Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KLHDC4Q8TBB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KLHDC4Q8TBB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms