RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491491.1

MYCBP2-209, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 5

Gene MYCBP2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBP2-209ENST00000491491 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.87■■■■■ 6.54
MYCBP2-209ENST00000491491 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.58■■■■■ 5.53
MYCBP2-209ENST00000491491 ABCC9O60706 1549 aa48.84■■■■■ 5.41
MYCBP2-209ENST00000491491 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.89■■■■■ 5.1
MYCBP2-209ENST00000491491 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.79■■■■■ 5.08
MYCBP2-209ENST00000491491 NACADO15069 1562 aa46.73■■■■■ 5.07
MYCBP2-209ENST00000491491 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
MYCBP2-209ENST00000491491 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.37■■■■■ 5.01
MYCBP2-209ENST00000491491 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.14■■■■■ 4.98
MYCBP2-209ENST00000491491 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.74■■■■■ 4.91
MYCBP2-209ENST00000491491 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.72■■■■■ 4.91
MYCBP2-209ENST00000491491 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.46■■■■■ 4.87
MYCBP2-209ENST00000491491 SCRIBQ14160 1630 aa45.36■■■■■ 4.85
MYCBP2-209ENST00000491491 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.1■■■■■ 4.81
MYCBP2-209ENST00000491491 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.82■■■■■ 4.77
MYCBP2-209ENST00000491491 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
MYCBP2-209ENST00000491491 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.11■■■■■ 4.65
MYCBP2-209ENST00000491491 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.87■■■■■ 4.61
MYCBP2-209ENST00000491491 SMARCA4P51532 1647 aa43.34■■■■■ 4.53
MYCBP2-209ENST00000491491 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
MYCBP2-209ENST00000491491 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.2■■■■■ 4.51
MYCBP2-209ENST00000491491 NCAPD3P42695 1498 aa43.18■■■■■ 4.5
MYCBP2-209ENST00000491491 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.11■■■■■ 4.49
MYCBP2-209ENST00000491491 SMARCA2P51531 1590 aa43.05■■■■■ 4.48
MYCBP2-209ENST00000491491 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.89■■■■■ 4.46
MYCBP2-209ENST00000491491 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
MYCBP2-209ENST00000491491 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
MYCBP2-209ENST00000491491 WIZO95785 1651 aa42.6■■■■■ 4.41
MYCBP2-209ENST00000491491 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
MYCBP2-209ENST00000491491 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
MYCBP2-209ENST00000491491 NESP48681 1621 aa42.25■■■■■ 4.35
MYCBP2-209ENST00000491491 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
MYCBP2-209ENST00000491491 ERCC6Q03468 1493 aa42.04■■■■■ 4.32
MYCBP2-209ENST00000491491 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.97■■■■■ 4.31
MYCBP2-209ENST00000491491 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.94■■■■■ 4.3
MYCBP2-209ENST00000491491 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.77■■■■■ 4.28
MYCBP2-209ENST00000491491 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.69■■■■■ 4.26
MYCBP2-209ENST00000491491 CFTRP13569 1480 aa41.64■■■■■ 4.26
MYCBP2-209ENST00000491491 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
MYCBP2-209ENST00000491491 CUX2O14529 1486 aa41.6■■■■■ 4.25
MYCBP2-209ENST00000491491 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
MYCBP2-209ENST00000491491 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.44■■■■■ 4.22
MYCBP2-209ENST00000491491 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.35■■■■■ 4.21
MYCBP2-209ENST00000491491 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.34■■■■■ 4.21
MYCBP2-209ENST00000491491 WDR62O43379 1518 aa41.18■■■■■ 4.18
MYCBP2-209ENST00000491491 PRDM2Q13029 1718 aa41.15■■■■■ 4.18
MYCBP2-209ENST00000491491 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
MYCBP2-209ENST00000491491 TOPBP1Q92547 1522 aa40.76■■■■■ 4.12
MYCBP2-209ENST00000491491 ABCC8Q09428 1581 aa40.67■■■■■ 4.1
MYCBP2-209ENST00000491491 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.65■■■■■ 4.1
MYCBP2-209ENST00000491491 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.63■■■■■ 4.09
MYCBP2-209ENST00000491491 IFT140Q96RY7 1462 aa40.51■■■■■ 4.07
MYCBP2-209ENST00000491491 CUX1P39880 1505 aa40.42■■■■■ 4.06
MYCBP2-209ENST00000491491 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
MYCBP2-209ENST00000491491 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
MYCBP2-209ENST00000491491 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.33■■■■■ 4.05
MYCBP2-209ENST00000491491 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.31■■■■■ 4.04
MYCBP2-209ENST00000491491 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
MYCBP2-209ENST00000491491 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.29■■■■■ 4.04
MYCBP2-209ENST00000491491 SOGA1O94964 1423 aa40.28■■■■■ 4.04
MYCBP2-209ENST00000491491 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.03
MYCBP2-209ENST00000491491 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
MYCBP2-209ENST00000491491 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
MYCBP2-209ENST00000491491 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.1■■■■■ 4.01
MYCBP2-209ENST00000491491 TRIM41Q8WV44 630 aa40.04■■■■■ 4
MYCBP2-209ENST00000491491 SYNJ1O43426 1573 aa40.01■■■■□ 3.99
MYCBP2-209ENST00000491491 OSCARQ8IYS5 282 aa39.98■■■■□ 3.99
MYCBP2-209ENST00000491491 TOP2BQ02880 1626 aa39.98■■■■□ 3.99
MYCBP2-209ENST00000491491 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.94■■■■□ 3.99
MYCBP2-209ENST00000491491 WDR97A6NE52 1622 aa39.87■■■■□ 3.97
MYCBP2-209ENST00000491491 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.87■■■■□ 3.97
MYCBP2-209ENST00000491491 GRIN2BQ13224 1484 aa39.77■■■■□ 3.96
MYCBP2-209ENST00000491491 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.77■■■■□ 3.96
MYCBP2-209ENST00000491491 FBLN2P98095 1184 aa39.76■■■■□ 3.96
MYCBP2-209ENST00000491491 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.75■■■■□ 3.95
MYCBP2-209ENST00000491491 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.69■■■■□ 3.94
MYCBP2-209ENST00000491491 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
MYCBP2-209ENST00000491491 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
MYCBP2-209ENST00000491491 PBRM1Q86U86 1689 aa39.6■■■■□ 3.93
MYCBP2-209ENST00000491491 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
MYCBP2-209ENST00000491491 SYNJ2O15056 1496 aa39.51■■■■□ 3.92
MYCBP2-209ENST00000491491 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.36■■■■□ 3.89
MYCBP2-209ENST00000491491 ADAMTS12P58397 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.31■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.27■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.27■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.27■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 ARHGEF11O15085 1522 aa39.26■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 KIF27Q86VH2 1401 aa39.26■■■■□ 3.88
MYCBP2-209ENST00000491491 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.25■■■■□ 3.87
MYCBP2-209ENST00000491491 GRIN2AQ12879 1464 aa39.25■■■■□ 3.87
MYCBP2-209ENST00000491491 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
MYCBP2-209ENST00000491491 IGF1RP08069 1367 aa39.21■■■■□ 3.87
MYCBP2-209ENST00000491491 EEA1Q15075 1411 aa39.14■■■■□ 3.86
MYCBP2-209ENST00000491491 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.13■■■■□ 3.85
MYCBP2-209ENST00000491491 NUP160Q12769 1436 aa39.1■■■■□ 3.85
MYCBP2-209ENST00000491491 CEP170Q5SW79 1584 aa39.08■■■■□ 3.85
MYCBP2-209ENST00000491491 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.03■■■■□ 3.84
MYCBP2-209ENST00000491491 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.99■■■■□ 3.83
MYCBP2-209ENST00000491491 ARAP1Q96P48 1450 aa38.97■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms