■■ 4.41
CDKN2A-210ENST00000530628 NESP48681 1621 aa42.49■■■■■ 4.39
CDKN2A-210ENST00000530628 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.47■■■■■ 4.39
CDKN2A-210ENST00000530628 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.24■■■■■ 4.35
CDKN2A-210ENST00000530628 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.01■■■■■ 4.32
CDKN2A-210ENST00000530628 WIZO95785 1651 aa42■■■■■ 4.31
CDKN2A-210ENST00000530628 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.99■■■■■ 4.31
CDKN2A-210ENST00000530628 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.88■■■■■ 4.29
CDKN2A-210ENST00000530628 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.61■■■■■ 4.25
CDKN2A-210ENST00000530628 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CDKN2A-210ENST00000530628 WDR62O43379 1518 aa41.5■■■■■ 4.23
CDKN2A-210ENST00000530628 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.46■■■■■ 4.23
CDKN2A-210ENST00000530628 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
CDKN2A-210ENST00000530628 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.4■■■■■ 4.22
CDKN2A-210ENST00000530628 CFTRP13569 1480 aa41.38■■■■■ 4.21
CDKN2A-210ENST00000530628 PRDM2Q13029 1718 aa41.07■■■■■ 4.17
CDKN2A-210ENST00000530628 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.04■■■■■ 4.16
CDKN2A-210ENST00000530628 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.97■■■■■ 4.15
CDKN2A-210ENST00000530628 TRIM41Q8WV44 630 aa40.8■■■■■ 4.12
CDKN2A-210ENST00000530628 OSCARQ8IYS5 282 aa40.75■■■■■ 4.11
CDKN2A-210ENST00000530628 IFT140Q96RY7 1462 aa40.63■■■■■ 4.09
CDKN2A-210ENST00000530628 TOPBP1Q92547 1522 aa40.62■■■■■ 4.09
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC8Q09428 1581 aa40.57■■■■■ 4.09
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
CDKN2A-210ENST00000530628 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.48■■■■■ 4.07
CDKN2A-210ENST00000530628 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CDKN2A-210ENST00000530628 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CDKN2A-210ENST00000530628 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
CDKN2A-210ENST00000530628 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
CDKN2A-210ENST00000530628 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
CDKN2A-210ENST00000530628 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
CDKN2A-210ENST00000530628 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
CDKN2A-210ENST00000530628 CHD1O14646 1710 aa40.09■■■■■ 4.01
CDKN2A-210ENST00000530628 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.05■■■■■ 4
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGEF11O15085 1522 aa40.05■■■■■ 4
CDKN2A-210ENST00000530628 SOGA1O94964 1423 aa40.04■■■■■ 4
CDKN2A-210ENST00000530628 FBLN2P98095 1184 aa39.98■■■■□ 3.99
CDKN2A-210ENST00000530628 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
CDKN2A-210ENST00000530628 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.94■■■■□ 3.98
CDKN2A-210ENST00000530628 CUX1P39880 1505 aa39.9■■■■□ 3.98
CDKN2A-210ENST00000530628 WDR97A6NE52 1622 aa39.87■■■■□ 3.97
CDKN2A-210ENST00000530628 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
CDKN2A-210ENST00000530628 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.78■■■■□ 3.96
CDKN2A-210ENST00000530628 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.77■■■■□ 3.96
CDKN2A-210ENST00000530628 GRIN2BQ13224 1484 aa39.68■■■■□ 3.94
CDKN2A-210ENST00000530628 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
CDKN2A-210ENST00000530628 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
CDKN2A-210ENST00000530628 ARAP1Q96P48 1450 aa39.63■■■■□ 3.94
CDKN2A-210ENST00000530628 SYNJ1O43426 1573 aa39.59■■■■□ 3.93
CDKN2A-210ENST00000530628 PBRM1Q86U86 1689 aa39.58■■■■□ 3.93
CDKN2A-210ENST00000530628 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.56■■■■□ 3.92
CDKN2A-210ENST00000530628 SYNJ2O15056 1496 aa39.55■■■■□ 3.92
CDKN2A-210ENST00000530628 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.55■■■■□ 3.92
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.5■■■■□ 3.91
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.43■■■■□ 3.9
CDKN2A-210ENST00000530628 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
CDKN2A-210ENST00000530628 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.34■■■■□ 3.89
CDKN2A-210ENST00000530628 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.31■■■■□ 3.88
CDKN2A-210ENST00000530628 TOP2BQ02880 1626 aa39.29■■■■□ 3.88
CDKN2A-210ENST00000530628 GRIN2AQ12879 1464 aa39.16■■■■□ 3.86
CDKN2A-210ENST00000530628 ADAMTS12P58397 1594 aa39.14■■■■□ 3.86
CDKN2A-210ENST00000530628 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.04■■■■□ 3.84
CDKN2A-210ENST00000530628 CEP170Q5SW79 1584 aa39.02■■■■□ 3.84
CDKN2A-210ENST00000530628 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.01■■■■□ 3.84
CDKN2A-210ENST00000530628 NUP160Q12769 1436 aa39.01■■■■□ 3.84
CDKN2A-210ENST00000530628 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.94■■■■□ 3.82
CDKN2A-210ENST00000530628 SHROOM2Q13796 1616 aa38.87■■■■□ 3.81
CDKN2A-210ENST00000530628 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
CDKN2A-210ENST00000530628 JPH4Q96JJ6 628 aa38.66■■■■□ 3.78
CDKN2A-210ENST00000530628 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.58■■■■□ 3.77
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF27Q86VH2 1401 aa38.53■■■■□ 3.76
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