Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PKD2L1Q9P0L9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PKD2L1Q9P0L9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PKD2L1Q9P0L9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PKD2L1Q9P0L9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PKD2L1Q9P0L9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PKD2L1Q9P0L9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PKD2L1Q9P0L9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PKD2L1Q9P0L9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PKD2L1Q9P0L9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PKD2L1Q9P0L9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PKD2L1Q9P0L9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PKD2L1Q9P0L9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PKD2L1Q9P0L9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PKD2L1Q9P0L9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PKD2L1Q9P0L9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
PKD2L1Q9P0L9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PKD2L1Q9P0L9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PKD2L1Q9P0L9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PKD2L1Q9P0L9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PKD2L1Q9P0L9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PKD2L1Q9P0L9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PKD2L1Q9P0L9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2L1Q9P0L9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2L1Q9P0L9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PKD2L1Q9P0L9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PKD2L1Q9P0L9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PKD2L1Q9P0L9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PKD2L1Q9P0L9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PKD2L1Q9P0L9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PKD2L1Q9P0L9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PKD2L1Q9P0L9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PKD2L1Q9P0L9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PKD2L1Q9P0L9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PKD2L1Q9P0L9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PKD2L1Q9P0L9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PKD2L1Q9P0L9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PKD2L1Q9P0L9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PKD2L1Q9P0L9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PKD2L1Q9P0L9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PKD2L1Q9P0L9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PKD2L1Q9P0L9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PKD2L1Q9P0L9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PKD2L1Q9P0L9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PKD2L1Q9P0L9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PKD2L1Q9P0L9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PKD2L1Q9P0L9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PKD2L1Q9P0L9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PKD2L1Q9P0L9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PKD2L1Q9P0L9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PKD2L1Q9P0L9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PKD2L1Q9P0L9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PKD2L1Q9P0L9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PKD2L1Q9P0L9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PKD2L1Q9P0L9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PKD2L1Q9P0L9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PKD2L1Q9P0L9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PKD2L1Q9P0L9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PKD2L1Q9P0L9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PKD2L1Q9P0L9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PKD2L1Q9P0L9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PKD2L1Q9P0L9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PKD2L1Q9P0L9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PKD2L1Q9P0L9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PKD2L1Q9P0L9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PKD2L1Q9P0L9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PKD2L1Q9P0L9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PKD2L1Q9P0L9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PKD2L1Q9P0L9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PKD2L1Q9P0L9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PKD2L1Q9P0L9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PKD2L1Q9P0L9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PKD2L1Q9P0L9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2L1Q9P0L9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2L1Q9P0L9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PKD2L1Q9P0L9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2L1Q9P0L9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PKD2L1Q9P0L9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PKD2L1Q9P0L9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2L1Q9P0L9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PKD2L1Q9P0L9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2L1Q9P0L9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2L1Q9P0L9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PKD2L1Q9P0L9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PKD2L1Q9P0L9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2L1Q9P0L9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PKD2L1Q9P0L9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PKD2L1Q9P0L9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms