RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000164227.9

BCL3-201, Transcript of B cell CLL/lymphoma 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCL3, Length 2,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3-201ENST00000164227 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.48■■■■■ 6.47
BCL3-201ENST00000164227 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.42■■■■■ 5.18
BCL3-201ENST00000164227 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
BCL3-201ENST00000164227 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.71■■■■■ 5.07
BCL3-201ENST00000164227 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
BCL3-201ENST00000164227 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.81■■■■■ 4.92
BCL3-201ENST00000164227 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.31■■■■■ 4.84
BCL3-201ENST00000164227 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.88■■■■■ 4.78
BCL3-201ENST00000164227 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.65■■■■■ 4.74
BCL3-201ENST00000164227 ABCC9O60706 1549 aa44.34■■■■■ 4.69
BCL3-201ENST00000164227 SCRIBQ14160 1630 aa44■■■■■ 4.63
BCL3-201ENST00000164227 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
BCL3-201ENST00000164227 NACADO15069 1562 aa43.74■■■■■ 4.59
BCL3-201ENST00000164227 HRCP23327 699 aa43.58■■■■■ 4.57
BCL3-201ENST00000164227 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.48■■■■■ 4.55
BCL3-201ENST00000164227 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.29■■■■■ 4.52
BCL3-201ENST00000164227 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.29■■■■■ 4.52
BCL3-201ENST00000164227 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.03■■■■■ 4.48
BCL3-201ENST00000164227 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.99■■■■■ 4.47
BCL3-201ENST00000164227 TRIM41Q8WV44 630 aa42.92■■■■■ 4.46
BCL3-201ENST00000164227 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
BCL3-201ENST00000164227 WIZO95785 1651 aa42.76■■■■■ 4.44
BCL3-201ENST00000164227 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
BCL3-201ENST00000164227 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
BCL3-201ENST00000164227 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
BCL3-201ENST00000164227 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
BCL3-201ENST00000164227 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
BCL3-201ENST00000164227 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.27■■■■■ 4.36
BCL3-201ENST00000164227 SMARCA4P51532 1647 aa42.26■■■■■ 4.36
BCL3-201ENST00000164227 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
BCL3-201ENST00000164227 SMARCA2P51531 1590 aa41.98■■■■■ 4.31
BCL3-201ENST00000164227 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.94■■■■■ 4.3
BCL3-201ENST00000164227 ABCC8Q09428 1581 aa41.7■■■■■ 4.27
BCL3-201ENST00000164227 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.7■■■■■ 4.27
BCL3-201ENST00000164227 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.64■■■■■ 4.26
BCL3-201ENST00000164227 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.63■■■■■ 4.25
BCL3-201ENST00000164227 EEA1Q15075 1411 aa41.51■■■■■ 4.24
BCL3-201ENST00000164227 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
BCL3-201ENST00000164227 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.31■■■■■ 4.2
BCL3-201ENST00000164227 SOGA1O94964 1423 aa41.31■■■■■ 4.2
BCL3-201ENST00000164227 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.27■■■■■ 4.2
BCL3-201ENST00000164227 CEP162Q5TB80 1403 aa41.24■■■■■ 4.19
BCL3-201ENST00000164227 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.17■■■■■ 4.18
BCL3-201ENST00000164227 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.1■■■■■ 4.17
BCL3-201ENST00000164227 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.07■■■■■ 4.16
BCL3-201ENST00000164227 GOLGA3Q08378 1498 aa41.06■■■■■ 4.16
BCL3-201ENST00000164227 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
BCL3-201ENST00000164227 SYNJ1O43426 1573 aa40.94■■■■■ 4.14
BCL3-201ENST00000164227 KIF21BO75037 1637 aa40.9■■■■■ 4.14
BCL3-201ENST00000164227 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.85■■■■■ 4.13
BCL3-201ENST00000164227 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
BCL3-201ENST00000164227 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
BCL3-201ENST00000164227 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.11
BCL3-201ENST00000164227 TOP2BQ02880 1626 aa40.59■■■■■ 4.09
BCL3-201ENST00000164227 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.54■■■■■ 4.08
BCL3-201ENST00000164227 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.51■■■■■ 4.08
BCL3-201ENST00000164227 HMGXB3Q12766 1538 aa40.48■■■■■ 4.07
BCL3-201ENST00000164227 CLIP1P30622 1438 aa40.48■■■■■ 4.07
BCL3-201ENST00000164227 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.4■■■■■ 4.06
BCL3-201ENST00000164227 NCAPD3P42695 1498 aa40.39■■■■■ 4.06
BCL3-201ENST00000164227 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
BCL3-201ENST00000164227 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.36■■■■■ 4.05
BCL3-201ENST00000164227 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.27■■■■■ 4.04
BCL3-201ENST00000164227 PRXQ9BXM0 1461 aa40.16■■■■■ 4.02
BCL3-201ENST00000164227 CUX1P39880 1505 aa40.06■■■■■ 4
BCL3-201ENST00000164227 CFTRP13569 1480 aa40.04■■■■■ 4
BCL3-201ENST00000164227 APLP2Q06481 763 aa40.03■■■■■ 4
BCL3-201ENST00000164227 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
BCL3-201ENST00000164227 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
BCL3-201ENST00000164227 PRDM2Q13029 1718 aa39.95■■■■□ 3.99
BCL3-201ENST00000164227 KIF27Q86VH2 1401 aa39.92■■■■□ 3.98
BCL3-201ENST00000164227 ARAP1Q96P48 1450 aa39.87■■■■□ 3.97
BCL3-201ENST00000164227 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
BCL3-201ENST00000164227 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
BCL3-201ENST00000164227 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
BCL3-201ENST00000164227 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
BCL3-201ENST00000164227 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
BCL3-201ENST00000164227 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.59■■■■□ 3.93
BCL3-201ENST00000164227 NEUROD1Q13562 356 aa39.57■■■■□ 3.92
BCL3-201ENST00000164227 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
BCL3-201ENST00000164227 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
BCL3-201ENST00000164227 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.52■■■■□ 3.92
BCL3-201ENST00000164227 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.51■■■■□ 3.92
BCL3-201ENST00000164227 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
BCL3-201ENST00000164227 CUX2O14529 1486 aa39.42■■■■□ 3.9
BCL3-201ENST00000164227 IGF1RP08069 1367 aa39.41■■■■□ 3.9
BCL3-201ENST00000164227 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
BCL3-201ENST00000164227 MAP3K1Q13233 1512 aa39.35■■■■□ 3.89
BCL3-201ENST00000164227 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.31■■■■□ 3.88
BCL3-201ENST00000164227 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.24■■■■□ 3.87
BCL3-201ENST00000164227 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.23■■■■□ 3.87
BCL3-201ENST00000164227 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.21■■■■□ 3.87
BCL3-201ENST00000164227 TIAM1Q13009 1591 aa39.18■■■■□ 3.86
BCL3-201ENST00000164227 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa39.16■■■■□ 3.86
BCL3-201ENST00000164227 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.1■■■■□ 3.85
BCL3-201ENST00000164227 MIER1Q8N108 512 aa39.09■■■■□ 3.85
BCL3-201ENST00000164227 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.07■■■■□ 3.85
BCL3-201ENST00000164227 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.02■■■■□ 3.84
BCL3-201ENST00000164227 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.99■■■■□ 3.83
BCL3-201ENST00000164227 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.99■■■■□ 3.83
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