RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520094.1

MTSS1-209, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 4

Gene MTSS1, Length 581 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-209ENST00000520094 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.78■■■■□ 3.32
MTSS1-209ENST00000520094 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.96■■■□□ 2.71
MTSS1-209ENST00000520094 ABCC9O60706 1549 aa31.88■■■□□ 2.69
MTSS1-209ENST00000520094 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.35■■■□□ 2.45
MTSS1-209ENST00000520094 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.22■■■□□ 2.43
MTSS1-209ENST00000520094 NACADO15069 1562 aa30.18■■■□□ 2.42
MTSS1-209ENST00000520094 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.79■■■□□ 2.36
MTSS1-209ENST00000520094 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
MTSS1-209ENST00000520094 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.72■■■□□ 2.35
MTSS1-209ENST00000520094 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
MTSS1-209ENST00000520094 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.66■■■□□ 2.34
MTSS1-209ENST00000520094 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.5■■■□□ 2.31
MTSS1-209ENST00000520094 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.48■■■□□ 2.31
MTSS1-209ENST00000520094 SCRIBQ14160 1630 aa29.24■■■□□ 2.27
MTSS1-209ENST00000520094 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.03■■■□□ 2.24
MTSS1-209ENST00000520094 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.76■■■□□ 2.19
MTSS1-209ENST00000520094 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
MTSS1-209ENST00000520094 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.66■■■□□ 2.18
MTSS1-209ENST00000520094 SMARCA4P51532 1647 aa27.87■■■□□ 2.05
MTSS1-209ENST00000520094 NCAPD3P42695 1498 aa27.87■■■□□ 2.05
MTSS1-209ENST00000520094 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.85■■■□□ 2.05
MTSS1-209ENST00000520094 SMARCA2P51531 1590 aa27.75■■■□□ 2.03
MTSS1-209ENST00000520094 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
MTSS1-209ENST00000520094 HMGXB3Q12766 1538 aa27.67■■■□□ 2.02
MTSS1-209ENST00000520094 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.61■■■□□ 2.01
MTSS1-209ENST00000520094 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
MTSS1-209ENST00000520094 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.55■■■□□ 2
MTSS1-209ENST00000520094 ERCC6Q03468 1493 aa27.48■■□□□ 1.99
MTSS1-209ENST00000520094 NESP48681 1621 aa27.45■■□□□ 1.98
MTSS1-209ENST00000520094 CUX2O14529 1486 aa27.29■■□□□ 1.96
MTSS1-209ENST00000520094 WIZO95785 1651 aa27.29■■□□□ 1.96
MTSS1-209ENST00000520094 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.2■■□□□ 1.94
MTSS1-209ENST00000520094 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
MTSS1-209ENST00000520094 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.07■■□□□ 1.92
MTSS1-209ENST00000520094 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
MTSS1-209ENST00000520094 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.06■■□□□ 1.92
MTSS1-209ENST00000520094 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.06■■□□□ 1.92
MTSS1-209ENST00000520094 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.05■■□□□ 1.92
MTSS1-209ENST00000520094 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
MTSS1-209ENST00000520094 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.83■■□□□ 1.89
MTSS1-209ENST00000520094 CFTRP13569 1480 aa26.79■■□□□ 1.88
MTSS1-209ENST00000520094 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.77■■□□□ 1.88
MTSS1-209ENST00000520094 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.77■■□□□ 1.88
MTSS1-209ENST00000520094 WDR62O43379 1518 aa26.74■■□□□ 1.87
MTSS1-209ENST00000520094 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.65■■□□□ 1.86
MTSS1-209ENST00000520094 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
MTSS1-209ENST00000520094 PRDM2Q13029 1718 aa26.48■■□□□ 1.83
MTSS1-209ENST00000520094 TOPBP1Q92547 1522 aa26.29■■□□□ 1.8
MTSS1-209ENST00000520094 IFT140Q96RY7 1462 aa26.21■■□□□ 1.79
MTSS1-209ENST00000520094 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
MTSS1-209ENST00000520094 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.19■■□□□ 1.78
MTSS1-209ENST00000520094 ABCC8Q09428 1581 aa26.18■■□□□ 1.78
MTSS1-209ENST00000520094 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
MTSS1-209ENST00000520094 OSCARQ8IYS5 282 aa26.12■■□□□ 1.77
MTSS1-209ENST00000520094 TRIM41Q8WV44 630 aa26.07■■□□□ 1.76
MTSS1-209ENST00000520094 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
MTSS1-209ENST00000520094 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
MTSS1-209ENST00000520094 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
MTSS1-209ENST00000520094 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.754e-6■■■■□ 22.5
MTSS1-209ENST00000520094 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.98■■□□□ 1.75
MTSS1-209ENST00000520094 CUX1P39880 1505 aa25.93■■□□□ 1.74
MTSS1-209ENST00000520094 SOGA1O94964 1423 aa25.92■■□□□ 1.74
MTSS1-209ENST00000520094 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
MTSS1-209ENST00000520094 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MTSS1-209ENST00000520094 FBLN2P98095 1184 aa25.82■■□□□ 1.72
MTSS1-209ENST00000520094 CHD1O14646 1710 aa25.79■■□□□ 1.72
MTSS1-209ENST00000520094 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
MTSS1-209ENST00000520094 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
MTSS1-209ENST00000520094 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
MTSS1-209ENST00000520094 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.72■■□□□ 1.71
MTSS1-209ENST00000520094 ARHGEF11O15085 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
MTSS1-209ENST00000520094 WDR97A6NE52 1622 aa25.7■■□□□ 1.7
MTSS1-209ENST00000520094 GRIN2BQ13224 1484 aa25.66■■□□□ 1.7
MTSS1-209ENST00000520094 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
MTSS1-209ENST00000520094 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
MTSS1-209ENST00000520094 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
MTSS1-209ENST00000520094 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.59■■□□□ 1.69
MTSS1-209ENST00000520094 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 PBRM1Q86U86 1689 aa25.56■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.55■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 SYNJ1O43426 1573 aa25.55■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 SYNJ2O15056 1496 aa25.54■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.54■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 TOP2BQ02880 1626 aa25.53■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.52■■□□□ 1.68
MTSS1-209ENST00000520094 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.5■■□□□ 1.67
MTSS1-209ENST00000520094 ARAP1Q96P48 1450 aa25.49■■□□□ 1.67
MTSS1-209ENST00000520094 ADAMTS12P58397 1594 aa25.35■■□□□ 1.65
MTSS1-209ENST00000520094 GRIN2AQ12879 1464 aa25.34■■□□□ 1.65
MTSS1-209ENST00000520094 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.28■■□□□ 1.64
MTSS1-209ENST00000520094 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
MTSS1-209ENST00000520094 CEP170Q5SW79 1584 aa25.24■■□□□ 1.63
MTSS1-209ENST00000520094 NUP160Q12769 1436 aa25.22■■□□□ 1.63
MTSS1-209ENST00000520094 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
MTSS1-209ENST00000520094 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.18■■□□□ 1.62
MTSS1-209ENST00000520094 SHROOM2Q13796 1616 aa25.07■■□□□ 1.6
MTSS1-209ENST00000520094 KIF27Q86VH2 1401 aa25.06■■□□□ 1.6
MTSS1-209ENST00000520094 IGF1RP08069 1367 aa25.04■■□□□ 1.6
MTSS1-209ENST00000520094 JPH4Q96JJ6 628 aa25■■□□□ 1.59
MTSS1-209ENST00000520094 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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