RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488865.2

RNF220-216, Transcript of ring finger protein 220, humanhuman

TSL 2

Gene RNF220, Length 860 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220-216ENST00000488865 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65■■■■■ 8
RNF220-216ENST00000488865 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.28■■■■■ 6.92
RNF220-216ENST00000488865 ABCC9O60706 1549 aa58.08■■■■■ 6.89
RNF220-216ENST00000488865 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.41■■■■■ 6.46
RNF220-216ENST00000488865 NACADO15069 1562 aa55.09■■■■■ 6.41
RNF220-216ENST00000488865 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.73■■■■■ 6.35
RNF220-216ENST00000488865 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.42■■■■■ 6.3
RNF220-216ENST00000488865 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.38■■■■■ 6.3
RNF220-216ENST00000488865 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.1■■■■■ 6.25
RNF220-216ENST00000488865 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.09■■■■■ 6.25
RNF220-216ENST00000488865 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.89■■■■■ 6.22
RNF220-216ENST00000488865 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.76■■■■■ 6.2
RNF220-216ENST00000488865 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.75■■■■■ 6.2
RNF220-216ENST00000488865 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.14■■■■■ 6.1
RNF220-216ENST00000488865 SCRIBQ14160 1630 aa53.04■■■■■ 6.08
RNF220-216ENST00000488865 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.51■■■■■ 6
RNF220-216ENST00000488865 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.44■■■■■ 5.99
RNF220-216ENST00000488865 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.35■■■■■ 5.97
RNF220-216ENST00000488865 NCAPD3P42695 1498 aa50.86■■■■■ 5.73
RNF220-216ENST00000488865 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.7■■■■■ 5.71
RNF220-216ENST00000488865 SMARCA4P51532 1647 aa50.65■■■■■ 5.7
RNF220-216ENST00000488865 SMARCA2P51531 1590 aa50.58■■■■■ 5.69
RNF220-216ENST00000488865 HMGXB3Q12766 1538 aa50.48■■■■■ 5.67
RNF220-216ENST00000488865 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.45■■■■■ 5.67
RNF220-216ENST00000488865 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.21■■■■■ 5.63
RNF220-216ENST00000488865 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.2■■■■■ 5.63
RNF220-216ENST00000488865 ERCC6Q03468 1493 aa50.16■■■■■ 5.62
RNF220-216ENST00000488865 CUX2O14529 1486 aa50.08■■■■■ 5.61
RNF220-216ENST00000488865 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.04■■■■■ 5.6
RNF220-216ENST00000488865 NESP48681 1621 aa49.93■■■■■ 5.58
RNF220-216ENST00000488865 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.9■■■■■ 5.58
RNF220-216ENST00000488865 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.68■■■■■ 5.54
RNF220-216ENST00000488865 WIZO95785 1651 aa49.44■■■■■ 5.5
RNF220-216ENST00000488865 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.43■■■■■ 5.5
RNF220-216ENST00000488865 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.4■■■■■ 5.5
RNF220-216ENST00000488865 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.3■■■■■ 5.48
RNF220-216ENST00000488865 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.29■■■■■ 5.48
RNF220-216ENST00000488865 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.09■■■■■ 5.45
RNF220-216ENST00000488865 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.93■■■■■ 5.42
RNF220-216ENST00000488865 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
RNF220-216ENST00000488865 WDR62O43379 1518 aa48.82■■■■■ 5.41
RNF220-216ENST00000488865 CFTRP13569 1480 aa48.77■■■■■ 5.4
RNF220-216ENST00000488865 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.76■■■■■ 5.4
RNF220-216ENST00000488865 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.72■■■■■ 5.39
RNF220-216ENST00000488865 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.31■■■■■ 5.32
RNF220-216ENST00000488865 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
RNF220-216ENST00000488865 PRDM2Q13029 1718 aa48.27■■■■■ 5.32
RNF220-216ENST00000488865 TOPBP1Q92547 1522 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF220-216ENST00000488865 OSCARQ8IYS5 282 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF220-216ENST00000488865 IFT140Q96RY7 1462 aa47.8■■■■■ 5.24
RNF220-216ENST00000488865 ABCC8Q09428 1581 aa47.79■■■■■ 5.24
RNF220-216ENST00000488865 TRIM41Q8WV44 630 aa47.69■■■■■ 5.22
RNF220-216ENST00000488865 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
RNF220-216ENST00000488865 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.66■■■■■ 5.22
RNF220-216ENST00000488865 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
RNF220-216ENST00000488865 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.17
RNF220-216ENST00000488865 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
RNF220-216ENST00000488865 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.26■■■■■ 5.165e-7■■■■□ 19.4
RNF220-216ENST00000488865 SOGA1O94964 1423 aa47.13■■■■■ 5.14
RNF220-216ENST00000488865 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.13■■■■■ 5.13
RNF220-216ENST00000488865 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.12■■■■■ 5.13
RNF220-216ENST00000488865 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.12■■■■■ 5.13
RNF220-216ENST00000488865 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.12■■■■■ 5.13
RNF220-216ENST00000488865 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.04■■■■■ 5.12
RNF220-216ENST00000488865 CUX1P39880 1505 aa47.02■■■■■ 5.12
RNF220-216ENST00000488865 CHD1O14646 1710 aa47.02■■■■■ 5.12
RNF220-216ENST00000488865 ARHGEF11O15085 1522 aa47■■■■■ 5.12
RNF220-216ENST00000488865 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
RNF220-216ENST00000488865 WDR97A6NE52 1622 aa46.97■■■■■ 5.11
RNF220-216ENST00000488865 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
RNF220-216ENST00000488865 FBLN2P98095 1184 aa46.91■■■■■ 5.1
RNF220-216ENST00000488865 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.78■■■■■ 5.08
RNF220-216ENST00000488865 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
RNF220-216ENST00000488865 GRIN2BQ13224 1484 aa46.71■■■■■ 5.07
RNF220-216ENST00000488865 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.65■■■■■ 5.06
RNF220-216ENST00000488865 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
RNF220-216ENST00000488865 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.56■■■■■ 5.04
RNF220-216ENST00000488865 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.55■■■■■ 5.04
RNF220-216ENST00000488865 SYNJ2O15056 1496 aa46.55■■■■■ 5.04
RNF220-216ENST00000488865 ARAP1Q96P48 1450 aa46.55■■■■■ 5.04
RNF220-216ENST00000488865 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.53■■■■■ 5.04
RNF220-216ENST00000488865 SYNJ1O43426 1573 aa46.52■■■■■ 5.04
RNF220-216ENST00000488865 PBRM1Q86U86 1689 aa46.49■■■■■ 5.03
RNF220-216ENST00000488865 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.45■■■■■ 5.03
RNF220-216ENST00000488865 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
RNF220-216ENST00000488865 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.32■■■■■ 5.01
RNF220-216ENST00000488865 TOP2BQ02880 1626 aa46.32■■■■■ 5
RNF220-216ENST00000488865 GRIN2AQ12879 1464 aa46.1■■■■■ 4.97
RNF220-216ENST00000488865 ADAMTS12P58397 1594 aa46.08■■■■■ 4.97
RNF220-216ENST00000488865 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
RNF220-216ENST00000488865 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.99■■■■■ 4.95
RNF220-216ENST00000488865 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.98■■■■■ 4.95
RNF220-216ENST00000488865 NUP160Q12769 1436 aa45.96■■■■■ 4.95
RNF220-216ENST00000488865 CEP170Q5SW79 1584 aa45.91■■■■■ 4.94
RNF220-216ENST00000488865 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.76■■■■■ 4.92
RNF220-216ENST00000488865 SHROOM2Q13796 1616 aa45.74■■■■■ 4.91
RNF220-216ENST00000488865 JPH4Q96JJ6 628 aa45.49■■■■■ 4.87
RNF220-216ENST00000488865 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.48■■■■■ 4.87
RNF220-216ENST00000488865 KIF27Q86VH2 1401 aa45.44■■■■■ 4.87
RNF220-216ENST00000488865 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.42■■■■■ 4.86
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