RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506438.5

PITX1-205, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-205ENST00000506438 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.3■■■■■ 5.96
PITX1-205ENST00000506438 ABCC9O60706 1549 aa47.27■■■■■ 5.16
PITX1-205ENST00000506438 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.02■■■■■ 5.12
PITX1-205ENST00000506438 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.89■■■■■ 4.78
PITX1-205ENST00000506438 NACADO15069 1562 aa44.52■■■■■ 4.72
PITX1-205ENST00000506438 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.44■■■■■ 4.7
PITX1-205ENST00000506438 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.34■■■■■ 4.69
PITX1-205ENST00000506438 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.99■■■■■ 4.63
PITX1-205ENST00000506438 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.79■■■■■ 4.6
PITX1-205ENST00000506438 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
PITX1-205ENST00000506438 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.52■■■■■ 4.56
PITX1-205ENST00000506438 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
PITX1-205ENST00000506438 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.16■■■■■ 4.5
PITX1-205ENST00000506438 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.97■■■■■ 4.47
PITX1-205ENST00000506438 SCRIBQ14160 1630 aa42.89■■■■■ 4.46
PITX1-205ENST00000506438 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.66■■■■■ 4.42
PITX1-205ENST00000506438 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.6■■■■■ 4.41
PITX1-205ENST00000506438 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
PITX1-205ENST00000506438 NCAPD3P42695 1498 aa41.07■■■■■ 4.17
PITX1-205ENST00000506438 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.98■■■■■ 4.15
PITX1-205ENST00000506438 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.94■■■■■ 4.14
PITX1-205ENST00000506438 ERCC6Q03468 1493 aa40.89■■■■■ 4.14
PITX1-205ENST00000506438 SMARCA4P51532 1647 aa40.85■■■■■ 4.13
PITX1-205ENST00000506438 SMARCA2P51531 1590 aa40.84■■■■■ 4.13
PITX1-205ENST00000506438 CUX2O14529 1486 aa40.82■■■■■ 4.12
PITX1-205ENST00000506438 HMGXB3Q12766 1538 aa40.77■■■■■ 4.12
PITX1-205ENST00000506438 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
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PITX1-205ENST00000506438 NESP48681 1621 aa40.52■■■■■ 4.08
PITX1-205ENST00000506438 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.42■■■■■ 4.06
PITX1-205ENST00000506438 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.3■■■■■ 4.04
PITX1-205ENST00000506438 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.21■■■■■ 4.03
PITX1-205ENST00000506438 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
PITX1-205ENST00000506438 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.02■■■■■ 4
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PITX1-205ENST00000506438 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.85■■■■□ 3.97
PITX1-205ENST00000506438 WIZO95785 1651 aa39.81■■■■□ 3.96
PITX1-205ENST00000506438 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.68■■■■□ 3.94
PITX1-205ENST00000506438 WDR62O43379 1518 aa39.57■■■■□ 3.92
PITX1-205ENST00000506438 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.5■■■■□ 3.91
PITX1-205ENST00000506438 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.42■■■■□ 3.9
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PITX1-205ENST00000506438 CFTRP13569 1480 aa39.34■■■■□ 3.89
PITX1-205ENST00000506438 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
PITX1-205ENST00000506438 TRIM41Q8WV44 630 aa39.21■■■■□ 3.87
PITX1-205ENST00000506438 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
PITX1-205ENST00000506438 OSCARQ8IYS5 282 aa38.92■■■■□ 3.82
PITX1-205ENST00000506438 PRDM2Q13029 1718 aa38.9■■■■□ 3.82
PITX1-205ENST00000506438 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.86■■■■□ 3.81
PITX1-205ENST00000506438 IFT140Q96RY7 1462 aa38.7■■■■□ 3.79
PITX1-205ENST00000506438 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
PITX1-205ENST00000506438 TOPBP1Q92547 1522 aa38.63■■■■□ 3.78
PITX1-205ENST00000506438 ABCC8Q09428 1581 aa38.54■■■■□ 3.76
PITX1-205ENST00000506438 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.48■■■■□ 3.75
PITX1-205ENST00000506438 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
PITX1-205ENST00000506438 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.43■■■■□ 3.74
PITX1-205ENST00000506438 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.43■■■■□ 3.74
PITX1-205ENST00000506438 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.43■■■■□ 3.74
PITX1-205ENST00000506438 ARHGEF11O15085 1522 aa38.3■■■■□ 3.72
PITX1-205ENST00000506438 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
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PITX1-205ENST00000506438 CHD1O14646 1710 aa38.16■■■■□ 3.7
PITX1-205ENST00000506438 FBLN2P98095 1184 aa38.13■■■■□ 3.7
PITX1-205ENST00000506438 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
PITX1-205ENST00000506438 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.1■■■■□ 3.69
PITX1-205ENST00000506438 SOGA1O94964 1423 aa38.06■■■■□ 3.68
PITX1-205ENST00000506438 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.05■■■■□ 3.68
PITX1-205ENST00000506438 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
PITX1-205ENST00000506438 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.98■■■■□ 3.67
PITX1-205ENST00000506438 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.9■■■■□ 3.66
PITX1-205ENST00000506438 WDR97A6NE52 1622 aa37.9■■■■□ 3.66
PITX1-205ENST00000506438 ARAP1Q96P48 1450 aa37.9■■■■□ 3.66
PITX1-205ENST00000506438 CUX1P39880 1505 aa37.88■■■■□ 3.66
PITX1-205ENST00000506438 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
PITX1-205ENST00000506438 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
PITX1-205ENST00000506438 GRIN2BQ13224 1484 aa37.76■■■■□ 3.64
PITX1-205ENST00000506438 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
PITX1-205ENST00000506438 SYNJ1O43426 1573 aa37.73■■■■□ 3.63
PITX1-205ENST00000506438 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.72■■■■□ 3.63
PITX1-205ENST00000506438 SYNJ2O15056 1496 aa37.66■■■■□ 3.62
PITX1-205ENST00000506438 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.6■■■■□ 3.61
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PITX1-205ENST00000506438 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.36■■■■□ 3.57
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PITX1-205ENST00000506438 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.04■■■■□ 3.52
PITX1-205ENST00000506438 SHROOM2Q13796 1616 aa36.97■■■■□ 3.51
PITX1-205ENST00000506438 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
PITX1-205ENST00000506438 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
PITX1-205ENST00000506438 JPH4Q96JJ6 628 aa36.76■■■■□ 3.47
PITX1-205ENST00000506438 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.7■■■■□ 3.47
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