RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000242827.10

EBPL-201, Transcript of EBP like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EBPL, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-201ENST00000242827 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.73■■■■■ 7.63
EBPL-201ENST00000242827 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.81■■■■■ 6.52
EBPL-201ENST00000242827 ABCC9O60706 1549 aa55.13■■■■■ 6.42
EBPL-201ENST00000242827 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.77■■■■■ 6.04
EBPL-201ENST00000242827 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.77■■■■■ 6.04
EBPL-201ENST00000242827 NACADO15069 1562 aa52.61■■■■■ 6.01
EBPL-201ENST00000242827 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.17■■■■■ 5.94
EBPL-201ENST00000242827 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.13■■■■■ 5.94
EBPL-201ENST00000242827 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.79■■■■■ 5.88
EBPL-201ENST00000242827 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.53■■■■■ 5.84
EBPL-201ENST00000242827 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.5■■■■■ 5.83
EBPL-201ENST00000242827 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.18■■■■■ 5.78
EBPL-201ENST00000242827 SCRIBQ14160 1630 aa51.05■■■■■ 5.76
EBPL-201ENST00000242827 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.93■■■■■ 5.74
EBPL-201ENST00000242827 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.53■■■■■ 5.68
EBPL-201ENST00000242827 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.88■■■■■ 5.58
EBPL-201ENST00000242827 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.77■■■■■ 5.56
EBPL-201ENST00000242827 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.54■■■■■ 5.52
EBPL-201ENST00000242827 SMARCA4P51532 1647 aa48.72■■■■■ 5.39
EBPL-201ENST00000242827 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.63■■■■■ 5.38
EBPL-201ENST00000242827 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.59■■■■■ 5.37
EBPL-201ENST00000242827 NCAPD3P42695 1498 aa48.58■■■■■ 5.37
EBPL-201ENST00000242827 SMARCA2P51531 1590 aa48.47■■■■■ 5.35
EBPL-201ENST00000242827 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.38■■■■■ 5.33
EBPL-201ENST00000242827 HMGXB3Q12766 1538 aa48.27■■■■■ 5.32
EBPL-201ENST00000242827 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.19■■■■■ 5.31
EBPL-201ENST00000242827 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
EBPL-201ENST00000242827 WIZO95785 1651 aa47.82■■■■■ 5.25
EBPL-201ENST00000242827 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.71■■■■■ 5.23
EBPL-201ENST00000242827 NESP48681 1621 aa47.59■■■■■ 5.21
EBPL-201ENST00000242827 ERCC6Q03468 1493 aa47.54■■■■■ 5.2
EBPL-201ENST00000242827 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.32■■■■■ 5.17
EBPL-201ENST00000242827 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
EBPL-201ENST00000242827 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.19■■■■■ 5.14
EBPL-201ENST00000242827 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.08■■■■■ 5.13
EBPL-201ENST00000242827 CUX2O14529 1486 aa47.06■■■■■ 5.12
EBPL-201ENST00000242827 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.93■■■■■ 5.1
EBPL-201ENST00000242827 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
EBPL-201ENST00000242827 CFTRP13569 1480 aa46.81■■■■■ 5.08
EBPL-201ENST00000242827 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.76■■■■■ 5.08
EBPL-201ENST00000242827 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.66■■■■■ 5.06
EBPL-201ENST00000242827 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.62■■■■■ 5.05
EBPL-201ENST00000242827 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.62■■■■■ 5.05
EBPL-201ENST00000242827 WDR62O43379 1518 aa46.43■■■■■ 5.02
EBPL-201ENST00000242827 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
EBPL-201ENST00000242827 PRDM2Q13029 1718 aa46.29■■■■■ 5
EBPL-201ENST00000242827 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
EBPL-201ENST00000242827 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.08■■■■■ 4.97
EBPL-201ENST00000242827 TOPBP1Q92547 1522 aa45.86■■■■■ 4.93
EBPL-201ENST00000242827 ABCC8Q09428 1581 aa45.79■■■■■ 4.92
EBPL-201ENST00000242827 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.75■■■■■ 4.91
EBPL-201ENST00000242827 IFT140Q96RY7 1462 aa45.65■■■■■ 4.9
EBPL-201ENST00000242827 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
EBPL-201ENST00000242827 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
EBPL-201ENST00000242827 CUX1P39880 1505 aa45.39■■■■■ 4.86
EBPL-201ENST00000242827 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
EBPL-201ENST00000242827 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.31■■■■■ 4.84
EBPL-201ENST00000242827 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.31■■■■■ 4.84
EBPL-201ENST00000242827 SOGA1O94964 1423 aa45.3■■■■■ 4.84
EBPL-201ENST00000242827 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
EBPL-201ENST00000242827 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.23■■■■■ 4.83
EBPL-201ENST00000242827 OSCARQ8IYS5 282 aa45.15■■■■■ 4.82
EBPL-201ENST00000242827 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
EBPL-201ENST00000242827 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.8
EBPL-201ENST00000242827 WDR97A6NE52 1622 aa44.89■■■■■ 4.78
EBPL-201ENST00000242827 SYNJ1O43426 1573 aa44.88■■■■■ 4.78
EBPL-201ENST00000242827 TOP2BQ02880 1626 aa44.86■■■■■ 4.77
EBPL-201ENST00000242827 FBLN2P98095 1184 aa44.85■■■■■ 4.77
EBPL-201ENST00000242827 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.84■■■■■ 4.77
EBPL-201ENST00000242827 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.8■■■■■ 4.76
EBPL-201ENST00000242827 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.78■■■■■ 4.76
EBPL-201ENST00000242827 GRIN2BQ13224 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
EBPL-201ENST00000242827 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.74■■■■■ 4.75
EBPL-201ENST00000242827 CHD1O14646 1710 aa44.72■■■■■ 4.75
EBPL-201ENST00000242827 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
EBPL-201ENST00000242827 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.63■■■■■ 4.73
EBPL-201ENST00000242827 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
EBPL-201ENST00000242827 PBRM1Q86U86 1689 aa44.59■■■■■ 4.73
EBPL-201ENST00000242827 TRIM41Q8WV44 630 aa44.56■■■■■ 4.72
EBPL-201ENST00000242827 SYNJ2O15056 1496 aa44.51■■■■■ 4.72
EBPL-201ENST00000242827 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.39■■■■■ 4.7
EBPL-201ENST00000242827 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.39■■■■■ 4.7
EBPL-201ENST00000242827 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.39■■■■■ 4.7
EBPL-201ENST00000242827 ARHGEF11O15085 1522 aa44.37■■■■■ 4.69
EBPL-201ENST00000242827 ADAMTS12P58397 1594 aa44.26■■■■■ 4.68
EBPL-201ENST00000242827 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.24■■■■■ 4.67
EBPL-201ENST00000242827 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.24■■■■■ 4.67
EBPL-201ENST00000242827 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.21■■■■■ 4.67
EBPL-201ENST00000242827 GRIN2AQ12879 1464 aa44.2■■■■■ 4.67
EBPL-201ENST00000242827 KIF27Q86VH2 1401 aa44.09■■■■■ 4.65
EBPL-201ENST00000242827 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.09■■■■■ 4.65
EBPL-201ENST00000242827 ARAP1Q96P48 1450 aa44■■■■■ 4.63
EBPL-201ENST00000242827 NUP160Q12769 1436 aa43.99■■■■■ 4.63
EBPL-201ENST00000242827 CEP170Q5SW79 1584 aa43.98■■■■■ 4.63
EBPL-201ENST00000242827 IGF1RP08069 1367 aa43.96■■■■■ 4.63
EBPL-201ENST00000242827 CUL7Q14999 1698 aa43.76■■■■■ 4.6
EBPL-201ENST00000242827 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.7■■■■■ 4.59
EBPL-201ENST00000242827 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.67■■■■■ 4.58
EBPL-201ENST00000242827 SHROOM2Q13796 1616 aa43.63■■■■■ 4.58
EBPL-201ENST00000242827 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.63■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms