Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC1P48995 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC1P48995 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC1P48995 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms