Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RLIMQ9NVW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RLIMQ9NVW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RLIMQ9NVW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RLIMQ9NVW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms