Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACER3Q9NUN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACER3Q9NUN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ACER3Q9NUN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACER3Q9NUN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms