RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504075.1

PAIP1-204, Transcript of poly(A) binding protein interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PAIP1, Length 501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAIP1-204ENST00000504075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.35■■■■■ 6.77
PAIP1-204ENST00000504075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.09■■■■■ 5.77
PAIP1-204ENST00000504075 ABCC9O60706 1549 aa50.06■■■■■ 5.6
PAIP1-204ENST00000504075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.14■■■■■ 5.3
PAIP1-204ENST00000504075 NACADO15069 1562 aa48.05■■■■■ 5.28
PAIP1-204ENST00000504075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.98■■■■■ 5.27
PAIP1-204ENST00000504075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
PAIP1-204ENST00000504075 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.71■■■■■ 5.23
PAIP1-204ENST00000504075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.46■■■■■ 5.19
PAIP1-204ENST00000504075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.04■■■■■ 5.12
PAIP1-204ENST00000504075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.74■■■■■ 5.07
PAIP1-204ENST00000504075 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.64■■■■■ 5.06
PAIP1-204ENST00000504075 SCRIBQ14160 1630 aa46.57■■■■■ 5.05
PAIP1-204ENST00000504075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.98
PAIP1-204ENST00000504075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.01■■■■■ 4.96
PAIP1-204ENST00000504075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
PAIP1-204ENST00000504075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.29■■■■■ 4.84
PAIP1-204ENST00000504075 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.99■■■■■ 4.79
PAIP1-204ENST00000504075 SMARCA4P51532 1647 aa44.54■■■■■ 4.72
PAIP1-204ENST00000504075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
PAIP1-204ENST00000504075 NCAPD3P42695 1498 aa44.32■■■■■ 4.69
PAIP1-204ENST00000504075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.31■■■■■ 4.68
PAIP1-204ENST00000504075 SMARCA2P51531 1590 aa44.29■■■■■ 4.68
PAIP1-204ENST00000504075 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.18■■■■■ 4.66
PAIP1-204ENST00000504075 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.1■■■■■ 4.65
PAIP1-204ENST00000504075 HMGXB3Q12766 1538 aa44.1■■■■■ 4.65
PAIP1-204ENST00000504075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
PAIP1-204ENST00000504075 WIZO95785 1651 aa43.72■■■■■ 4.59
PAIP1-204ENST00000504075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
PAIP1-204ENST00000504075 NESP48681 1621 aa43.26■■■■■ 4.52
PAIP1-204ENST00000504075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
PAIP1-204ENST00000504075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.2■■■■■ 4.51
PAIP1-204ENST00000504075 ERCC6Q03468 1493 aa43.19■■■■■ 4.5
PAIP1-204ENST00000504075 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.02■■■■■ 4.48
PAIP1-204ENST00000504075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.9■■■■■ 4.46
PAIP1-204ENST00000504075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.79■■■■■ 4.44
PAIP1-204ENST00000504075 CUX2O14529 1486 aa42.77■■■■■ 4.44
PAIP1-204ENST00000504075 CFTRP13569 1480 aa42.74■■■■■ 4.43
PAIP1-204ENST00000504075 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.73■■■■■ 4.43
PAIP1-204ENST00000504075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PAIP1-204ENST00000504075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.53■■■■■ 4.4
PAIP1-204ENST00000504075 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.5■■■■■ 4.39
PAIP1-204ENST00000504075 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.46■■■■■ 4.39
PAIP1-204ENST00000504075 PRDM2Q13029 1718 aa42.46■■■■■ 4.39
PAIP1-204ENST00000504075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
PAIP1-204ENST00000504075 WDR62O43379 1518 aa42.31■■■■■ 4.36
PAIP1-204ENST00000504075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PAIP1-204ENST00000504075 ABCC8Q09428 1581 aa41.87■■■■■ 4.29
PAIP1-204ENST00000504075 TOPBP1Q92547 1522 aa41.84■■■■■ 4.29
PAIP1-204ENST00000504075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.79■■■■■ 4.28
PAIP1-204ENST00000504075 IFT140Q96RY7 1462 aa41.61■■■■■ 4.25
PAIP1-204ENST00000504075 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.58■■■■■ 4.25
PAIP1-204ENST00000504075 CUX1P39880 1505 aa41.46■■■■■ 4.23
PAIP1-204ENST00000504075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
PAIP1-204ENST00000504075 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
PAIP1-204ENST00000504075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
PAIP1-204ENST00000504075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.35■■■■■ 4.21
PAIP1-204ENST00000504075 SOGA1O94964 1423 aa41.31■■■■■ 4.2
PAIP1-204ENST00000504075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.27■■■■■ 4.2
PAIP1-204ENST00000504075 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
PAIP1-204ENST00000504075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.17■■■■■ 4.18
PAIP1-204ENST00000504075 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.183e-7■■■□□ 16.5
PAIP1-204ENST00000504075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.11■■■■■ 4.17
PAIP1-204ENST00000504075 TOP2BQ02880 1626 aa41.1■■■■■ 4.17
PAIP1-204ENST00000504075 WDR97A6NE52 1622 aa41.09■■■■■ 4.17
PAIP1-204ENST00000504075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
PAIP1-204ENST00000504075 SYNJ1O43426 1573 aa41.06■■■■■ 4.16
PAIP1-204ENST00000504075 OSCARQ8IYS5 282 aa40.98■■■■■ 4.15
PAIP1-204ENST00000504075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.95■■■■■ 4.15
PAIP1-204ENST00000504075 GRIN2BQ13224 1484 aa40.85■■■■■ 4.13
PAIP1-204ENST00000504075 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
PAIP1-204ENST00000504075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.8■■■■■ 4.12
PAIP1-204ENST00000504075 CHD1O14646 1710 aa40.79■■■■■ 4.12
PAIP1-204ENST00000504075 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.78■■■■■ 4.12
PAIP1-204ENST00000504075 PBRM1Q86U86 1689 aa40.77■■■■■ 4.12
PAIP1-204ENST00000504075 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
PAIP1-204ENST00000504075 FBLN2P98095 1184 aa40.72■■■■■ 4.11
PAIP1-204ENST00000504075 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PAIP1-204ENST00000504075 SYNJ2O15056 1496 aa40.59■■■■■ 4.09
PAIP1-204ENST00000504075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
PAIP1-204ENST00000504075 ADAMTS12P58397 1594 aa40.42■■■■■ 4.06
PAIP1-204ENST00000504075 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.35■■■■■ 4.05
PAIP1-204ENST00000504075 KIF27Q86VH2 1401 aa40.33■■■■■ 4.05
PAIP1-204ENST00000504075 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.32■■■■■ 4.05
PAIP1-204ENST00000504075 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.32■■■■■ 4.05
PAIP1-204ENST00000504075 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.32■■■■■ 4.05
PAIP1-204ENST00000504075 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.32■■■■■ 4.04
PAIP1-204ENST00000504075 GRIN2AQ12879 1464 aa40.31■■■■■ 4.04
PAIP1-204ENST00000504075 ARHGEF11O15085 1522 aa40.3■■■■■ 4.04
PAIP1-204ENST00000504075 TRIM41Q8WV44 630 aa40.18■■■■■ 4.02
PAIP1-204ENST00000504075 IGF1RP08069 1367 aa40.15■■■■■ 4.02
PAIP1-204ENST00000504075 NUP160Q12769 1436 aa40.13■■■■■ 4.01
PAIP1-204ENST00000504075 CEP170Q5SW79 1584 aa40.1■■■■■ 4.01
PAIP1-204ENST00000504075 CUL7Q14999 1698 aa40.1■■■■■ 4.01
PAIP1-204ENST00000504075 ARAP1Q96P48 1450 aa39.95■■■■□ 3.99
PAIP1-204ENST00000504075 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.93■■■■□ 3.98
PAIP1-204ENST00000504075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.93■■■■□ 3.98
PAIP1-204ENST00000504075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.88■■■■□ 3.97
PAIP1-204ENST00000504075 SHROOM2Q13796 1616 aa39.85■■■■□ 3.97
PAIP1-204ENST00000504075 JPH4Q96JJ6 628 aa39.73■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms