RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194214.9

HSPB11-201, Transcript of heat shock protein family B (small) member 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HSPB11, Length 915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11-201ENST00000194214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.67■■■■■ 8.1
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HSPB11-201ENST00000194214 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.1■■■■■ 6.57
HSPB11-201ENST00000194214 NACADO15069 1562 aa55.72■■■■■ 6.51
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HSPB11-201ENST00000194214 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.95■■■■■ 6.39
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HSPB11-201ENST00000194214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.78■■■■■ 6.36
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HSPB11-201ENST00000194214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.21■■■■■ 6.11
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HSPB11-201ENST00000194214 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.07■■■■■ 6.09
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HSPB11-201ENST00000194214 SMARCA2P51531 1590 aa51.15■■■■■ 5.78
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HSPB11-201ENST00000194214 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.72■■■■■ 5.71
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HSPB11-201ENST00000194214 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.95■■■■■ 5.59
HSPB11-201ENST00000194214 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.89■■■■■ 5.58
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HSPB11-201ENST00000194214 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.36■■■■■ 5.49
HSPB11-201ENST00000194214 CFTRP13569 1480 aa49.31■■■■■ 5.48
HSPB11-201ENST00000194214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.31■■■■■ 5.48
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HSPB11-201ENST00000194214 TRIM41Q8WV44 630 aa48.54■■■■■ 5.36
HSPB11-201ENST00000194214 OSCARQ8IYS5 282 aa48.52■■■■■ 5.36
HSPB11-201ENST00000194214 IFT140Q96RY7 1462 aa48.38■■■■■ 5.34
HSPB11-201ENST00000194214 TOPBP1Q92547 1522 aa48.37■■■■■ 5.33
HSPB11-201ENST00000194214 ABCC8Q09428 1581 aa48.31■■■■■ 5.32
HSPB11-201ENST00000194214 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.27■■■■■ 5.32
HSPB11-201ENST00000194214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.2■■■■■ 5.31
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HSPB11-201ENST00000194214 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.7■■■■■ 5.23
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HSPB11-201ENST00000194214 CHD1O14646 1710 aa47.65■■■■■ 5.22
HSPB11-201ENST00000194214 FBLN2P98095 1184 aa47.6■■■■■ 5.21
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HSPB11-201ENST00000194214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.36■■■■■ 5.17
HSPB11-201ENST00000194214 GRIN2BQ13224 1484 aa47.27■■■■■ 5.16
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HSPB11-201ENST00000194214 ARAP1Q96P48 1450 aa47.19■■■■■ 5.14
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HSPB11-201ENST00000194214 SYNJ1O43426 1573 aa47.11■■■■■ 5.13
HSPB11-201ENST00000194214 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.1■■■■■ 5.13
HSPB11-201ENST00000194214 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.1■■■■■ 5.13
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HSPB11-201ENST00000194214 CEP170Q5SW79 1584 aa46.45■■■■■ 5.03
HSPB11-201ENST00000194214 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.36■■■■■ 5.01
HSPB11-201ENST00000194214 SHROOM2Q13796 1616 aa46.27■■■■■ 5
HSPB11-201ENST00000194214 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
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HSPB11-201ENST00000194214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.94■■■■■ 4.95
HSPB11-201ENST00000194214 KIF27Q86VH2 1401 aa45.91■■■■■ 4.94
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