Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.395e-11■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 DDX39A-215ENST00000590696 563 ntTSL 418.75■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 DDX39A-216ENST00000591275 484 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 SMC6-206ENST00000446852 2460 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PPID-203ENST00000512699 594 ntTSL 30.93□□□□□ -2.263e-19■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.158e-11■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PPTC7-202ENST00000548721 1471 ntTSL 27.48□□□□□ -1.218e-11■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.164e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 PITPNB-209ENST00000477861 786 ntTSL 54.64□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 WDR34-204ENST00000473486 714 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KDM4C-209ENST00000489243 1439 ntTSL 25□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 DPF2-207ENST00000530993 624 ntTSL 59□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 DPF2-210ENST00000532102 524 ntTSL 47.69□□□□□ -1.184e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 DPF2-211ENST00000532264 726 ntTSL 55.44□□□□□ -1.544e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 57.81□□□□□ -1.162e-10■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-202ENST00000440541 2493 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-205ENST00000537165 2940 ntTSL 211.46□□□□□ -0.571e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-213ENST00000542262 554 ntTSL 48.77□□□□□ -11e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-204ENST00000535747 735 ntTSL 28.36□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 ACP1-213ENST00000484464 573 ntTSL 47.45□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-214ENST00000542858 564 ntTSL 37.36□□□□□ -1.231e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-207ENST00000538377 708 ntTSL 26.28□□□□□ -1.41e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 KCTD10-212ENST00000541077 538 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-9■■■■■ 33.6
PRPF8Q6P2Q9 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 ATG16L1-212ENST00000472242 911 ntTSL 49.42□□□□□ -0.98e-11■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-204ENST00000504821 544 ntTSL 522.09■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-203ENST00000503849 582 ntTSL 218.13■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-207ENST00000614830 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-202ENST00000502663 551 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOP16-208ENST00000616685 472 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 B4GALT2-205ENST00000481924 1004 ntTSL 28.92□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.717e-10■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 EIF4B-210ENST00000550704 1476 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SEC22A-208ENST00000487572 870 ntTSL 316.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NIT2-202ENST00000460317 648 ntTSL 315.76■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 215.63■□□□□ 0.097e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-205ENST00000417413 1613 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 07e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 STAT1-210ENST00000454414 572 ntTSL 414.57□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.097e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.127e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 STAT1-207ENST00000424722 736 ntTSL 314.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 314.02□□□□□ -0.167e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.257e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.487e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-203ENST00000378809 2008 ntTSL 511.43□□□□□ -0.587e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SPAG9-206ENST00000506483 848 ntTSL 311.06□□□□□ -0.647e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.647e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-216ENST00000552199 1905 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.687e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.797e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RBFOX2-214ENST00000495377 733 ntTSL 510.02□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-203ENST00000369318 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 TGS1-201ENST00000260129 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.857e-10■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 DYNC2LI1-205ENST00000462426 713 ntTSL 38.98□□□□□ -0.977e-9■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-204ENST00000369321 2620 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-202ENST00000369315 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-211ENST00000621345 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.091e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SEC22A-210ENST00000492595 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF20B-203ENST00000447580 660 ntTSL 57.9□□□□□ -1.142e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-205ENST00000369331 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 TGS1-203ENST00000523948 3159 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.197e-10■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 CASP7-212ENST00000621607 2378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-218ENST00000553099 2674 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.267e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 26.82□□□□□ -1.322e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.377e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 TAOK1-203ENST00000577583 5557 ntTSL 26.18□□□□□ -1.425e-8■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 NOL9-204ENST00000464383 835 ntTSL 55.22□□□□□ -1.574e-11■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 PKD2-203ENST00000506367 693 ntTSL 34.45□□□□□ -1.77e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RPL22L1-205ENST00000478578 900 ntTSL 24.11□□□□□ -1.753e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 GSAP-210ENST00000474686 825 ntTSL 23.2□□□□□ -1.97e-9■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.951e-11■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.961e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SEC22A-204ENST00000473494 1011 ntTSL 32.72□□□□□ -1.971e-6■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 GSAP-211ENST00000482866 3458 ntTSL 22.67□□□□□ -1.987e-9■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-213ENST00000550647 742 ntTSL 32.55□□□□□ -27e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 LBR-208ENST00000488632 425 ntTSL 32.01□□□□□ -2.097e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 SNX14-211ENST00000506182 885 ntTSL 41.87□□□□□ -2.114e-11■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-209ENST00000547055 438 ntTSL 31.37□□□□□ -2.197e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RAB3IP-210ENST00000547591 695 ntTSL 51.17□□□□□ -2.227e-17■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 MTF2-209ENST00000487263 863 ntTSL 31□□□□□ -2.259e-11■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 USP15-213ENST00000549268 1087 ntTSL 50.99□□□□□ -2.253e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -22e-7■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RPL30-203ENST00000517489 631 ntTSL 212.77□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 33.5
PRPF8Q6P2Q9 RPL30-206ENST00000518850 614 ntTSL 212.66□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 33.5
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 759.8 ms