RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491491.1

MYCBP2-209, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 5

Gene MYCBP2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2-209ENST00000491491 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.87■■■■■ 6.54
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MYCBP2-209ENST00000491491 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.11■■■■■ 4.65
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MYCBP2-209ENST00000491491 SMARCA2P51531 1590 aa43.05■■■■■ 4.48
MYCBP2-209ENST00000491491 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.89■■■■■ 4.46
MYCBP2-209ENST00000491491 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
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MYCBP2-209ENST00000491491 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
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MYCBP2-209ENST00000491491 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
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MYCBP2-209ENST00000491491 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.35■■■■■ 4.21
MYCBP2-209ENST00000491491 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.34■■■■■ 4.21
MYCBP2-209ENST00000491491 WDR62O43379 1518 aa41.18■■■■■ 4.18
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MYCBP2-209ENST00000491491 ABCC8Q09428 1581 aa40.67■■■■■ 4.1
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MYCBP2-209ENST00000491491 IFT140Q96RY7 1462 aa40.51■■■■■ 4.07
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MYCBP2-209ENST00000491491 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.31■■■■■ 4.04
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MYCBP2-209ENST00000491491 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.1■■■■■ 4.01
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MYCBP2-209ENST00000491491 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.94■■■■□ 3.99
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MYCBP2-209ENST00000491491 FBLN2P98095 1184 aa39.76■■■■□ 3.96
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MYCBP2-209ENST00000491491 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.69■■■■□ 3.94
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MYCBP2-209ENST00000491491 ADAMTS12P58397 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
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MYCBP2-209ENST00000491491 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.27■■■■□ 3.88
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MYCBP2-209ENST00000491491 ARHGEF11O15085 1522 aa39.26■■■■□ 3.88
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MYCBP2-209ENST00000491491 EEA1Q15075 1411 aa39.14■■■■□ 3.86
MYCBP2-209ENST00000491491 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.13■■■■□ 3.85
MYCBP2-209ENST00000491491 NUP160Q12769 1436 aa39.1■■■■□ 3.85
MYCBP2-209ENST00000491491 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
MYCBP2-209ENST00000491491 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.03■■■■□ 3.84
MYCBP2-209ENST00000491491 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.99■■■■□ 3.83
MYCBP2-209ENST00000491491 ARAP1Q96P48 1450 aa38.97■■■■□ 3.83
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