RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436051.1

HES6-208, Transcript of hes family bHLH transcription factor 6, human

TSL 3

Gene HES6, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HES6-208	ENST00000436051	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.63	■■■■■ 7.14
HES6-208	ENST00000436051	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.35	■■■■■ 6.13
HES6-208	ENST00000436051	ABCC9	O60706	1549 aa		53.02	■■■■■ 6.08
HES6-208	ENST00000436051	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.63	■■■■■ 5.7
HES6-208	ENST00000436051	NACAD	O15069	1562 aa		50.38	■■■■■ 5.66
HES6-208	ENST00000436051	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		50.14	■■■■■ 5.62
HES6-208	ENST00000436051	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.8	■■■■■ 5.56
HES6-208	ENST00000436051	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.5	■■■■■ 5.51
HES6-208	ENST00000436051	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.46	■■■■■ 5.51
HES6-208	ENST00000436051	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.45	■■■■■ 5.51
HES6-208	ENST00000436051	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.42	■■■■■ 5.5
HES6-208	ENST00000436051	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.29	■■■■■ 5.48
HES6-208	ENST00000436051	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.15	■■■■■ 5.46
HES6-208	ENST00000436051	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.63	■■■■■ 5.38
HES6-208	ENST00000436051	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.55	■■■■■ 5.36
HES6-208	ENST00000436051	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.92	■■■■■ 5.26
HES6-208	ENST00000436051	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.92	■■■■■ 5.26
HES6-208	ENST00000436051	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.74	■■■■■ 5.23
HES6-208	ENST00000436051	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.51	■■■■■ 5.04
HES6-208	ENST00000436051	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.43	■■■■■ 5.02
HES6-208	ENST00000436051	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.41	■■■■■ 5.02
HES6-208	ENST00000436051	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.3	■■■■■ 5
HES6-208	ENST00000436051	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.26	■■■■■ 5
HES6-208	ENST00000436051	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.18	■■■■■ 4.98
HES6-208	ENST00000436051	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46	■■■■■ 4.95
HES6-208	ENST00000436051	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.97	■■■■■ 4.95
HES6-208	ENST00000436051	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.94	■■■■■ 4.94
HES6-208	ENST00000436051	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.76	■■■■■ 4.92
HES6-208	ENST00000436051	NES	P48681	1621 aa		45.65	■■■■■ 4.9
HES6-208	ENST00000436051	CUX2	O14529	1486 aa		45.58	■■■■■ 4.89
HES6-208	ENST00000436051	WIZ	O95785	1651 aa		45.4	■■■■■ 4.86
HES6-208	ENST00000436051	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.39	■■■■■ 4.86
HES6-208	ENST00000436051	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.17	■■■■■ 4.82
HES6-208	ENST00000436051	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.13	■■■■■ 4.82
HES6-208	ENST00000436051	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.12	■■■■■ 4.81
HES6-208	ENST00000436051	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.12	■■■■■ 4.81
HES6-208	ENST00000436051	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.1	■■■■■ 4.81
HES6-208	ENST00000436051	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.06	■■■■■ 4.8
HES6-208	ENST00000436051	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.87	■■■■■ 4.77
HES6-208	ENST00000436051	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.72	■■■■■ 4.75
HES6-208	ENST00000436051	CFTR	P13569	1480 aa		44.66	■■■■■ 4.74
HES6-208	ENST00000436051	WDR62	O43379	1518 aa		44.6	■■■■■ 4.73
HES6-208	ENST00000436051	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.6	■■■■■ 4.73
HES6-208	ENST00000436051	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.59	■■■■■ 4.73
HES6-208	ENST00000436051	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.35	■■■■■ 4.69
HES6-208	ENST00000436051	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.22	■■■■■ 4.67
HES6-208	ENST00000436051	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.2	■■■■■ 4.67
HES6-208	ENST00000436051	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.78	■■■■■ 4.6
HES6-208	ENST00000436051	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.71	■■■■■ 4.59
HES6-208	ENST00000436051	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.71	■■■■■ 4.59
HES6-208	ENST00000436051	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.65	■■■■■ 4.58
HES6-208	ENST00000436051	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.6	■■■■■ 4.57
HES6-208	ENST00000436051	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.54	■■■■■ 4.56
HES6-208	ENST00000436051	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.37	■■■■■ 4.53
HES6-208	ENST00000436051	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.37	■■■■■ 4.53
HES6-208	ENST00000436051	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.36	■■■■■ 4.53
HES6-208	ENST00000436051	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.34	■■■■■ 4.53
HES6-208	ENST00000436051	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.3	■■■■■ 4.52
HES6-208	ENST00000436051	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.24	■■■■■ 4.51	6e-12	■□□□□ 9.6
HES6-208	ENST00000436051	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.19	■■■■■ 4.5
HES6-208	ENST00000436051	SOGA1	O94964	1423 aa		43.16	■■■■■ 4.5
HES6-208	ENST00000436051	CUX1	P39880	1505 aa		43.15	■■■■■ 4.5
HES6-208	ENST00000436051	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.13	■■■■■ 4.5
HES6-208	ENST00000436051	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.03	■■■■■ 4.48
HES6-208	ENST00000436051	CHD1	O14646	1710 aa		42.97	■■■■■ 4.47
HES6-208	ENST00000436051	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.97	■■■■■ 4.47
HES6-208	ENST00000436051	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.94	■■■■■ 4.46
HES6-208	ENST00000436051	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.94	■■■■■ 4.46
HES6-208	ENST00000436051	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.94	■■■■■ 4.46
HES6-208	ENST00000436051	FBLN2	P98095	1184 aa		42.87	■■■■■ 4.45
HES6-208	ENST00000436051	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.85	■■■■■ 4.45
HES6-208	ENST00000436051	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.82	■■■■■ 4.45
HES6-208	ENST00000436051	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.75	■■■■■ 4.43
HES6-208	ENST00000436051	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
HES6-208	ENST00000436051	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.67	■■■■■ 4.42
HES6-208	ENST00000436051	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.64	■■■■■ 4.42
HES6-208	ENST00000436051	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.41
HES6-208	ENST00000436051	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.59	■■■■■ 4.41
HES6-208	ENST00000436051	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.58	■■■■■ 4.41
HES6-208	ENST00000436051	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.57	■■■■■ 4.41
HES6-208	ENST00000436051	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.55	■■■■■ 4.4
HES6-208	ENST00000436051	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.55	■■■■■ 4.4
HES6-208	ENST00000436051	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.54	■■■■■ 4.4
HES6-208	ENST00000436051	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.52	■■■■■ 4.4
HES6-208	ENST00000436051	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.51	■■■■■ 4.4
HES6-208	ENST00000436051	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.5	■■■■■ 4.39
HES6-208	ENST00000436051	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.46	■■■■■ 4.39
HES6-208	ENST00000436051	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.23	■■■■■ 4.35
HES6-208	ENST00000436051	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.2	■■■■■ 4.35
HES6-208	ENST00000436051	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.14	■■■■■ 4.34
HES6-208	ENST00000436051	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.12	■■■■■ 4.33
HES6-208	ENST00000436051	NUP160	Q12769	1436 aa		42.06	■■■■■ 4.32
HES6-208	ENST00000436051	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HES6-208	ENST00000436051	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3
HES6-208	ENST00000436051	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.87	■■■■■ 4.29
HES6-208	ENST00000436051	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.83	■■■■■ 4.29
HES6-208	ENST00000436051	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.73	■■■■■ 4.27
HES6-208	ENST00000436051	IGF1R	P08069	1367 aa		41.68	■■■■■ 4.26
HES6-208	ENST00000436051	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.63	■■■■■ 4.25
HES6-208	ENST00000436051	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.62	■■■■■ 4.25

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