RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339083.11

RHOC-202, Transcript of ras homolog family member C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOC, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RHOC-202ENST00000339083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.8■■■■■ 6.04
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RHOC-202ENST00000339083 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.09■■■■■ 5.93
RHOC-202ENST00000339083 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.8■■■■■ 5.88
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RHOC-202ENST00000339083 SMARCA2P51531 1590 aa48.56■■■■■ 5.36
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RHOC-202ENST00000339083 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.18■■■■■ 5.14
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RHOC-202ENST00000339083 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.59■■■■■ 5.05
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RHOC-202ENST00000339083 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.87■■■■■ 4.93
RHOC-202ENST00000339083 ABCC8Q09428 1581 aa45.83■■■■■ 4.93
RHOC-202ENST00000339083 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.66■■■■■ 4.9
RHOC-202ENST00000339083 IFT140Q96RY7 1462 aa45.63■■■■■ 4.9
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RHOC-202ENST00000339083 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
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RHOC-202ENST00000339083 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.4■■■■■ 4.86
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RHOC-202ENST00000339083 WDR97A6NE52 1622 aa45.13■■■■■ 4.82
RHOC-202ENST00000339083 SYNJ1O43426 1573 aa45.13■■■■■ 4.82
RHOC-202ENST00000339083 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.13■■■■■ 4.816e-6■■■□□ 16.7
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RHOC-202ENST00000339083 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
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RHOC-202ENST00000339083 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.84■■■■■ 4.77
RHOC-202ENST00000339083 PBRM1Q86U86 1689 aa44.79■■■■■ 4.76
RHOC-202ENST00000339083 GRIN2BQ13224 1484 aa44.78■■■■■ 4.76
RHOC-202ENST00000339083 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.78■■■■■ 4.76
RHOC-202ENST00000339083 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.77■■■■■ 4.76
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RHOC-202ENST00000339083 ADAMTS12P58397 1594 aa44.41■■■■■ 4.7
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RHOC-202ENST00000339083 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.39■■■■■ 4.7
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RHOC-202ENST00000339083 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.34■■■■■ 4.69
RHOC-202ENST00000339083 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.33■■■■■ 4.69
RHOC-202ENST00000339083 ARHGEF11O15085 1522 aa44.28■■■■■ 4.68
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RHOC-202ENST00000339083 KIF27Q86VH2 1401 aa44.16■■■■■ 4.66
RHOC-202ENST00000339083 CEP170Q5SW79 1584 aa44.09■■■■■ 4.65
RHOC-202ENST00000339083 NUP160Q12769 1436 aa44.07■■■■■ 4.65
RHOC-202ENST00000339083 TRIM41Q8WV44 630 aa44.05■■■■■ 4.64
RHOC-202ENST00000339083 IGF1RP08069 1367 aa44.05■■■■■ 4.64
RHOC-202ENST00000339083 CUL7Q14999 1698 aa43.98■■■■■ 4.63
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RHOC-202ENST00000339083 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.74■■■■■ 4.59
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