Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP12-210ENST00000497103 732 ntTSL 34.26□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 512.41□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 55.72□□□□□ -1.493e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.172e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 PRPF39-212ENST00000557477 724 ntTSL 52.69□□□□□ -1.981e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.457e-10■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.487e-10■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NFX1-202ENST00000379521 3609 ntTSL 1 (best)5.04□□□□□ -1.67e-10■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.46e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.526e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.566e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.636e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.676e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 59.29□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 519.78■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 STT3A-202ENST00000524639 582 ntTSL 25.8□□□□□ -1.482e-25■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NDUFAF5-214ENST00000485738 718 ntTSL 513.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.796e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 PSMC1-202ENST00000543772 1389 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF721-202ENST00000505900 664 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.456e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NAA10-207ENST00000460996 908 ntTSL 215.29■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 PTPN4-205ENST00000433888 954 ntTSL 30.02□□□□□ -2.412e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 34.53□□□□□ -1.682e-11■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 KDM3A-208ENST00000463013 577 ntTSL 30.25□□□□□ -2.374e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-213ENST00000440873 1107 ntTSL 516.57■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-214ENST00000450708 922 ntTSL 515.27■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-210ENST00000413626 870 ntTSL 314.49□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-212ENST00000429702 944 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 MEN1-211ENST00000424912 816 ntTSL 1 (best)11.88□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 32.1
PRPF8Q6P2Q9 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 PCM1-207ENST00000518762 546 ntTSL 42.82□□□□□ -1.966e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 214.76□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 310.2□□□□□ -0.781e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 48.95□□□□□ -0.981e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 47.56□□□□□ -1.21e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 35.37□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 AC022400.5-201ENST00000415917 1031 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -11e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 AC022400.5-202ENST00000580623 560 ntTSL 27.26□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 XPO1-209ENST00000443240 565 ntTSL 42.25□□□□□ -2.052e-9■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-218ENST00000584669 580 ntTSL 417.71■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 TOP3A-202ENST00000461127 823 ntTSL 315.54■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.065e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-207ENST00000468267 800 ntTSL 214.73□□□□□ -0.055e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.275e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-206ENST00000467681 630 ntTSL 211.52□□□□□ -0.575e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-203ENST00000463093 600 ntTSL 511.52□□□□□ -0.575e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-202ENST00000461433 1694 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.915e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 STIL-202ENST00000360380 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-212ENST00000489378 1434 ntTSL 28.57□□□□□ -1.045e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 RUFY2-213ENST00000602465 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-208ENST00000469123 662 ntTSL 57.29□□□□□ -1.245e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 STIL-209ENST00000447475 2984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 RUFY2-208ENST00000466493 2110 ntTSL 1 (best)6.68□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.555e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-213ENST00000496622 2620 ntTSL 1 (best)4.96□□□□□ -1.625e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SSBP1-204ENST00000465167 517 ntTSL 54.92□□□□□ -1.625e-19■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 NUP37-204ENST00000547269 798 ntTSL 23.52□□□□□ -1.858e-8■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 LIG1-215ENST00000597901 565 ntTSL 412.72□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 IPO13-202ENST00000372343 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 ATAD3A-205ENST00000429957 498 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 ACSL3-210ENST00000540115 624 ntTSL 38.47□□□□□ -1.051e-10■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 NFYC-209ENST00000424419 1276 ntTSL 218■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-13■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-13■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-207ENST00000527133 667 ntTSL 311.65□□□□□ -0.543e-13■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-13■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-13■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.072e-13■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 PABPC4-224ENST00000530186 352 ntTSL 26.51□□□□□ -1.371e-10■■■■■ 32
PRPF8Q6P2Q9 SF1-217ENST00000486960 719 ntTSL 24.86□□□□□ -1.634e-8■■■■■ 32
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 522.1 ms