Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SMAD2-211ENST00000589877 527 ntTSL 315.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 SMAD2-207ENST00000586514 828 ntTSL 514.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.441e-19■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.31e-19■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 CFL1-210ENST00000530945 1509 ntTSL 216.45■□□□□ 0.221e-19■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 510.7□□□□□ -0.71e-19■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 DIS3L2-208ENST00000424049 1149 ntTSL 511.04□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 221.71■■□□□ 1.074e-7■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 XRCC1-209ENST00000599693 628 ntTSL 313.73□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 XRCC1-205ENST00000595789 1147 ntTSL 313.62□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 XRCC1-207ENST00000598165 913 ntTSL 313.47□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 XRCC1-203ENST00000594107 586 ntTSL 27.9□□□□□ -1.143e-6■■■■■ 29.5
PCBP2Q15366 MTSS1-209ENST00000520094 581 ntTSL 413.36□□□□□ -0.272e-16■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PLXNB1-218ENST00000485535 3264 ntTSL 212.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 411.75□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.268e-8■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 LUZP1-205ENST00000475164 613 ntTSL 510.25□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-10■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 RPH3AL-209ENST00000572965 880 ntTSL 218.08■□□□□ 0.487e-16■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 511.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.94e-8■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SMARCB1-205ENST00000417137 889 ntTSL 322.03■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SMARCB1-208ENST00000634926 269 ntTSL 1 (best)3.16□□□□□ -1.98e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 SMARCB1-209ENST00000635578 242 ntTSL 1 (best)1.43□□□□□ -2.188e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.26e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PDE4D-215ENST00000506510 558 ntTSL 46.23□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PDE4D-217ENST00000509355 847 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.456e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PDE4D-213ENST00000505507 577 ntTSL 44.58□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 PDE4D-219ENST00000511382 581 ntTSL 44.53□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 ABTB2-202ENST00000530814 566 ntTSL 415.71■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 COPS7B-213ENST00000449174 668 ntTSL 310.66□□□□□ -0.74e-18■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 OSBPL10-216ENST00000480671 492 ntTSL 39.07□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 525.06■■□□□ 1.62e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 214.08□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 29.4
PCBP2Q15366 CDC42BPB-204ENST00000559043 1999 ntTSL 515.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 ZFAND3-207ENST00000474522 563 ntTSL 57.18□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 XPO1-212ENST00000457483 488 ntTSL 46.14□□□□□ -1.432e-14■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TSPAN9-208ENST00000640568 1465 ntTSL 520.79■□□□□ 0.924e-8■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-213ENST00000472155 2646 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-216ENST00000496466 2339 ntTSL 214.72□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-215ENST00000494942 2325 ntTSL 214.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TSPAN9-203ENST00000431374 558 ntTSL 414.41□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-214ENST00000475591 2542 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-210ENST00000442942 688 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-203ENST00000374215 938 ntTSL 511.69□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 UBXN11-212ENST00000452980 782 ntTSL 311.37□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 59.1□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-204ENST00000481385 2787 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-212ENST00000515594 3074 ntTSL 212.59□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-205ENST00000494284 2854 ntTSL 212.09□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-208ENST00000506783 3700 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.95e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-210ENST00000509876 7124 ntTSL 1 (best)4.92□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.895e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 215.84■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 410.92□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 29.3
PCBP2Q15366 SLC9A1-201ENST00000263980 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 29.3
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 229.5 ms