RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473486.1

WDR34-204, Transcript of WD repeat domain 34, humanhuman

TSL 2

Gene WDR34, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR34-204ENST00000473486 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.18■■■■■ 7.7
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WDR34-204ENST00000473486 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.65■■■■■ 6.66
WDR34-204ENST00000473486 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.95■■■■■ 6.23
WDR34-204ENST00000473486 NACADO15069 1562 aa53.58■■■■■ 6.17
WDR34-204ENST00000473486 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.38■■■■■ 6.14
WDR34-204ENST00000473486 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.15■■■■■ 6.1
WDR34-204ENST00000473486 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.85■■■■■ 6.05
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WDR34-204ENST00000473486 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.66■■■■■ 6.02
WDR34-204ENST00000473486 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.37■■■■■ 5.97
WDR34-204ENST00000473486 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.35■■■■■ 5.97
WDR34-204ENST00000473486 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.18■■■■■ 5.94
WDR34-204ENST00000473486 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.68■■■■■ 5.86
WDR34-204ENST00000473486 SCRIBQ14160 1630 aa51.67■■■■■ 5.86
WDR34-204ENST00000473486 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.19■■■■■ 5.78
WDR34-204ENST00000473486 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.09■■■■■ 5.77
WDR34-204ENST00000473486 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.08■■■■■ 5.77
WDR34-204ENST00000473486 NCAPD3P42695 1498 aa49.48■■■■■ 5.51
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WDR34-204ENST00000473486 SMARCA4P51532 1647 aa49.27■■■■■ 5.48
WDR34-204ENST00000473486 SMARCA2P51531 1590 aa49.19■■■■■ 5.47
WDR34-204ENST00000473486 HMGXB3Q12766 1538 aa49.1■■■■■ 5.45
WDR34-204ENST00000473486 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.04■■■■■ 5.44
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WDR34-204ENST00000473486 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
WDR34-204ENST00000473486 CUX2O14529 1486 aa48.85■■■■■ 5.41
WDR34-204ENST00000473486 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.81■■■■■ 5.4
WDR34-204ENST00000473486 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.78■■■■■ 5.4
WDR34-204ENST00000473486 NESP48681 1621 aa48.69■■■■■ 5.39
WDR34-204ENST00000473486 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.68■■■■■ 5.38
WDR34-204ENST00000473486 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.34■■■■■ 5.33
WDR34-204ENST00000473486 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
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WDR34-204ENST00000473486 WIZO95785 1651 aa48.08■■■■■ 5.29
WDR34-204ENST00000473486 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.03■■■■■ 5.28
WDR34-204ENST00000473486 CADPSQ9ULU8 1353 aa48■■■■■ 5.27
WDR34-204ENST00000473486 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.69■■■■■ 5.22
WDR34-204ENST00000473486 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.68■■■■■ 5.22
WDR34-204ENST00000473486 WDR62O43379 1518 aa47.55■■■■■ 5.2
WDR34-204ENST00000473486 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.5■■■■■ 5.19
WDR34-204ENST00000473486 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
WDR34-204ENST00000473486 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.45■■■■■ 5.19
WDR34-204ENST00000473486 CFTRP13569 1480 aa47.44■■■■■ 5.18
WDR34-204ENST00000473486 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
WDR34-204ENST00000473486 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.97■■■■■ 5.11
WDR34-204ENST00000473486 PRDM2Q13029 1718 aa46.89■■■■■ 5.1
WDR34-204ENST00000473486 TRIM41Q8WV44 630 aa46.72■■■■■ 5.07
WDR34-204ENST00000473486 OSCARQ8IYS5 282 aa46.64■■■■■ 5.06
WDR34-204ENST00000473486 IFT140Q96RY7 1462 aa46.55■■■■■ 5.04
WDR34-204ENST00000473486 TOPBP1Q92547 1522 aa46.54■■■■■ 5.04
WDR34-204ENST00000473486 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
WDR34-204ENST00000473486 ABCC8Q09428 1581 aa46.44■■■■■ 5.03
WDR34-204ENST00000473486 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.36■■■■■ 5.01
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WDR34-204ENST00000473486 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.99■■■■■ 4.95
WDR34-204ENST00000473486 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.91■■■■■ 4.94
WDR34-204ENST00000473486 ARHGEF11O15085 1522 aa45.87■■■■■ 4.93
WDR34-204ENST00000473486 SOGA1O94964 1423 aa45.87■■■■■ 4.93
WDR34-204ENST00000473486 CHD1O14646 1710 aa45.82■■■■■ 4.93
WDR34-204ENST00000473486 FBLN2P98095 1184 aa45.79■■■■■ 4.92
WDR34-204ENST00000473486 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
WDR34-204ENST00000473486 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.79■■■■■ 4.92
WDR34-204ENST00000473486 CUX1P39880 1505 aa45.74■■■■■ 4.91
WDR34-204ENST00000473486 WDR97A6NE52 1622 aa45.64■■■■■ 4.9
WDR34-204ENST00000473486 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
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WDR34-204ENST00000473486 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.57■■■■■ 4.89
WDR34-204ENST00000473486 GRIN2BQ13224 1484 aa45.48■■■■■ 4.87
WDR34-204ENST00000473486 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.47■■■■■ 4.87
WDR34-204ENST00000473486 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
WDR34-204ENST00000473486 ARAP1Q96P48 1450 aa45.43■■■■■ 4.86
WDR34-204ENST00000473486 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.32■■■■■ 4.85
WDR34-204ENST00000473486 SYNJ2O15056 1496 aa45.32■■■■■ 4.85
WDR34-204ENST00000473486 SYNJ1O43426 1573 aa45.32■■■■■ 4.85
WDR34-204ENST00000473486 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.31■■■■■ 4.84
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WDR34-204ENST00000473486 PBRM1Q86U86 1689 aa45.24■■■■■ 4.83
WDR34-204ENST00000473486 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.18■■■■■ 4.82
WDR34-204ENST00000473486 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.11■■■■■ 4.81
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WDR34-204ENST00000473486 TOP2BQ02880 1626 aa45■■■■■ 4.79
WDR34-204ENST00000473486 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.98■■■■■ 4.79
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WDR34-204ENST00000473486 NUP160Q12769 1436 aa44.73■■■■■ 4.75
WDR34-204ENST00000473486 CEP170Q5SW79 1584 aa44.71■■■■■ 4.75
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WDR34-204ENST00000473486 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.63■■■■■ 4.73
WDR34-204ENST00000473486 SHROOM2Q13796 1616 aa44.5■■■■■ 4.71
WDR34-204ENST00000473486 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.68
WDR34-204ENST00000473486 JPH4Q96JJ6 628 aa44.29■■■■■ 4.68
WDR34-204ENST00000473486 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.21■■■■■ 4.67
WDR34-204ENST00000473486 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
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