Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PFDN5-206ENST00000548984 541 ntTSL 212.36□□□□□ -0.433e-11■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PFDN5-213ENST00000550964 596 ntTSL 212□□□□□ -0.493e-11■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 215.63■□□□□ 0.091e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)11.83□□□□□ -0.521e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 PPP2R5D-201ENST00000230402 2958 ntTSL 214.58□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)25.67■■□□□ 1.72e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 SKIV2L-211ENST00000485349 734 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-9■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.863e-18■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.443e-18■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-18■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 517.16■□□□□ 0.343e-18■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 217■□□□□ 0.313e-18■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 SNHG5-205ENST00000427501 680 ntTSL 25.86□□□□□ -1.479e-13■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.791e-8■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.295e-11■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 APEX1-205ENST00000553555 1603 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.12e-8■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-8■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-8■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-8■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-8■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.723e-9■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.123e-9■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-9■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 MPDU1-207ENST00000571822 1020 ntTSL 212.97□□□□□ -0.333e-6■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MRPL28-205ENST00000447696 722 ntTSL 328.9■■■□□ 2.225e-8■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-6■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.822e-6■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-9■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MRPL48-206ENST00000508278 1560 ntTSL 212.98□□□□□ -0.334e-9■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MRPL48-204ENST00000411840 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-9■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MRPL48-202ENST00000314282 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-9■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.691e-6■■■□□ 18.9
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PABPC4Q13310 MPDU1-220ENST00000580834 714 ntTSL 59.36□□□□□ -0.914e-6■■■□□ 18.8
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PABPC4Q13310 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 215.9■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 18.8
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PABPC4Q13310 YIF1A-202ENST00000376899 1042 ntTSL 226.82■■□□□ 1.883e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.813e-7■■■□□ 18.8
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PABPC4Q13310 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-9■■■□□ 18.8
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PABPC4Q13310 VPS28-208ENST00000527797 1609 ntTSL 523.84■■□□□ 1.411e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 VPS28-205ENST00000526204 2120 ntTSL 523.36■■□□□ 1.331e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 VPS28-209ENST00000528142 1821 ntTSL 323.05■■□□□ 1.281e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 VPS28-207ENST00000526977 2036 ntTSL 521.41■■□□□ 1.021e-7■■■□□ 18.8
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PABPC4Q13310 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 VPS28-204ENST00000526054 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-7■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.973e-9■■■□□ 18.8
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PABPC4Q13310 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 PSMB6-202ENST00000571309 583 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.028e-10■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.448e-10■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 FAM96B-205ENST00000568572 446 ntTSL 513.43□□□□□ -0.265e-10■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.835e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.25e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.095e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RPL6-208ENST00000550566 1014 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-57■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RPL6-206ENST00000549847 588 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-57■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RPL6-213ENST00000553213 438 ntTSL 59.93□□□□□ -0.822e-57■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RPL6-204ENST00000548343 612 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-57■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ECSIT-212ENST00000592571 941 ntTSL 223.77■■□□□ 1.44e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ECSIT-205ENST00000585898 607 ntTSL 221.82■■□□□ 1.084e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.954e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.34e-8■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 C12orf57-203ENST00000538392 979 ntTSL 222.78■■□□□ 1.241e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-14■■■□□ 18.8
PABPC4Q13310 RPS24-211ENST00000480662 711 ntTSL 210.66□□□□□ -0.74e-78■■■□□ 18.8
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