Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCBTB2O95199 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCBTB2O95199 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCBTB2O95199 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCBTB2O95199 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms