Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKD2L1Q9P0L9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKD2L1Q9P0L9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKD2L1Q9P0L9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms