Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.979e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WBP11-202ENST00000535328 494 ntTSL 28.62□□□□□ -1.039e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.039e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.049e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 GSTK1-206ENST00000473649 2692 ntTSL 28.3□□□□□ -1.089e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.119e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PTCD3-205ENST00000464541 890 ntTSL 57.7□□□□□ -1.189e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 COPB2-206ENST00000510181 1037 ntTSL 27.49□□□□□ -1.219e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-210ENST00000538787 579 ntTSL 47.14□□□□□ -1.279e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 27.06□□□□□ -1.289e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TFAM-203ENST00000395377 663 ntTSL 26.98□□□□□ -1.299e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.299e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-204ENST00000553422 438 ntTSL 36.86□□□□□ -1.319e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.329e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-212ENST00000460646 2857 ntTSL 1 (best)6.79□□□□□ -1.329e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.369e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PTCD3-211ENST00000476215 754 ntTSL 36.55□□□□□ -1.369e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 WNK1-211ENST00000540360 668 ntTSL 26.54□□□□□ -1.369e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PTCD3-208ENST00000469585 885 ntTSL 26.38□□□□□ -1.399e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-219ENST00000520158 719 ntTSL 36.12□□□□□ -1.439e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRRFIP2-219ENST00000496479 3585 ntTSL 25.88□□□□□ -1.479e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 COPB2-213ENST00000515006 548 ntTSL 55.5□□□□□ -1.539e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.639e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.639e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CCT5-212ENST00000514674 568 ntTSL 24.83□□□□□ -1.641e-17■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PTCD3-216ENST00000487043 1054 ntTSL 34.77□□□□□ -1.659e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CTNNA1-241ENST00000524127 483 ntTSL 44.67□□□□□ -1.669e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-212ENST00000556721 444 ntTSL 24.57□□□□□ -1.689e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 CALM1-209ENST00000554296 531 ntTSL 24.52□□□□□ -1.699e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 VPS13D-207ENST00000476169 475 ntTSL 34.49□□□□□ -1.699e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 SF3A1-202ENST00000411423 548 ntTSL 419.73■□□□□ 0.753e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 SF3A1-204ENST00000447376 418 ntTSL 516.66■□□□□ 0.263e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.944e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-209ENST00000450098 530 ntTSL 335.6■■■■□ 3.297e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.467e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RNF220-201ENST00000335497 1203 ntTSL 527.99■■■□□ 2.077e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RNF220-216ENST00000488865 860 ntTSL 227.99■■■□□ 2.077e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 UBAP2L-205ENST00000412596 980 ntTSL 527.95■■■□□ 2.067e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 UBAP2L-209ENST00000437652 911 ntTSL 327.91■■■□□ 2.067e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.817e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-208ENST00000436051 512 ntTSL 325.47■■□□□ 1.677e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.647e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RNF220-208ENST00000471494 720 ntTSL 524.51■■□□□ 1.517e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PAIP1-204ENST00000504075 501 ntTSL 324.02■■□□□ 1.447e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-207ENST00000417803 474 ntTSL 323.75■■□□□ 1.397e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MYCBP2-209ENST00000491491 649 ntTSL 523.34■■□□□ 1.337e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.217e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.217e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.167e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.157e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 421.95■■□□□ 1.17e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MNT-202ENST00000571232 508 ntTSL 421.38■■□□□ 1.017e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 ARHGAP4-212ENST00000454164 747 ntTSL 520.69■□□□□ 0.97e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 ARHGAP4-218ENST00000467421 798 ntTSL 220.56■□□□□ 0.887e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)20.33■□□□□ 0.857e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RNF220-212ENST00000475378 916 ntTSL 320.3■□□□□ 0.847e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RNF220-205ENST00000440132 1200 ntTSL 219.63■□□□□ 0.737e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.647e-7■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.497e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PAIP1-205ENST00000504639 1766 ntTSL 517.86■□□□□ 0.457e-7■□□□□ 9.3
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PUM1Q14671 CNOT3-209ENST00000617930 2047 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TBCE-206ENST00000482230 1050 ntTSL 516.36■□□□□ 0.217e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 UBAP2L-204ENST00000368504 1120 ntTSL 515.8■□□□□ 0.127e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 NDUFA13-206ENST00000511584 640 ntTSL 215.21■□□□□ 0.037e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MNT-207ENST00000575374 936 ntTSL 314.96□□□□□ -0.017e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 514.56□□□□□ -0.087e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 414.56□□□□□ -0.087e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.17e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MINK1-206ENST00000572304 559 ntTSL 414.4□□□□□ -0.17e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.147e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.177e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.187e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 413.56□□□□□ -0.247e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 213.48□□□□□ -0.257e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 513.2□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-208ENST00000426827 756 ntTSL 413.2□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-219ENST00000452597 603 ntTSL 412.41□□□□□ -0.427e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.437e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 PPM1F-205ENST00000445205 650 ntTSL 511.85□□□□□ -0.517e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-231ENST00000496246 507 ntTSL 411.73□□□□□ -0.537e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-217ENST00000439814 497 ntTSL 411.01□□□□□ -0.657e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 410.85□□□□□ -0.677e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-207ENST00000422738 545 ntTSL 410.85□□□□□ -0.677e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 410.85□□□□□ -0.677e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 410.4□□□□□ -0.747e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 59.31□□□□□ -0.927e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 RNF220-206ENST00000453863 361 ntTSL 39.29□□□□□ -0.927e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 39.22□□□□□ -0.937e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.117e-7■□□□□ 9.3
PUM1Q14671 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.197e-7■□□□□ 9.3
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