RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638121.1

CHML-204, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHML, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHML-204ENST00000638121 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.43■■■■■ 7.58
CHML-204ENST00000638121 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.51■■■■■ 6.48
CHML-204ENST00000638121 ABCC9O60706 1549 aa54.52■■■■■ 6.32
CHML-204ENST00000638121 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.35■■■■■ 5.97
CHML-204ENST00000638121 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.33■■■■■ 5.97
CHML-204ENST00000638121 NACADO15069 1562 aa52.25■■■■■ 5.96
CHML-204ENST00000638121 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.96■■■■■ 5.91
CHML-204ENST00000638121 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.88■■■■■ 5.9
CHML-204ENST00000638121 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.62■■■■■ 5.85
CHML-204ENST00000638121 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.13■■■■■ 5.77
CHML-204ENST00000638121 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.97■■■■■ 5.75
CHML-204ENST00000638121 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.76■■■■■ 5.72
CHML-204ENST00000638121 SCRIBQ14160 1630 aa50.69■■■■■ 5.71
CHML-204ENST00000638121 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.19■■■■■ 5.62
CHML-204ENST00000638121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.18■■■■■ 5.62
CHML-204ENST00000638121 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.5
CHML-204ENST00000638121 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.28■■■■■ 5.48
CHML-204ENST00000638121 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.99■■■■■ 5.43
CHML-204ENST00000638121 SMARCA4P51532 1647 aa48.46■■■■■ 5.35
CHML-204ENST00000638121 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
CHML-204ENST00000638121 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.25■■■■■ 5.31
CHML-204ENST00000638121 NCAPD3P42695 1498 aa48.23■■■■■ 5.31
CHML-204ENST00000638121 SMARCA2P51531 1590 aa48.17■■■■■ 5.3
CHML-204ENST00000638121 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.13■■■■■ 5.29
CHML-204ENST00000638121 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.96■■■■■ 5.27
CHML-204ENST00000638121 HMGXB3Q12766 1538 aa47.96■■■■■ 5.27
CHML-204ENST00000638121 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
CHML-204ENST00000638121 WIZO95785 1651 aa47.59■■■■■ 5.21
CHML-204ENST00000638121 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
CHML-204ENST00000638121 NESP48681 1621 aa47.13■■■■■ 5.14
CHML-204ENST00000638121 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
CHML-204ENST00000638121 ERCC6Q03468 1493 aa47.01■■■■■ 5.12
CHML-204ENST00000638121 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.97■■■■■ 5.11
CHML-204ENST00000638121 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.85■■■■■ 5.09
CHML-204ENST00000638121 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.7■■■■■ 5.07
CHML-204ENST00000638121 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.55■■■■■ 5.04
CHML-204ENST00000638121 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.53■■■■■ 5.04
CHML-204ENST00000638121 CUX2O14529 1486 aa46.52■■■■■ 5.04
CHML-204ENST00000638121 CFTRP13569 1480 aa46.52■■■■■ 5.04
CHML-204ENST00000638121 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
CHML-204ENST00000638121 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
CHML-204ENST00000638121 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.3■■■■■ 5
CHML-204ENST00000638121 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.25■■■■■ 4.99
CHML-204ENST00000638121 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.21■■■■■ 4.99
CHML-204ENST00000638121 PRDM2Q13029 1718 aa46.1■■■■■ 4.97
CHML-204ENST00000638121 WDR62O43379 1518 aa46.03■■■■■ 4.96
CHML-204ENST00000638121 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
CHML-204ENST00000638121 TOPBP1Q92547 1522 aa45.54■■■■■ 4.88
CHML-204ENST00000638121 ABCC8Q09428 1581 aa45.53■■■■■ 4.88
CHML-204ENST00000638121 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.46■■■■■ 4.87
CHML-204ENST00000638121 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.29■■■■■ 4.84
CHML-204ENST00000638121 IFT140Q96RY7 1462 aa45.29■■■■■ 4.84
CHML-204ENST00000638121 CUX1P39880 1505 aa45.15■■■■■ 4.82
CHML-204ENST00000638121 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
CHML-204ENST00000638121 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
CHML-204ENST00000638121 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
CHML-204ENST00000638121 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.03■■■■■ 4.8
CHML-204ENST00000638121 SOGA1O94964 1423 aa45■■■■■ 4.79
CHML-204ENST00000638121 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.98■■■■■ 4.79
CHML-204ENST00000638121 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
CHML-204ENST00000638121 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.85■■■■■ 4.771e-12■■■■□ 20.3
CHML-204ENST00000638121 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.84■■■■■ 4.77
CHML-204ENST00000638121 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
CHML-204ENST00000638121 TOP2BQ02880 1626 aa44.72■■■■■ 4.75
CHML-204ENST00000638121 SYNJ1O43426 1573 aa44.7■■■■■ 4.75
CHML-204ENST00000638121 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.7■■■■■ 4.75
CHML-204ENST00000638121 WDR97A6NE52 1622 aa44.64■■■■■ 4.74
CHML-204ENST00000638121 OSCARQ8IYS5 282 aa44.64■■■■■ 4.74
CHML-204ENST00000638121 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.57■■■■■ 4.73
CHML-204ENST00000638121 GRIN2BQ13224 1484 aa44.46■■■■■ 4.71
CHML-204ENST00000638121 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.45■■■■■ 4.71
CHML-204ENST00000638121 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.41■■■■■ 4.7
CHML-204ENST00000638121 FBLN2P98095 1184 aa44.39■■■■■ 4.7
CHML-204ENST00000638121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.38■■■■■ 4.69
CHML-204ENST00000638121 CHD1O14646 1710 aa44.34■■■■■ 4.69
CHML-204ENST00000638121 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
CHML-204ENST00000638121 PBRM1Q86U86 1689 aa44.32■■■■■ 4.68
CHML-204ENST00000638121 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
CHML-204ENST00000638121 SYNJ2O15056 1496 aa44.18■■■■■ 4.66
CHML-204ENST00000638121 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.03■■■■■ 4.64
CHML-204ENST00000638121 ADAMTS12P58397 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
CHML-204ENST00000638121 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.93■■■■■ 4.62
CHML-204ENST00000638121 KIF27Q86VH2 1401 aa43.91■■■■■ 4.62
CHML-204ENST00000638121 GRIN2AQ12879 1464 aa43.88■■■■■ 4.61
CHML-204ENST00000638121 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.87■■■■■ 4.61
CHML-204ENST00000638121 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.87■■■■■ 4.61
CHML-204ENST00000638121 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.87■■■■■ 4.61
CHML-204ENST00000638121 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.86■■■■■ 4.61
CHML-204ENST00000638121 ARHGEF11O15085 1522 aa43.85■■■■■ 4.61
CHML-204ENST00000638121 TRIM41Q8WV44 630 aa43.8■■■■■ 4.6
CHML-204ENST00000638121 IGF1RP08069 1367 aa43.76■■■■■ 4.6
CHML-204ENST00000638121 NUP160Q12769 1436 aa43.68■■■■■ 4.58
CHML-204ENST00000638121 CEP170Q5SW79 1584 aa43.66■■■■■ 4.58
CHML-204ENST00000638121 CUL7Q14999 1698 aa43.59■■■■■ 4.57
CHML-204ENST00000638121 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.53■■■■■ 4.56
CHML-204ENST00000638121 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.5■■■■■ 4.55
CHML-204ENST00000638121 ARAP1Q96P48 1450 aa43.5■■■■■ 4.55
CHML-204ENST00000638121 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.48■■■■■ 4.55
CHML-204ENST00000638121 SHROOM2Q13796 1616 aa43.33■■■■■ 4.53
CHML-204ENST00000638121 JPH4Q96JJ6 628 aa43.3■■■■■ 4.52
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