RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480977.2

LGR4-203, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LGR4, Length 492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4-203ENST00000480977 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.15■■■■■ 6.42
LGR4-203ENST00000480977 ABCC9O60706 1549 aa49.71■■■■■ 5.55
LGR4-203ENST00000480977 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.67■■■■■ 5.54
LGR4-203ENST00000480977 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.31■■■■■ 5.16
LGR4-203ENST00000480977 NACADO15069 1562 aa46.9■■■■■ 5.1
LGR4-203ENST00000480977 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.62■■■■■ 5.05
LGR4-203ENST00000480977 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.59■■■■■ 5.05
LGR4-203ENST00000480977 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.36■■■■■ 5.01
LGR4-203ENST00000480977 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.19■■■■■ 4.98
LGR4-203ENST00000480977 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.14■■■■■ 4.98
LGR4-203ENST00000480977 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.88■■■■■ 4.93
LGR4-203ENST00000480977 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.91
LGR4-203ENST00000480977 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.52■■■■■ 4.88
LGR4-203ENST00000480977 SCRIBQ14160 1630 aa45.26■■■■■ 4.84
LGR4-203ENST00000480977 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.23■■■■■ 4.83
LGR4-203ENST00000480977 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.94■■■■■ 4.79
LGR4-203ENST00000480977 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
LGR4-203ENST00000480977 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
LGR4-203ENST00000480977 NCAPD3P42695 1498 aa43.22■■■■■ 4.51
LGR4-203ENST00000480977 SMARCA4P51532 1647 aa43.13■■■■■ 4.49
LGR4-203ENST00000480977 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.1■■■■■ 4.49
LGR4-203ENST00000480977 SMARCA2P51531 1590 aa43.04■■■■■ 4.48
LGR4-203ENST00000480977 HMGXB3Q12766 1538 aa42.98■■■■■ 4.47
LGR4-203ENST00000480977 ERCC6Q03468 1493 aa42.97■■■■■ 4.47
LGR4-203ENST00000480977 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.9■■■■■ 4.46
LGR4-203ENST00000480977 CUX2O14529 1486 aa42.89■■■■■ 4.46
LGR4-203ENST00000480977 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
LGR4-203ENST00000480977 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
LGR4-203ENST00000480977 NESP48681 1621 aa42.66■■■■■ 4.42
LGR4-203ENST00000480977 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.65■■■■■ 4.42
LGR4-203ENST00000480977 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.5■■■■■ 4.39
LGR4-203ENST00000480977 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.39■■■■■ 4.38
LGR4-203ENST00000480977 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
LGR4-203ENST00000480977 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.25■■■■■ 4.35
LGR4-203ENST00000480977 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.08■■■■■ 4.33
LGR4-203ENST00000480977 WIZO95785 1651 aa42.07■■■■■ 4.33
LGR4-203ENST00000480977 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.9■■■■■ 4.3
LGR4-203ENST00000480977 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.76■■■■■ 4.28
LGR4-203ENST00000480977 WDR62O43379 1518 aa41.67■■■■■ 4.26
LGR4-203ENST00000480977 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.59■■■■■ 4.25
LGR4-203ENST00000480977 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
LGR4-203ENST00000480977 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.5■■■■■ 4.23
LGR4-203ENST00000480977 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
LGR4-203ENST00000480977 CFTRP13569 1480 aa41.41■■■■■ 4.22
LGR4-203ENST00000480977 PRDM2Q13029 1718 aa41.26■■■■■ 4.2
LGR4-203ENST00000480977 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
LGR4-203ENST00000480977 TRIM41Q8WV44 630 aa41.08■■■■■ 4.17
LGR4-203ENST00000480977 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.96■■■■■ 4.15
LGR4-203ENST00000480977 OSCARQ8IYS5 282 aa40.84■■■■■ 4.13
LGR4-203ENST00000480977 IFT140Q96RY7 1462 aa40.72■■■■■ 4.11
LGR4-203ENST00000480977 TOPBP1Q92547 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
LGR4-203ENST00000480977 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
LGR4-203ENST00000480977 ABCC8Q09428 1581 aa40.6■■■■■ 4.09
LGR4-203ENST00000480977 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.58■■■■■ 4.09
LGR4-203ENST00000480977 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
LGR4-203ENST00000480977 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.47■■■■■ 4.07
LGR4-203ENST00000480977 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.47■■■■■ 4.07
LGR4-203ENST00000480977 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.47■■■■■ 4.07
LGR4-203ENST00000480977 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
LGR4-203ENST00000480977 CHD1O14646 1710 aa40.33■■■■■ 4.05
LGR4-203ENST00000480977 ARHGEF11O15085 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
LGR4-203ENST00000480977 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.049e-8■■■■■ 30.5
LGR4-203ENST00000480977 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
LGR4-203ENST00000480977 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.12■■■■■ 4.01
LGR4-203ENST00000480977 FBLN2P98095 1184 aa40.06■■■■■ 4
LGR4-203ENST00000480977 SOGA1O94964 1423 aa40.06■■■■■ 4
LGR4-203ENST00000480977 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.02■■■■■ 4
LGR4-203ENST00000480977 WDR97A6NE52 1622 aa39.98■■■■□ 3.99
LGR4-203ENST00000480977 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
LGR4-203ENST00000480977 CUX1P39880 1505 aa39.96■■■■□ 3.99
LGR4-203ENST00000480977 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.92■■■■□ 3.98
LGR4-203ENST00000480977 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.91■■■■□ 3.98
LGR4-203ENST00000480977 ARAP1Q96P48 1450 aa39.85■■■■□ 3.97
LGR4-203ENST00000480977 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
LGR4-203ENST00000480977 PBRM1Q86U86 1689 aa39.76■■■■□ 3.96
LGR4-203ENST00000480977 GRIN2BQ13224 1484 aa39.75■■■■□ 3.95
LGR4-203ENST00000480977 SYNJ1O43426 1573 aa39.75■■■■□ 3.95
LGR4-203ENST00000480977 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.73■■■■□ 3.95
LGR4-203ENST00000480977 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
LGR4-203ENST00000480977 SYNJ2O15056 1496 aa39.64■■■■□ 3.94
LGR4-203ENST00000480977 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
LGR4-203ENST00000480977 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.6■■■■□ 3.93
LGR4-203ENST00000480977 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
LGR4-203ENST00000480977 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.55■■■■□ 3.92
LGR4-203ENST00000480977 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.53■■■■□ 3.92
LGR4-203ENST00000480977 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.36■■■■□ 3.89
LGR4-203ENST00000480977 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.33■■■■□ 3.89
LGR4-203ENST00000480977 TOP2BQ02880 1626 aa39.32■■■■□ 3.88
LGR4-203ENST00000480977 ADAMTS12P58397 1594 aa39.28■■■■□ 3.88
LGR4-203ENST00000480977 GRIN2AQ12879 1464 aa39.25■■■■□ 3.87
LGR4-203ENST00000480977 CEP170Q5SW79 1584 aa39.16■■■■□ 3.86
LGR4-203ENST00000480977 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.11■■■■□ 3.85
LGR4-203ENST00000480977 NUP160Q12769 1436 aa39.08■■■■□ 3.85
LGR4-203ENST00000480977 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.07■■■■□ 3.85
LGR4-203ENST00000480977 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
LGR4-203ENST00000480977 SHROOM2Q13796 1616 aa39■■■■□ 3.83
LGR4-203ENST00000480977 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
LGR4-203ENST00000480977 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.73■■■■□ 3.79
LGR4-203ENST00000480977 JPH4Q96JJ6 628 aa38.64■■■■□ 3.78
LGR4-203ENST00000480977 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.63■■■■□ 3.78
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