RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335497.11

RNF220-201, Transcript of ring finger protein 220, humanhuman

TSL 5

Gene RNF220, Length 1,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220-201ENST00000335497 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65■■■■■ 8
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RNF220-201ENST00000335497 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.41■■■■■ 6.46
RNF220-201ENST00000335497 NACADO15069 1562 aa55.09■■■■■ 6.41
RNF220-201ENST00000335497 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.73■■■■■ 6.35
RNF220-201ENST00000335497 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.42■■■■■ 6.3
RNF220-201ENST00000335497 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.38■■■■■ 6.3
RNF220-201ENST00000335497 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.1■■■■■ 6.25
RNF220-201ENST00000335497 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.09■■■■■ 6.25
RNF220-201ENST00000335497 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.89■■■■■ 6.22
RNF220-201ENST00000335497 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.76■■■■■ 6.2
RNF220-201ENST00000335497 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.75■■■■■ 6.2
RNF220-201ENST00000335497 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.14■■■■■ 6.1
RNF220-201ENST00000335497 SCRIBQ14160 1630 aa53.04■■■■■ 6.08
RNF220-201ENST00000335497 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.51■■■■■ 6
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RNF220-201ENST00000335497 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.35■■■■■ 5.97
RNF220-201ENST00000335497 NCAPD3P42695 1498 aa50.86■■■■■ 5.73
RNF220-201ENST00000335497 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.7■■■■■ 5.71
RNF220-201ENST00000335497 SMARCA4P51532 1647 aa50.65■■■■■ 5.7
RNF220-201ENST00000335497 SMARCA2P51531 1590 aa50.58■■■■■ 5.69
RNF220-201ENST00000335497 HMGXB3Q12766 1538 aa50.48■■■■■ 5.67
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RNF220-201ENST00000335497 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.21■■■■■ 5.63
RNF220-201ENST00000335497 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.2■■■■■ 5.63
RNF220-201ENST00000335497 ERCC6Q03468 1493 aa50.16■■■■■ 5.62
RNF220-201ENST00000335497 CUX2O14529 1486 aa50.08■■■■■ 5.61
RNF220-201ENST00000335497 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.04■■■■■ 5.6
RNF220-201ENST00000335497 NESP48681 1621 aa49.93■■■■■ 5.58
RNF220-201ENST00000335497 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.9■■■■■ 5.58
RNF220-201ENST00000335497 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.68■■■■■ 5.54
RNF220-201ENST00000335497 WIZO95785 1651 aa49.44■■■■■ 5.5
RNF220-201ENST00000335497 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
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RNF220-201ENST00000335497 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.3■■■■■ 5.48
RNF220-201ENST00000335497 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.29■■■■■ 5.48
RNF220-201ENST00000335497 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.09■■■■■ 5.45
RNF220-201ENST00000335497 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.93■■■■■ 5.42
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RNF220-201ENST00000335497 WDR62O43379 1518 aa48.82■■■■■ 5.41
RNF220-201ENST00000335497 CFTRP13569 1480 aa48.77■■■■■ 5.4
RNF220-201ENST00000335497 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.76■■■■■ 5.4
RNF220-201ENST00000335497 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.72■■■■■ 5.39
RNF220-201ENST00000335497 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.31■■■■■ 5.32
RNF220-201ENST00000335497 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
RNF220-201ENST00000335497 PRDM2Q13029 1718 aa48.27■■■■■ 5.32
RNF220-201ENST00000335497 TOPBP1Q92547 1522 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF220-201ENST00000335497 OSCARQ8IYS5 282 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF220-201ENST00000335497 IFT140Q96RY7 1462 aa47.8■■■■■ 5.24
RNF220-201ENST00000335497 ABCC8Q09428 1581 aa47.79■■■■■ 5.24
RNF220-201ENST00000335497 TRIM41Q8WV44 630 aa47.69■■■■■ 5.22
RNF220-201ENST00000335497 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
RNF220-201ENST00000335497 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.66■■■■■ 5.22
RNF220-201ENST00000335497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
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RNF220-201ENST00000335497 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
RNF220-201ENST00000335497 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.26■■■■■ 5.163e-7■■■■□ 24.8
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RNF220-201ENST00000335497 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.12■■■■■ 5.13
RNF220-201ENST00000335497 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.12■■■■■ 5.13
RNF220-201ENST00000335497 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.12■■■■■ 5.13
RNF220-201ENST00000335497 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.04■■■■■ 5.12
RNF220-201ENST00000335497 CUX1P39880 1505 aa47.02■■■■■ 5.12
RNF220-201ENST00000335497 CHD1O14646 1710 aa47.02■■■■■ 5.12
RNF220-201ENST00000335497 ARHGEF11O15085 1522 aa47■■■■■ 5.12
RNF220-201ENST00000335497 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
RNF220-201ENST00000335497 WDR97A6NE52 1622 aa46.97■■■■■ 5.11
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RNF220-201ENST00000335497 FBLN2P98095 1184 aa46.91■■■■■ 5.1
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RNF220-201ENST00000335497 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
RNF220-201ENST00000335497 GRIN2BQ13224 1484 aa46.71■■■■■ 5.07
RNF220-201ENST00000335497 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.65■■■■■ 5.06
RNF220-201ENST00000335497 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
RNF220-201ENST00000335497 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.56■■■■■ 5.04
RNF220-201ENST00000335497 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.55■■■■■ 5.04
RNF220-201ENST00000335497 SYNJ2O15056 1496 aa46.55■■■■■ 5.04
RNF220-201ENST00000335497 ARAP1Q96P48 1450 aa46.55■■■■■ 5.04
RNF220-201ENST00000335497 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.53■■■■■ 5.04
RNF220-201ENST00000335497 SYNJ1O43426 1573 aa46.52■■■■■ 5.04
RNF220-201ENST00000335497 PBRM1Q86U86 1689 aa46.49■■■■■ 5.03
RNF220-201ENST00000335497 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.45■■■■■ 5.03
RNF220-201ENST00000335497 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
RNF220-201ENST00000335497 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.32■■■■■ 5.01
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RNF220-201ENST00000335497 GRIN2AQ12879 1464 aa46.1■■■■■ 4.97
RNF220-201ENST00000335497 ADAMTS12P58397 1594 aa46.08■■■■■ 4.97
RNF220-201ENST00000335497 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
RNF220-201ENST00000335497 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.99■■■■■ 4.95
RNF220-201ENST00000335497 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.98■■■■■ 4.95
RNF220-201ENST00000335497 NUP160Q12769 1436 aa45.96■■■■■ 4.95
RNF220-201ENST00000335497 CEP170Q5SW79 1584 aa45.91■■■■■ 4.94
RNF220-201ENST00000335497 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.76■■■■■ 4.92
RNF220-201ENST00000335497 SHROOM2Q13796 1616 aa45.74■■■■■ 4.91
RNF220-201ENST00000335497 JPH4Q96JJ6 628 aa45.49■■■■■ 4.87
RNF220-201ENST00000335497 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
RNF220-201ENST00000335497 KIF27Q86VH2 1401 aa45.44■■■■■ 4.87
RNF220-201ENST00000335497 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.42■■■■■ 4.86
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