RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.62■■■■□ 3.45
DTX4-201ENST00000227451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.42■■■■□ 3.26
DTX4-201ENST00000227451 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
DTX4-201ENST00000227451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.86■■■■□ 3.01
DTX4-201ENST00000227451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.99■■■□□ 2.87
DTX4-201ENST00000227451 APLP2Q06481 763 aa32.82■■■□□ 2.84
DTX4-201ENST00000227451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
DTX4-201ENST00000227451 TRIM41Q8WV44 630 aa31.95■■■□□ 2.71
DTX4-201ENST00000227451 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
DTX4-201ENST00000227451 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
DTX4-201ENST00000227451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.69
DTX4-201ENST00000227451 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
DTX4-201ENST00000227451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
DTX4-201ENST00000227451 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.4■■■□□ 2.62
DTX4-201ENST00000227451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
DTX4-201ENST00000227451 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
DTX4-201ENST00000227451 ABCC9O60706 1549 aa30.83■■■□□ 2.53
DTX4-201ENST00000227451 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
DTX4-201ENST00000227451 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
DTX4-201ENST00000227451 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
DTX4-201ENST00000227451 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.76■■■□□ 2.51
DTX4-201ENST00000227451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.56■■■□□ 2.48
DTX4-201ENST00000227451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
DTX4-201ENST00000227451 ITGAEP38570 1179 aa30.4■■■□□ 2.46
DTX4-201ENST00000227451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
DTX4-201ENST00000227451 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.35■■■□□ 2.45
DTX4-201ENST00000227451 NEFLP07196 543 aa30.33■■■□□ 2.45
DTX4-201ENST00000227451 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.27■■■□□ 2.44
DTX4-201ENST00000227451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.11■■■□□ 2.41
DTX4-201ENST00000227451 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.07■■■□□ 2.4
DTX4-201ENST00000227451 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
DTX4-201ENST00000227451 FBLN2P98095 1184 aa29.82■■■□□ 2.37
DTX4-201ENST00000227451 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
DTX4-201ENST00000227451 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
DTX4-201ENST00000227451 TRIM52Q96A61 297 aa29.67■■■□□ 2.34
DTX4-201ENST00000227451 HRCP23327 699 aa29.6■■■□□ 2.33
DTX4-201ENST00000227451 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
DTX4-201ENST00000227451 SCRIBQ14160 1630 aa29.49■■■□□ 2.31
DTX4-201ENST00000227451 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
DTX4-201ENST00000227451 NEUROD1Q13562 356 aa29.29■■■□□ 2.28
DTX4-201ENST00000227451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.29■■■□□ 2.28
DTX4-201ENST00000227451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.26■■■□□ 2.27
DTX4-201ENST00000227451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
DTX4-201ENST00000227451 P3H3Q8IVL6 736 aa29.24■■■□□ 2.27
DTX4-201ENST00000227451 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
DTX4-201ENST00000227451 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
DTX4-201ENST00000227451 ARID3CA6NKF2 412 aa29.16■■■□□ 2.26
DTX4-201ENST00000227451 BCANQ96GW7 911 aa29.07■■■□□ 2.24
DTX4-201ENST00000227451 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
DTX4-201ENST00000227451 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
DTX4-201ENST00000227451 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
DTX4-201ENST00000227451 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
DTX4-201ENST00000227451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29■■■□□ 2.23
DTX4-201ENST00000227451 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.97■■■□□ 2.23
DTX4-201ENST00000227451 ANP32CO43423 234 aa28.91■■■□□ 2.22
DTX4-201ENST00000227451 NEFMP07197 916 aa28.81■■■□□ 2.2
DTX4-201ENST00000227451 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
DTX4-201ENST00000227451 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
DTX4-201ENST00000227451 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.71■■■□□ 2.19
DTX4-201ENST00000227451 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
DTX4-201ENST00000227451 SLC24A1O60721 1099 aa28.67■■■□□ 2.18
DTX4-201ENST00000227451 MYT1Q01538 1121 aa28.65■■■□□ 2.18
DTX4-201ENST00000227451 NACADO15069 1562 aa28.62■■■□□ 2.17
DTX4-201ENST00000227451 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
DTX4-201ENST00000227451 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
DTX4-201ENST00000227451 TONSLQ96HA7 1378 aa28.49■■■□□ 2.15
DTX4-201ENST00000227451 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.48■■■□□ 2.15
DTX4-201ENST00000227451 TSPY4P0CV99 314 aa28.46■■■□□ 2.15
DTX4-201ENST00000227451 TSPY10P0CW01 314 aa28.46■■■□□ 2.15
DTX4-201ENST00000227451 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
DTX4-201ENST00000227451 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.41■■■□□ 2.14
DTX4-201ENST00000227451 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
DTX4-201ENST00000227451 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
DTX4-201ENST00000227451 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.35■■■□□ 2.13
DTX4-201ENST00000227451 EEA1Q15075 1411 aa28.25■■■□□ 2.11
DTX4-201ENST00000227451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
DTX4-201ENST00000227451 CLIP1P30622 1438 aa28.23■■■□□ 2.11
DTX4-201ENST00000227451 ERCC6Q03468 1493 aa28.2■■■□□ 2.11
DTX4-201ENST00000227451 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.2■■■□□ 2.11
DTX4-201ENST00000227451 BCL11AQ9H165 835 aa28.19■■■□□ 2.1
DTX4-201ENST00000227451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.17■■■□□ 2.1
DTX4-201ENST00000227451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.1
DTX4-201ENST00000227451 KCNH8Q96L42 1107 aa28.15■■■□□ 2.1
DTX4-201ENST00000227451 GOLGA3Q08378 1498 aa28.12■■■□□ 2.09
DTX4-201ENST00000227451 KIF27Q86VH2 1401 aa28.11■■■□□ 2.09
DTX4-201ENST00000227451 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
DTX4-201ENST00000227451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
DTX4-201ENST00000227451 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.02■■■□□ 2.08
DTX4-201ENST00000227451 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.01■■■□□ 2.07
DTX4-201ENST00000227451 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
DTX4-201ENST00000227451 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.93■■■□□ 2.06
DTX4-201ENST00000227451 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
DTX4-201ENST00000227451 TMC1Q8TDI8 760 aa27.89■■■□□ 2.06
DTX4-201ENST00000227451 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
DTX4-201ENST00000227451 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
DTX4-201ENST00000227451 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
DTX4-201ENST00000227451 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
DTX4-201ENST00000227451 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.87■■■□□ 2.05
DTX4-201ENST00000227451 CEP162Q5TB80 1403 aa27.87■■■□□ 2.05
DTX4-201ENST00000227451 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms