RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194214.9

HSPB11-201, Transcript of heat shock protein family B (small) member 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HSPB11, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11-201ENST00000194214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.67■■■■■ 8.1
HSPB11-201ENST00000194214 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.92■■■■■ 7.02
HSPB11-201ENST00000194214 ABCC9O60706 1549 aa58.91■■■■■ 7.02
HSPB11-201ENST00000194214 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.1■■■■■ 6.57
HSPB11-201ENST00000194214 NACADO15069 1562 aa55.72■■■■■ 6.51
HSPB11-201ENST00000194214 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.5■■■■■ 6.48
HSPB11-201ENST00000194214 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.25■■■■■ 6.44
HSPB11-201ENST00000194214 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.95■■■■■ 6.39
HSPB11-201ENST00000194214 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.87■■■■■ 6.37
HSPB11-201ENST00000194214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.78■■■■■ 6.36
HSPB11-201ENST00000194214 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.42■■■■■ 6.3
HSPB11-201ENST00000194214 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.41■■■■■ 6.3
HSPB11-201ENST00000194214 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.25■■■■■ 6.28
HSPB11-201ENST00000194214 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.73■■■■■ 6.19
HSPB11-201ENST00000194214 SCRIBQ14160 1630 aa53.68■■■■■ 6.18
HSPB11-201ENST00000194214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.21■■■■■ 6.11
HSPB11-201ENST00000194214 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.1■■■■■ 6.09
HSPB11-201ENST00000194214 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.07■■■■■ 6.09
HSPB11-201ENST00000194214 NCAPD3P42695 1498 aa51.44■■■■■ 5.83
HSPB11-201ENST00000194214 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.27■■■■■ 5.8
HSPB11-201ENST00000194214 SMARCA4P51532 1647 aa51.22■■■■■ 5.79
HSPB11-201ENST00000194214 SMARCA2P51531 1590 aa51.15■■■■■ 5.78
HSPB11-201ENST00000194214 HMGXB3Q12766 1538 aa51.04■■■■■ 5.76
HSPB11-201ENST00000194214 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.98■■■■■ 5.75
HSPB11-201ENST00000194214 ERCC6Q03468 1493 aa50.9■■■■■ 5.74
HSPB11-201ENST00000194214 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.79■■■■■ 5.72
HSPB11-201ENST00000194214 CUX2O14529 1486 aa50.78■■■■■ 5.72
HSPB11-201ENST00000194214 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.76■■■■■ 5.72
HSPB11-201ENST00000194214 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.72■■■■■ 5.71
HSPB11-201ENST00000194214 NESP48681 1621 aa50.6■■■■■ 5.69
HSPB11-201ENST00000194214 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.59■■■■■ 5.69
HSPB11-201ENST00000194214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.28■■■■■ 5.64
HSPB11-201ENST00000194214 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
HSPB11-201ENST00000194214 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.02■■■■■ 5.6
HSPB11-201ENST00000194214 WIZO95785 1651 aa49.99■■■■■ 5.59
HSPB11-201ENST00000194214 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.95■■■■■ 5.59
HSPB11-201ENST00000194214 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.89■■■■■ 5.58
HSPB11-201ENST00000194214 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.56■■■■■ 5.52
HSPB11-201ENST00000194214 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.55■■■■■ 5.52
HSPB11-201ENST00000194214 WDR62O43379 1518 aa49.41■■■■■ 5.5
HSPB11-201ENST00000194214 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
HSPB11-201ENST00000194214 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.36■■■■■ 5.49
HSPB11-201ENST00000194214 CFTRP13569 1480 aa49.31■■■■■ 5.48
HSPB11-201ENST00000194214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.31■■■■■ 5.48
HSPB11-201ENST00000194214 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.42
HSPB11-201ENST00000194214 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.82■■■■■ 5.41
HSPB11-201ENST00000194214 PRDM2Q13029 1718 aa48.8■■■■■ 5.4
HSPB11-201ENST00000194214 TRIM41Q8WV44 630 aa48.54■■■■■ 5.36
HSPB11-201ENST00000194214 OSCARQ8IYS5 282 aa48.52■■■■■ 5.36
HSPB11-201ENST00000194214 IFT140Q96RY7 1462 aa48.38■■■■■ 5.34
HSPB11-201ENST00000194214 TOPBP1Q92547 1522 aa48.37■■■■■ 5.33
HSPB11-201ENST00000194214 ABCC8Q09428 1581 aa48.31■■■■■ 5.32
HSPB11-201ENST00000194214 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
HSPB11-201ENST00000194214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.2■■■■■ 5.31
HSPB11-201ENST00000194214 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48■■■■■ 5.28
HSPB11-201ENST00000194214 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
HSPB11-201ENST00000194214 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.87■■■■■ 5.25
HSPB11-201ENST00000194214 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.86■■■■■ 5.25
HSPB11-201ENST00000194214 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
HSPB11-201ENST00000194214 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
HSPB11-201ENST00000194214 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.81■■■■■ 5.24
HSPB11-201ENST00000194214 SOGA1O94964 1423 aa47.7■■■■■ 5.23
HSPB11-201ENST00000194214 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.7■■■■■ 5.23
HSPB11-201ENST00000194214 ARHGEF11O15085 1522 aa47.67■■■■■ 5.22
HSPB11-201ENST00000194214 CHD1O14646 1710 aa47.65■■■■■ 5.22
HSPB11-201ENST00000194214 FBLN2P98095 1184 aa47.6■■■■■ 5.21
HSPB11-201ENST00000194214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
HSPB11-201ENST00000194214 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.58■■■■■ 5.21
HSPB11-201ENST00000194214 CUX1P39880 1505 aa47.53■■■■■ 5.2
HSPB11-201ENST00000194214 WDR97A6NE52 1622 aa47.46■■■■■ 5.19
HSPB11-201ENST00000194214 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
HSPB11-201ENST00000194214 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.37■■■■■ 5.17
HSPB11-201ENST00000194214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.36■■■■■ 5.17
HSPB11-201ENST00000194214 GRIN2BQ13224 1484 aa47.27■■■■■ 5.16
HSPB11-201ENST00000194214 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
HSPB11-201ENST00000194214 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
HSPB11-201ENST00000194214 ARAP1Q96P48 1450 aa47.19■■■■■ 5.14
HSPB11-201ENST00000194214 SYNJ2O15056 1496 aa47.11■■■■■ 5.13
HSPB11-201ENST00000194214 SYNJ1O43426 1573 aa47.11■■■■■ 5.13
HSPB11-201ENST00000194214 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.1■■■■■ 5.13
HSPB11-201ENST00000194214 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.1■■■■■ 5.13
HSPB11-201ENST00000194214 PBRM1Q86U86 1689 aa47.05■■■■■ 5.12
HSPB11-201ENST00000194214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.05■■■■■ 5.12
HSPB11-201ENST00000194214 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.95■■■■■ 5.11
HSPB11-201ENST00000194214 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.89■■■■■ 5.1
HSPB11-201ENST00000194214 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
HSPB11-201ENST00000194214 TOP2BQ02880 1626 aa46.79■■■■■ 5.08
HSPB11-201ENST00000194214 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.78■■■■■ 5.08
HSPB11-201ENST00000194214 GRIN2AQ12879 1464 aa46.64■■■■■ 5.06
HSPB11-201ENST00000194214 ADAMTS12P58397 1594 aa46.6■■■■■ 5.05
HSPB11-201ENST00000194214 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.51■■■■■ 5.04
HSPB11-201ENST00000194214 NUP160Q12769 1436 aa46.47■■■■■ 5.03
HSPB11-201ENST00000194214 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.47■■■■■ 5.03
HSPB11-201ENST00000194214 CEP170Q5SW79 1584 aa46.45■■■■■ 5.03
HSPB11-201ENST00000194214 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.36■■■■■ 5.01
HSPB11-201ENST00000194214 SHROOM2Q13796 1616 aa46.27■■■■■ 5
HSPB11-201ENST00000194214 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
HSPB11-201ENST00000194214 JPH4Q96JJ6 628 aa46.06■■■■■ 4.96
HSPB11-201ENST00000194214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.94■■■■■ 4.95
HSPB11-201ENST00000194214 KIF27Q86VH2 1401 aa45.91■■■■■ 4.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms