RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430718.5

TTLL3-212, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL3, Length 536 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-212ENST00000430718 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.79■■■■□ 3
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TTLL3-212ENST00000430718 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.8■■■□□ 2.2
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TTLL3-212ENST00000430718 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.41■■■□□ 2.14
TTLL3-212ENST00000430718 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.34■■■□□ 2.13
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TTLL3-212ENST00000430718 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.28■■□□□ 1.96
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TTLL3-212ENST00000430718 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.2■■□□□ 1.95
TTLL3-212ENST00000430718 NCAPD3P42695 1498 aa26.47■■□□□ 1.83
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TTLL3-212ENST00000430718 SMARCA2P51531 1590 aa26.29■■□□□ 1.8
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TTLL3-212ENST00000430718 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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TTLL3-212ENST00000430718 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.99■■□□□ 1.75
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TTLL3-212ENST00000430718 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.82■■□□□ 1.72
TTLL3-212ENST00000430718 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.69■■□□□ 1.7
TTLL3-212ENST00000430718 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
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TTLL3-212ENST00000430718 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.65■■□□□ 1.7
TTLL3-212ENST00000430718 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.59■■□□□ 1.69
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TTLL3-212ENST00000430718 CFTRP13569 1480 aa25.36■■□□□ 1.65
TTLL3-212ENST00000430718 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.33■■□□□ 1.65
TTLL3-212ENST00000430718 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.31■■□□□ 1.64
TTLL3-212ENST00000430718 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.1■■□□□ 1.61
TTLL3-212ENST00000430718 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TTLL3-212ENST00000430718 PRDM2Q13029 1718 aa25.07■■□□□ 1.6
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TTLL3-212ENST00000430718 ABCC8Q09428 1581 aa24.86■■□□□ 1.57
TTLL3-212ENST00000430718 IFT140Q96RY7 1462 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-212ENST00000430718 TOPBP1Q92547 1522 aa24.84■■□□□ 1.57
TTLL3-212ENST00000430718 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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TTLL3-212ENST00000430718 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.48■■□□□ 1.51
TTLL3-212ENST00000430718 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.47■■□□□ 1.51
TTLL3-212ENST00000430718 ARHGEF11O15085 1522 aa24.43■■□□□ 1.5
TTLL3-212ENST00000430718 WDR97A6NE52 1622 aa24.43■■□□□ 1.5
TTLL3-212ENST00000430718 CUX1P39880 1505 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-212ENST00000430718 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-212ENST00000430718 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-212ENST00000430718 CHD1O14646 1710 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-212ENST00000430718 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTLL3-212ENST00000430718 FBLN2P98095 1184 aa24.35■■□□□ 1.49
TTLL3-212ENST00000430718 GRIN2BQ13224 1484 aa24.28■■□□□ 1.48
TTLL3-212ENST00000430718 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.28■■□□□ 1.48
TTLL3-212ENST00000430718 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TTLL3-212ENST00000430718 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.25■■□□□ 1.47
TTLL3-212ENST00000430718 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
TTLL3-212ENST00000430718 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.2■■□□□ 1.46
TTLL3-212ENST00000430718 SYNJ2O15056 1496 aa24.19■■□□□ 1.46
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TTLL3-212ENST00000430718 ARAP1Q96P48 1450 aa24.19■■□□□ 1.46
TTLL3-212ENST00000430718 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.18■■□□□ 1.46
TTLL3-212ENST00000430718 SYNJ1O43426 1573 aa24.16■■□□□ 1.46
TTLL3-212ENST00000430718 PBRM1Q86U86 1689 aa24.12■■□□□ 1.45
TTLL3-212ENST00000430718 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.12■■□□□ 1.45
TTLL3-212ENST00000430718 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
TTLL3-212ENST00000430718 TOP2BQ02880 1626 aa24.06■■□□□ 1.44
TTLL3-212ENST00000430718 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.06■■□□□ 1.44
TTLL3-212ENST00000430718 GRIN2AQ12879 1464 aa23.94■■□□□ 1.42
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TTLL3-212ENST00000430718 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.91■■□□□ 1.42
TTLL3-212ENST00000430718 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.9■■□□□ 1.42
TTLL3-212ENST00000430718 NUP160Q12769 1436 aa23.9■■□□□ 1.42
TTLL3-212ENST00000430718 CEP170Q5SW79 1584 aa23.83■■□□□ 1.41
TTLL3-212ENST00000430718 SHROOM2Q13796 1616 aa23.77■■□□□ 1.4
TTLL3-212ENST00000430718 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.75■■□□□ 1.39
TTLL3-212ENST00000430718 JPH4Q96JJ6 628 aa23.67■■□□□ 1.38
TTLL3-212ENST00000430718 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TTLL3-212ENST00000430718 IGF1RP08069 1367 aa23.63■■□□□ 1.37
TTLL3-212ENST00000430718 KIF27Q86VH2 1401 aa23.61■■□□□ 1.37
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