Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 TPRA1-208ENST00000483868 1720 ntTSL 530.27■■■□□ 2.441e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PLXNA3-208ENST00000495040 421 ntTSL 529.65■■■□□ 2.342e-14■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-203ENST00000393400 1831 ntTSL 1 (best)29.33■■■□□ 2.291e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.231e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 MOSPD3-207ENST00000493970 853 ntTSL 528.64■■■□□ 2.181e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.971e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.941e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 324.61■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LTBP4-206ENST00000546155 1285 ntTSL 222.22■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-210ENST00000455690 784 ntTSL 321.63■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)21.53■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 CORO7-232ENST00000576637 730 ntTSL 318.14■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 517.83■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-206ENST00000471461 2286 ntTSL 217.51■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LTBP4-222ENST00000598256 752 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-204ENST00000462261 1619 ntTSL 216.25■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-204ENST00000463215 627 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-203ENST00000462205 619 ntTSL 315.9■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-207ENST00000443220 1175 ntTSL 215.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-206ENST00000437278 862 ntTSL 515.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PCIF1-202ENST00000479348 1324 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NSUN5-207ENST00000478977 580 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-205ENST00000463947 670 ntTSL 315.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-210ENST00000479024 1714 ntTSL 215.18■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PHPT1-206ENST00000497413 618 ntTSL 214.6□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 IRAK1-213ENST00000477274 705 ntTSL 514.32□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ITGA5-211ENST00000552564 4996 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LSS-210ENST00000491729 2143 ntTSL 213.82□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 MAMDC4-205ENST00000485732 4112 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-203ENST00000441123 5380 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RPRD2-204ENST00000492220 4780 ntTSL 512.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-206ENST00000449261 4816 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-205ENST00000452187 1269 ntTSL 511.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-201ENST00000318129 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 310.91□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-204ENST00000441730 3329 ntTSL 510.53□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 LSS-208ENST00000474319 3601 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PRPF3-202ENST00000467329 2595 ntTSL 510.26□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-208ENST00000492193 546 ntTSL 310.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 RPRD2-203ENST00000401000 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 BRPF3-212ENST00000534694 4628 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 GINS3-206ENST00000567143 3202 nt6.43□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-203ENST00000403017 4130 ntTSL 55.88□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 PRPF3-204ENST00000470824 898 ntTSL 25.63□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-9■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT213.44□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 CBX5-202ENST00000439541 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 43.6
PCBP1Q15365 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-209ENST00000565092 2740 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.135e-7■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 CLCN7-205ENST00000563642 4184 ntTSL 213.6□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 43.4
PCBP1Q15365 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-9■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-203ENST00000530105 1048 ntTSL 514.15□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PRG2-204ENST00000533605 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 43.3
PCBP1Q15365 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 43.1
PCBP1Q15365 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.381e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 527.55■■■□□ 21e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 523.02■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 519.59■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CTDSP1-209ENST00000488627 1118 ntTSL 317.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 514.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 43
PCBP1Q15365 CLSTN3-202ENST00000331148 2288 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.473e-14■■■■■ 42.9
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 332 ms