Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MDC1-206ENST00000489540 1402 ntTSL 220.71■□□□□ 0.913e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.772e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.723e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-209ENST00000563969 6949 ntTSL 219.15■□□□□ 0.663e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.633e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 NAA10-212ENST00000477882 809 ntTSL 217.91■□□□□ 0.463e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-207ENST00000562289 1298 ntTSL 216.89■□□□□ 0.293e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-212ENST00000567136 698 ntTSL 315.4■□□□□ 0.063e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-203ENST00000393966 2182 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.043e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.083e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 AC020915.6-202ENST00000637310 1463 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.34□□□□□ -0.113e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-202ENST00000301781 1712 ntTSL 514.08□□□□□ -0.162e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.162e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 POP5-208ENST00000542776 821 ntTSL 211.76□□□□□ -0.533e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.593e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.923e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZNF544-207ENST00000596677 4109 ntTSL 57.86□□□□□ -1.153e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.153e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CFDP1-209ENST00000570103 663 ntTSL 26.3□□□□□ -1.43e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 POP5-207ENST00000542568 578 nt6.26□□□□□ -1.413e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-11■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 NDUFAF8-202ENST00000573090 741 ntTSL 326.84■■□□□ 1.898e-12■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.788e-12■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.681e-26■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 COX4I1-211ENST00000566405 490 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-26■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 HERC2-208ENST00000566635 2114 ntTSL 1 (best)19.96■□□□□ 0.799e-11■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 324.19■■□□□ 1.461e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.722e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.661e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 220.84■□□□□ 0.933e-30■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-30■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 29.5□□□□□ -0.893e-30■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.973e-30■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 39e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.299e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.7■□□□□ 0.99e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MZT2B-204ENST00000455239 401 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.62■□□□□ 0.899e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.81■□□□□ 0.289e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 AP2S1-205ENST00000597421 554 ntTSL 226.13■■□□□ 1.772e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.464e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 520.59■□□□□ 0.894e-9■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 PRELID1-206ENST00000510701 435 ntTSL 24.75□□□□□ -1.657e-16■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 YIF1A-213ENST00000534374 540 ntTSL 228.2■■■□□ 2.12e-6■■■□□ 15.8
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PABPC4Q13310 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-36■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 ZFC3H1-209ENST00000550963 845 ntTSL 57.58□□□□□ -1.23e-36■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 SPN-204ENST00000561857 2077 nt11.82□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 329.55■■■□□ 2.321e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 223.62■■□□□ 1.371e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.645e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 29.98□□□□□ -0.815e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EIF4A3-206ENST00000575978 3593 ntTSL 29.1□□□□□ -0.955e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 25.93□□□□□ -1.465e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 SNF8-212ENST00000514089 571 ntTSL 517.22■□□□□ 0.352e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 SNF8-206ENST00000509989 677 ntTSL 316.13■□□□□ 0.172e-8■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.781e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RPL35A-208ENST00000485439 677 ntTSL 29.44□□□□□ -0.91e-39■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 RPL35A-201ENST00000329092 456 ntTSL 37.03□□□□□ -1.281e-39■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CORO1B-205ENST00000539724 615 ntTSL 320.13■□□□□ 0.814e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.64e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.884e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 524.22■■□□□ 1.474e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 520.87■□□□□ 0.934e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 514.72□□□□□ -0.054e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■■■□□ 15.8
PABPC4Q13310 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.031e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SUMO2-202ENST00000420826 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.777e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.279e-13■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 SNHG25-201ENST00000580828 106 ntTSL 214.69□□□□□ -0.069e-13■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.157e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.867e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-205ENST00000467213 2782 ntTSL 1 (best)16.69■□□□□ 0.267e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-208ENST00000488864 2415 ntTSL 214.86□□□□□ -0.037e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.147e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 CHD1L-210ENST00000622533 2937 ntTSL 514.01□□□□□ -0.177e-9■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.63e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 315.04■□□□□ -08e-7■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 PSMD13-213ENST00000533717 670 ntTSL 218.62■□□□□ 0.576e-20■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TTC1-202ENST00000518560 543 ntTSL 511.65□□□□□ -0.542e-14■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TTC1-205ENST00000522793 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-14■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.662e-14■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TTC1-204ENST00000522073 1119 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-14■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 TTC1-203ENST00000520274 726 ntTSL 37.82□□□□□ -1.162e-14■■■□□ 15.7
PABPC4Q13310 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.671e-11■■■□□ 15.7
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