RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, humanhuman

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3-208ENST00000495040 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.92■■■■■ 8.14
PLXNA3-208ENST00000495040 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.95■■■■■ 7.03
PLXNA3-208ENST00000495040 ABCC9O60706 1549 aa58.38■■■■■ 6.94
PLXNA3-208ENST00000495040 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.86■■■■■ 6.53
PLXNA3-208ENST00000495040 NACADO15069 1562 aa55.61■■■■■ 6.49
PLXNA3-208ENST00000495040 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.4■■■■■ 6.46
PLXNA3-208ENST00000495040 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.04■■■■■ 6.4
PLXNA3-208ENST00000495040 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.73■■■■■ 6.35
PLXNA3-208ENST00000495040 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.58■■■■■ 6.33
PLXNA3-208ENST00000495040 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.51■■■■■ 6.32
PLXNA3-208ENST00000495040 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.44■■■■■ 6.31
PLXNA3-208ENST00000495040 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.27■■■■■ 6.28
PLXNA3-208ENST00000495040 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.17■■■■■ 6.26
PLXNA3-208ENST00000495040 SCRIBQ14160 1630 aa53.7■■■■■ 6.19
PLXNA3-208ENST00000495040 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.57■■■■■ 6.17
PLXNA3-208ENST00000495040 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.81■■■■■ 6.05
PLXNA3-208ENST00000495040 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.79■■■■■ 6.04
PLXNA3-208ENST00000495040 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.56■■■■■ 6.01
PLXNA3-208ENST00000495040 NCAPD3P42695 1498 aa51.32■■■■■ 5.81
PLXNA3-208ENST00000495040 SMARCA4P51532 1647 aa51.31■■■■■ 5.8
PLXNA3-208ENST00000495040 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.22■■■■■ 5.79
PLXNA3-208ENST00000495040 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.15■■■■■ 5.78
PLXNA3-208ENST00000495040 SMARCA2P51531 1590 aa51.14■■■■■ 5.78
PLXNA3-208ENST00000495040 HMGXB3Q12766 1538 aa50.99■■■■■ 5.75
PLXNA3-208ENST00000495040 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.82■■■■■ 5.73
PLXNA3-208ENST00000495040 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.77■■■■■ 5.72
PLXNA3-208ENST00000495040 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.77■■■■■ 5.72
PLXNA3-208ENST00000495040 ERCC6Q03468 1493 aa50.4■■■■■ 5.66
PLXNA3-208ENST00000495040 NESP48681 1621 aa50.29■■■■■ 5.64
PLXNA3-208ENST00000495040 WIZO95785 1651 aa50.19■■■■■ 5.63
PLXNA3-208ENST00000495040 CUX2O14529 1486 aa50.15■■■■■ 5.62
PLXNA3-208ENST00000495040 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.09■■■■■ 5.61
PLXNA3-208ENST00000495040 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.93■■■■■ 5.58
PLXNA3-208ENST00000495040 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.79■■■■■ 5.56
PLXNA3-208ENST00000495040 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.79■■■■■ 5.56
PLXNA3-208ENST00000495040 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.7■■■■■ 5.55
PLXNA3-208ENST00000495040 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.69■■■■■ 5.55
PLXNA3-208ENST00000495040 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
PLXNA3-208ENST00000495040 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.52■■■■■ 5.52
PLXNA3-208ENST00000495040 CFTRP13569 1480 aa49.32■■■■■ 5.49
PLXNA3-208ENST00000495040 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.31■■■■■ 5.48
PLXNA3-208ENST00000495040 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.22■■■■■ 5.47
PLXNA3-208ENST00000495040 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.2■■■■■ 5.47
PLXNA3-208ENST00000495040 WDR62O43379 1518 aa49.16■■■■■ 5.46
PLXNA3-208ENST00000495040 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.04■■■■■ 5.44
PLXNA3-208ENST00000495040 PRDM2Q13029 1718 aa48.91■■■■■ 5.42
PLXNA3-208ENST00000495040 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.74■■■■■ 5.39
PLXNA3-208ENST00000495040 TOPBP1Q92547 1522 aa48.32■■■■■ 5.33
PLXNA3-208ENST00000495040 ABCC8Q09428 1581 aa48.32■■■■■ 5.33
PLXNA3-208ENST00000495040 IFT140Q96RY7 1462 aa48.23■■■■■ 5.31
PLXNA3-208ENST00000495040 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.22■■■■■ 5.31
PLXNA3-208ENST00000495040 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
PLXNA3-208ENST00000495040 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.05■■■■■ 5.28
PLXNA3-208ENST00000495040 OSCARQ8IYS5 282 aa47.97■■■■■ 5.27
PLXNA3-208ENST00000495040 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.87■■■■■ 5.25
PLXNA3-208ENST00000495040 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.86■■■■■ 5.25
PLXNA3-208ENST00000495040 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
PLXNA3-208ENST00000495040 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.7■■■■■ 5.232e-6■■■■□ 26.1
PLXNA3-208ENST00000495040 CUX1P39880 1505 aa47.67■■■■■ 5.22
PLXNA3-208ENST00000495040 SOGA1O94964 1423 aa47.67■■■■■ 5.22
PLXNA3-208ENST00000495040 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.66■■■■■ 5.22
PLXNA3-208ENST00000495040 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.65■■■■■ 5.22
PLXNA3-208ENST00000495040 TRIM41Q8WV44 630 aa47.53■■■■■ 5.2
PLXNA3-208ENST00000495040 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
PLXNA3-208ENST00000495040 WDR97A6NE52 1622 aa47.47■■■■■ 5.19
PLXNA3-208ENST00000495040 CHD1O14646 1710 aa47.39■■■■■ 5.18
PLXNA3-208ENST00000495040 FBLN2P98095 1184 aa47.3■■■■■ 5.16
PLXNA3-208ENST00000495040 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.24■■■■■ 5.15
PLXNA3-208ENST00000495040 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.24■■■■■ 5.15
PLXNA3-208ENST00000495040 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.24■■■■■ 5.15
PLXNA3-208ENST00000495040 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.23■■■■■ 5.15
PLXNA3-208ENST00000495040 GRIN2BQ13224 1484 aa47.21■■■■■ 5.15
PLXNA3-208ENST00000495040 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
PLXNA3-208ENST00000495040 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.15■■■■■ 5.14
PLXNA3-208ENST00000495040 ARHGEF11O15085 1522 aa47.15■■■■■ 5.14
PLXNA3-208ENST00000495040 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.11■■■■■ 5.13
PLXNA3-208ENST00000495040 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.11■■■■■ 5.13
PLXNA3-208ENST00000495040 TOP2BQ02880 1626 aa47.08■■■■■ 5.13
PLXNA3-208ENST00000495040 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.08■■■■■ 5.13
PLXNA3-208ENST00000495040 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
PLXNA3-208ENST00000495040 PBRM1Q86U86 1689 aa47.05■■■■■ 5.12
PLXNA3-208ENST00000495040 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.01■■■■■ 5.12
PLXNA3-208ENST00000495040 SYNJ1O43426 1573 aa47.01■■■■■ 5.12
PLXNA3-208ENST00000495040 SYNJ2O15056 1496 aa46.99■■■■■ 5.11
PLXNA3-208ENST00000495040 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.84■■■■■ 5.09
PLXNA3-208ENST00000495040 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.78■■■■■ 5.08
PLXNA3-208ENST00000495040 ARAP1Q96P48 1450 aa46.71■■■■■ 5.07
PLXNA3-208ENST00000495040 ADAMTS12P58397 1594 aa46.62■■■■■ 5.05
PLXNA3-208ENST00000495040 GRIN2AQ12879 1464 aa46.59■■■■■ 5.05
PLXNA3-208ENST00000495040 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.59■■■■■ 5.05
PLXNA3-208ENST00000495040 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.54■■■■■ 5.04
PLXNA3-208ENST00000495040 NUP160Q12769 1436 aa46.42■■■■■ 5.02
PLXNA3-208ENST00000495040 CEP170Q5SW79 1584 aa46.38■■■■■ 5.01
PLXNA3-208ENST00000495040 KIF27Q86VH2 1401 aa46.2■■■■■ 4.99
PLXNA3-208ENST00000495040 SHROOM2Q13796 1616 aa46.15■■■■■ 4.98
PLXNA3-208ENST00000495040 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.12■■■■■ 4.97
PLXNA3-208ENST00000495040 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
PLXNA3-208ENST00000495040 IGF1RP08069 1367 aa46.09■■■■■ 4.97
PLXNA3-208ENST00000495040 CUL7Q14999 1698 aa46.01■■■■■ 4.96
PLXNA3-208ENST00000495040 JPH4Q96JJ6 628 aa45.96■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms