Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTPS2Q9NRF8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTPS2Q9NRF8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTPS2Q9NRF8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTPS2Q9NRF8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms