RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.16■■□□□ 1.3
GINS3-201ENST00000318129 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.34■□□□□ 0.85
GINS3-201ENST00000318129 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
GINS3-201ENST00000318129 ABCC9O60706 1549 aa19.35■□□□□ 0.69
GINS3-201ENST00000318129 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.2■□□□□ 0.66
GINS3-201ENST00000318129 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.15■□□□□ 0.66
GINS3-201ENST00000318129 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.08■□□□□ 0.64
GINS3-201ENST00000318129 NACADO15069 1562 aa19.01■□□□□ 0.63
GINS3-201ENST00000318129 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.88■□□□□ 0.61
GINS3-201ENST00000318129 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.62■□□□□ 0.57
GINS3-201ENST00000318129 SCRIBQ14160 1630 aa18.58■□□□□ 0.56
GINS3-201ENST00000318129 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.42■□□□□ 0.54
GINS3-201ENST00000318129 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.26■□□□□ 0.51
GINS3-201ENST00000318129 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
GINS3-201ENST00000318129 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.95■□□□□ 0.46
GINS3-201ENST00000318129 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
GINS3-201ENST00000318129 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
GINS3-201ENST00000318129 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
GINS3-201ENST00000318129 SMARCA4P51532 1647 aa17.84■□□□□ 0.45
GINS3-201ENST00000318129 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.83■□□□□ 0.45
GINS3-201ENST00000318129 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GINS3-201ENST00000318129 WIZO95785 1651 aa17.67■□□□□ 0.42
GINS3-201ENST00000318129 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.66■□□□□ 0.42
GINS3-201ENST00000318129 SMARCA2P51531 1590 aa17.63■□□□□ 0.41
GINS3-201ENST00000318129 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.61■□□□□ 0.41
GINS3-201ENST00000318129 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
GINS3-201ENST00000318129 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.53■□□□□ 0.4
GINS3-201ENST00000318129 NCAPD3P42695 1498 aa17.53■□□□□ 0.4
GINS3-201ENST00000318129 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
GINS3-201ENST00000318129 HMGXB3Q12766 1538 aa17.48■□□□□ 0.39
GINS3-201ENST00000318129 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.33■□□□□ 0.37
GINS3-201ENST00000318129 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.25■□□□□ 0.35
GINS3-201ENST00000318129 CFTRP13569 1480 aa17.06■□□□□ 0.32
GINS3-201ENST00000318129 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.06■□□□□ 0.32
GINS3-201ENST00000318129 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.99■□□□□ 0.31
GINS3-201ENST00000318129 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.97■□□□□ 0.31
GINS3-201ENST00000318129 PRDM2Q13029 1718 aa16.96■□□□□ 0.31
GINS3-201ENST00000318129 NESP48681 1621 aa16.89■□□□□ 0.3
GINS3-201ENST00000318129 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.86■□□□□ 0.29
GINS3-201ENST00000318129 TRIM41Q8WV44 630 aa16.85■□□□□ 0.29
GINS3-201ENST00000318129 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.84■□□□□ 0.29
GINS3-201ENST00000318129 ABCC8Q09428 1581 aa16.84■□□□□ 0.29
GINS3-201ENST00000318129 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
GINS3-201ENST00000318129 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.77■□□□□ 0.28
GINS3-201ENST00000318129 TOP2BQ02880 1626 aa16.72■□□□□ 0.27
GINS3-201ENST00000318129 SYNJ1O43426 1573 aa16.72■□□□□ 0.27
GINS3-201ENST00000318129 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.71■□□□□ 0.27
GINS3-201ENST00000318129 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.71■□□□□ 0.26
GINS3-201ENST00000318129 CUX1P39880 1505 aa16.7■□□□□ 0.26
GINS3-201ENST00000318129 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.66■□□□□ 0.26
GINS3-201ENST00000318129 ERCC6Q03468 1493 aa16.66■□□□□ 0.26
GINS3-201ENST00000318129 TOPBP1Q92547 1522 aa16.63■□□□□ 0.25
GINS3-201ENST00000318129 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.63■□□□□ 0.25
GINS3-201ENST00000318129 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
GINS3-201ENST00000318129 HRCP23327 699 aa16.62■□□□□ 0.25
GINS3-201ENST00000318129 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.56■□□□□ 0.24
GINS3-201ENST00000318129 WDR62O43379 1518 aa16.55■□□□□ 0.24
GINS3-201ENST00000318129 EEA1Q15075 1411 aa16.53■□□□□ 0.24
GINS3-201ENST00000318129 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
GINS3-201ENST00000318129 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
GINS3-201ENST00000318129 SOGA1O94964 1423 aa16.49■□□□□ 0.23
GINS3-201ENST00000318129 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
GINS3-201ENST00000318129 KIF27Q86VH2 1401 aa16.45■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.45■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.44■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.42■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 CUX2O14529 1486 aa16.42■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.42■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 IFT140Q96RY7 1462 aa16.41■□□□□ 0.22
GINS3-201ENST00000318129 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
GINS3-201ENST00000318129 WDR97A6NE52 1622 aa16.38■□□□□ 0.21
GINS3-201ENST00000318129 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 IGF1RP08069 1367 aa16.31■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.31■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.31■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 KIF21BO75037 1637 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS3-201ENST00000318129 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 PRXQ9BXM0 1461 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 GOLGA3Q08378 1498 aa16.24■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.23■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 GRIN2BQ13224 1484 aa16.23■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 CUL7Q14999 1698 aa16.22■□□□□ 0.19
GINS3-201ENST00000318129 PBRM1Q86U86 1689 aa16.2■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.19■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.17■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.16■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.15■□□□□ 0.18
GINS3-201ENST00000318129 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
GINS3-201ENST00000318129 ADAMTS12P58397 1594 aa16.11■□□□□ 0.17
GINS3-201ENST00000318129 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.1■□□□□ 0.17
GINS3-201ENST00000318129 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-201ENST00000318129 SYNJ2O15056 1496 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-201ENST00000318129 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms