Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP20A1Q6UW02 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP20A1Q6UW02 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP20A1Q6UW02 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP20A1Q6UW02 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP20A1Q6UW02 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP20A1Q6UW02 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP20A1Q6UW02 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms