RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512343.5

RASGEF1B-209, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-209ENST00000512343 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.26■■■■■ 6.44
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.59■■■■■ 5.53
RASGEF1B-209ENST00000512343 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.2■■■■■ 5.15
RASGEF1B-209ENST00000512343 NACADO15069 1562 aa46.85■■■■■ 5.09
RASGEF1B-209ENST00000512343 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.75■■■■■ 5.07
RASGEF1B-209ENST00000512343 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.67■■■■■ 5.06
RASGEF1B-209ENST00000512343 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.29■■■■■ 5
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RASGEF1B-209ENST00000512343 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.13■■■■■ 4.97
RASGEF1B-209ENST00000512343 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.91■■■■■ 4.94
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
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RASGEF1B-209ENST00000512343 SCRIBQ14160 1630 aa45.3■■■■■ 4.84
RASGEF1B-209ENST00000512343 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
RASGEF1B-209ENST00000512343 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.88■■■■■ 4.78
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
RASGEF1B-209ENST00000512343 NCAPD3P42695 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
RASGEF1B-209ENST00000512343 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.16■■■■■ 4.5
RASGEF1B-209ENST00000512343 SMARCA4P51532 1647 aa43.15■■■■■ 4.5
RASGEF1B-209ENST00000512343 SMARCA2P51531 1590 aa43■■■■■ 4.47
RASGEF1B-209ENST00000512343 HMGXB3Q12766 1538 aa42.94■■■■■ 4.46
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RASGEF1B-209ENST00000512343 ERCC6Q03468 1493 aa42.86■■■■■ 4.45
RASGEF1B-209ENST00000512343 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.76■■■■■ 4.44
RASGEF1B-209ENST00000512343 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
RASGEF1B-209ENST00000512343 NESP48681 1621 aa42.72■■■■■ 4.43
RASGEF1B-209ENST00000512343 CUX2O14529 1486 aa42.72■■■■■ 4.43
RASGEF1B-209ENST00000512343 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.65■■■■■ 4.42
RASGEF1B-209ENST00000512343 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.65■■■■■ 4.42
RASGEF1B-209ENST00000512343 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
RASGEF1B-209ENST00000512343 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
RASGEF1B-209ENST00000512343 WIZO95785 1651 aa42.18■■■■■ 4.34
RASGEF1B-209ENST00000512343 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.18■■■■■ 4.34
RASGEF1B-209ENST00000512343 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.03■■■■■ 4.32
RASGEF1B-209ENST00000512343 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.95■■■■■ 4.31
RASGEF1B-209ENST00000512343 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.72■■■■■ 4.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 WDR62O43379 1518 aa41.62■■■■■ 4.25
RASGEF1B-209ENST00000512343 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RASGEF1B-209ENST00000512343 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.55■■■■■ 4.24
RASGEF1B-209ENST00000512343 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.52■■■■■ 4.24
RASGEF1B-209ENST00000512343 CFTRP13569 1480 aa41.47■■■■■ 4.23
RASGEF1B-209ENST00000512343 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRDM2Q13029 1718 aa41.13■■■■■ 4.18
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.1■■■■■ 4.17
RASGEF1B-209ENST00000512343 TRIM41Q8WV44 630 aa40.98■■■■■ 4.15
RASGEF1B-209ENST00000512343 OSCARQ8IYS5 282 aa40.79■■■■■ 4.12
RASGEF1B-209ENST00000512343 TOPBP1Q92547 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
RASGEF1B-209ENST00000512343 IFT140Q96RY7 1462 aa40.69■■■■■ 4.1
RASGEF1B-209ENST00000512343 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.57■■■■■ 4.09
RASGEF1B-209ENST00000512343 ABCC8Q09428 1581 aa40.54■■■■■ 4.08
RASGEF1B-209ENST00000512343 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
RASGEF1B-209ENST00000512343 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
RASGEF1B-209ENST00000512343 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1B-209ENST00000512343 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1B-209ENST00000512343 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1B-209ENST00000512343 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CHD1O14646 1710 aa40.25■■■■■ 4.03
RASGEF1B-209ENST00000512343 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.23■■■■■ 4.03
RASGEF1B-209ENST00000512343 ARHGEF11O15085 1522 aa40.19■■■■■ 4.02
RASGEF1B-209ENST00000512343 SOGA1O94964 1423 aa40.12■■■■■ 4.01
RASGEF1B-209ENST00000512343 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
RASGEF1B-209ENST00000512343 FBLN2P98095 1184 aa40.09■■■■■ 4.01
RASGEF1B-209ENST00000512343 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
RASGEF1B-209ENST00000512343 CUX1P39880 1505 aa40.06■■■■■ 4
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.91■■■■□ 3.98
RASGEF1B-209ENST00000512343 WDR97A6NE52 1622 aa39.86■■■■□ 3.97
RASGEF1B-209ENST00000512343 ARAP1Q96P48 1450 aa39.81■■■■□ 3.96
RASGEF1B-209ENST00000512343 GRIN2BQ13224 1484 aa39.75■■■■□ 3.95
RASGEF1B-209ENST00000512343 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
RASGEF1B-209ENST00000512343 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
RASGEF1B-209ENST00000512343 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.7■■■■□ 3.95
RASGEF1B-209ENST00000512343 PBRM1Q86U86 1689 aa39.7■■■■□ 3.95
RASGEF1B-209ENST00000512343 SYNJ1O43426 1573 aa39.65■■■■□ 3.94
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RASGEF1B-209ENST00000512343 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
RASGEF1B-209ENST00000512343 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.58■■■■□ 3.93
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RASGEF1B-209ENST00000512343 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
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RASGEF1B-209ENST00000512343 CEP170Q5SW79 1584 aa39.18■■■■□ 3.86
RASGEF1B-209ENST00000512343 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.18■■■■□ 3.86
RASGEF1B-209ENST00000512343 NUP160Q12769 1436 aa39.11■■■■□ 3.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.1■■■■□ 3.85
RASGEF1B-209ENST00000512343 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
RASGEF1B-209ENST00000512343 SHROOM2Q13796 1616 aa38.98■■■■□ 3.83
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
RASGEF1B-209ENST00000512343 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.73■■■■□ 3.79
RASGEF1B-209ENST00000512343 JPH4Q96JJ6 628 aa38.72■■■■□ 3.79
RASGEF1B-209ENST00000512343 IGF1RP08069 1367 aa38.58■■■■□ 3.77
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