Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9T2

NKAPP1, Putative uncharacterized protein CXorf42, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAPP1Q8N9T2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NKAPP1Q8N9T2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NKAPP1Q8N9T2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NKAPP1Q8N9T2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms