Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CIT-217ENST00000545913 8520 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 CIT-209ENST00000538073 533 ntTSL 47.68□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CIT-213ENST00000543324 497 ntTSL 36.85□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 FAM49B-207ENST00000518285 507 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 FAM49B-227ENST00000523514 533 ntTSL 47.59□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-10■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-7■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.281e-7■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-11■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CDK8-205ENST00000536792 3032 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.145e-11■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.189e-7■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.589e-7■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.536e-7■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.059e-9■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.179e-9■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.839e-9■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-206ENST00000547780 582 ntTSL 520.68■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-227ENST00000551043 2288 ntTSL 218■□□□□ 0.471e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-236ENST00000552231 1545 ntTSL 217.52■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-209ENST00000548159 2549 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-220ENST00000549750 1085 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-241ENST00000552915 1071 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-202ENST00000418359 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-223ENST00000550160 993 ntTSL 510.95□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-239ENST00000552483 895 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 20.7
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TARDBPQ13148 CNOT2-242ENST00000553020 576 ntTSL 59.6□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 CNOT2-228ENST00000551132 618 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 20.7
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TARDBPQ13148 CNOT2-232ENST00000551661 571 ntTSL 48.6□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 20.7
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TARDBPQ13148 CNOT2-238ENST00000552422 443 ntTSL 36.47□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 20.7
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TARDBPQ13148 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 20.7
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TARDBPQ13148 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 20.7
TARDBPQ13148 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.46e-10■■■■□ 20.6
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TARDBPQ13148 ARIH2-226ENST00000488963 517 ntTSL 319.94■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 20.6
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TARDBPQ13148 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 518.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 20.6
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TARDBPQ13148 ARIH2-231ENST00000498314 649 ntTSL 416.52■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 20.6
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TARDBPQ13148 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 415.78■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 ARIH2-223ENST00000484999 728 ntTSL 513.2□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 20.6
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TARDBPQ13148 ARIH2-210ENST00000463204 522 ntTSL 511.04□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-9■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-20■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 CSNK2A2-203ENST00000563307 4978 ntTSL 312.5□□□□□ -0.412e-20■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 CSNK2A2-205ENST00000566813 1569 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-20■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 CSNK2A2-206ENST00000567730 947 ntTSL 38.56□□□□□ -1.042e-20■■■■□ 20.6
TARDBPQ13148 TMEM50B-201ENST00000420455 3062 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 20.6
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