RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341039.6

POP5-201, Transcript of POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POP5, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP5-201ENST00000341039 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.6■■■□□ 2.65
POP5-201ENST00000341039 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.4■■■□□ 2.14
POP5-201ENST00000341039 ABCC9O60706 1549 aa28.17■■■□□ 2.1
POP5-201ENST00000341039 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.91■■□□□ 1.9
POP5-201ENST00000341039 NACADO15069 1562 aa26.73■■□□□ 1.87
POP5-201ENST00000341039 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.53■■□□□ 1.84
POP5-201ENST00000341039 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.42■■□□□ 1.82
POP5-201ENST00000341039 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.38■■□□□ 1.81
POP5-201ENST00000341039 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
POP5-201ENST00000341039 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
POP5-201ENST00000341039 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.17■■□□□ 1.78
POP5-201ENST00000341039 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.12■■□□□ 1.77
POP5-201ENST00000341039 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.11■■□□□ 1.77
POP5-201ENST00000341039 SCRIBQ14160 1630 aa25.88■■□□□ 1.73
POP5-201ENST00000341039 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.76■■□□□ 1.71
POP5-201ENST00000341039 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.49■■□□□ 1.67
POP5-201ENST00000341039 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
POP5-201ENST00000341039 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.34■■□□□ 1.65
POP5-201ENST00000341039 SMARCA4P51532 1647 aa24.69■■□□□ 1.54
POP5-201ENST00000341039 NCAPD3P42695 1498 aa24.61■■□□□ 1.53
POP5-201ENST00000341039 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.59■■□□□ 1.53
POP5-201ENST00000341039 SMARCA2P51531 1590 aa24.58■■□□□ 1.52
POP5-201ENST00000341039 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
POP5-201ENST00000341039 HMGXB3Q12766 1538 aa24.54■■□□□ 1.52
POP5-201ENST00000341039 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.42■■□□□ 1.5
POP5-201ENST00000341039 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
POP5-201ENST00000341039 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.37■■□□□ 1.49
POP5-201ENST00000341039 ERCC6Q03468 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
POP5-201ENST00000341039 NESP48681 1621 aa24.24■■□□□ 1.47
POP5-201ENST00000341039 CUX2O14529 1486 aa24.2■■□□□ 1.47
POP5-201ENST00000341039 WIZO95785 1651 aa24.14■■□□□ 1.45
POP5-201ENST00000341039 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.12■■□□□ 1.45
POP5-201ENST00000341039 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.05■■□□□ 1.44
POP5-201ENST00000341039 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
POP5-201ENST00000341039 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.91■■□□□ 1.42
POP5-201ENST00000341039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.91■■□□□ 1.42
POP5-201ENST00000341039 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
POP5-201ENST00000341039 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.86■■□□□ 1.41
POP5-201ENST00000341039 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
POP5-201ENST00000341039 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.75■■□□□ 1.39
POP5-201ENST00000341039 WDR62O43379 1518 aa23.7■■□□□ 1.38
POP5-201ENST00000341039 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.68■■□□□ 1.38
POP5-201ENST00000341039 CFTRP13569 1480 aa23.66■■□□□ 1.38
POP5-201ENST00000341039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.65■■□□□ 1.38
POP5-201ENST00000341039 PRDM2Q13029 1718 aa23.64■■□□□ 1.37
POP5-201ENST00000341039 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.49■■□□□ 1.35
POP5-201ENST00000341039 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
POP5-201ENST00000341039 TOPBP1Q92547 1522 aa23.23■■□□□ 1.31
POP5-201ENST00000341039 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.19■■□□□ 1.3
POP5-201ENST00000341039 IFT140Q96RY7 1462 aa23.17■■□□□ 1.3
POP5-201ENST00000341039 ABCC8Q09428 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
POP5-201ENST00000341039 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
POP5-201ENST00000341039 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
POP5-201ENST00000341039 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
POP5-201ENST00000341039 OSCARQ8IYS5 282 aa23.03■■□□□ 1.28
POP5-201ENST00000341039 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
POP5-201ENST00000341039 TRIM41Q8WV44 630 aa22.99■■□□□ 1.27
POP5-201ENST00000341039 CHD1O14646 1710 aa22.95■■□□□ 1.26
POP5-201ENST00000341039 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
POP5-201ENST00000341039 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
POP5-201ENST00000341039 CUX1P39880 1505 aa22.9■■□□□ 1.26
POP5-201ENST00000341039 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.9■■□□□ 1.26
POP5-201ENST00000341039 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.9■■□□□ 1.26
POP5-201ENST00000341039 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.87■■□□□ 1.25
POP5-201ENST00000341039 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.87■■□□□ 1.25
POP5-201ENST00000341039 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.87■■□□□ 1.25
POP5-201ENST00000341039 SOGA1O94964 1423 aa22.84■■□□□ 1.25
POP5-201ENST00000341039 WDR97A6NE52 1622 aa22.82■■□□□ 1.24
POP5-201ENST00000341039 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
POP5-201ENST00000341039 ARHGEF11O15085 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
POP5-201ENST00000341039 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.73■■□□□ 1.23
POP5-201ENST00000341039 PBRM1Q86U86 1689 aa22.73■■□□□ 1.23
POP5-201ENST00000341039 FBLN2P98095 1184 aa22.71■■□□□ 1.23
POP5-201ENST00000341039 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
POP5-201ENST00000341039 GRIN2BQ13224 1484 aa22.66■■□□□ 1.22
POP5-201ENST00000341039 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.64■■□□□ 1.22
POP5-201ENST00000341039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.63■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.62■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.61■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 SYNJ1O43426 1573 aa22.61■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.6■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 TOP2BQ02880 1626 aa22.6■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 SYNJ2O15056 1496 aa22.59■■□□□ 1.21
POP5-201ENST00000341039 ARAP1Q96P48 1450 aa22.55■■□□□ 1.2
POP5-201ENST00000341039 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
POP5-201ENST00000341039 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
POP5-201ENST00000341039 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.5■■□□□ 1.19
POP5-201ENST00000341039 ADAMTS12P58397 1594 aa22.46■■□□□ 1.19
POP5-201ENST00000341039 GRIN2AQ12879 1464 aa22.41■■□□□ 1.18
POP5-201ENST00000341039 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.36■■□□□ 1.17
POP5-201ENST00000341039 CEP170Q5SW79 1584 aa22.35■■□□□ 1.17
POP5-201ENST00000341039 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.31■■□□□ 1.16
POP5-201ENST00000341039 NUP160Q12769 1436 aa22.29■■□□□ 1.16
POP5-201ENST00000341039 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.26■■□□□ 1.15
POP5-201ENST00000341039 SHROOM2Q13796 1616 aa22.25■■□□□ 1.15
POP5-201ENST00000341039 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
POP5-201ENST00000341039 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.16■■□□□ 1.14
POP5-201ENST00000341039 CUL7Q14999 1698 aa22.13■■□□□ 1.13
POP5-201ENST00000341039 KIF27Q86VH2 1401 aa22.09■■□□□ 1.13
POP5-201ENST00000341039 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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