Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1DQ13901 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1DQ13901 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1DQ13901 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C1DQ13901 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1DQ13901 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1DQ13901 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1DQ13901 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1DQ13901 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C1DQ13901 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1DQ13901 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1DQ13901 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1DQ13901 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1DQ13901 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1DQ13901 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1DQ13901 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1DQ13901 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1DQ13901 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1DQ13901 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1DQ13901 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1DQ13901 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1DQ13901 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1DQ13901 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1DQ13901 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1DQ13901 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1DQ13901 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1DQ13901 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1DQ13901 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1DQ13901 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1DQ13901 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1DQ13901 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1DQ13901 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1DQ13901 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1DQ13901 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1DQ13901 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1DQ13901 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1DQ13901 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1DQ13901 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1DQ13901 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1DQ13901 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1DQ13901 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1DQ13901 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1DQ13901 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1DQ13901 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1DQ13901 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1DQ13901 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1DQ13901 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1DQ13901 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1DQ13901 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1DQ13901 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1DQ13901 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1DQ13901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1DQ13901 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1DQ13901 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1DQ13901 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1DQ13901 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1DQ13901 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1DQ13901 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1DQ13901 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1DQ13901 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1DQ13901 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1DQ13901 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1DQ13901 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1DQ13901 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1DQ13901 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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