RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483333.5

ARIH2-222, Transcript of ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene ARIH2, Length 674 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARIH2-222	ENST00000483333	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.17	■■■■□ 3.86
ARIH2-222	ENST00000483333	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.09	■■■■□ 3.21
ARIH2-222	ENST00000483333	ABCC9	O60706	1549 aa		35.06	■■■■□ 3.2
ARIH2-222	ENST00000483333	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ARIH2-222	ENST00000483333	NACAD	O15069	1562 aa		33.24	■■■□□ 2.91
ARIH2-222	ENST00000483333	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ARIH2-222	ENST00000483333	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ARIH2-222	ENST00000483333	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ARIH2-222	ENST00000483333	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.68	■■■□□ 2.82
ARIH2-222	ENST00000483333	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ARIH2-222	ENST00000483333	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
ARIH2-222	ENST00000483333	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ARIH2-222	ENST00000483333	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ARIH2-222	ENST00000483333	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ARIH2-222	ENST00000483333	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ARIH2-222	ENST00000483333	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ARIH2-222	ENST00000483333	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.63	■■■□□ 2.65
ARIH2-222	ENST00000483333	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
ARIH2-222	ENST00000483333	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.7	■■■□□ 2.51
ARIH2-222	ENST00000483333	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.57	■■■□□ 2.48
ARIH2-222	ENST00000483333	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.52	■■■□□ 2.48
ARIH2-222	ENST00000483333	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.5	■■■□□ 2.47
ARIH2-222	ENST00000483333	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.43	■■■□□ 2.46
ARIH2-222	ENST00000483333	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.42	■■■□□ 2.46
ARIH2-222	ENST00000483333	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.34	■■■□□ 2.45
ARIH2-222	ENST00000483333	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.29	■■■□□ 2.44
ARIH2-222	ENST00000483333	CUX2	O14529	1486 aa		30.28	■■■□□ 2.44
ARIH2-222	ENST00000483333	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.24	■■■□□ 2.43
ARIH2-222	ENST00000483333	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.24	■■■□□ 2.43
ARIH2-222	ENST00000483333	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.13	■■■□□ 2.41
ARIH2-222	ENST00000483333	NES	P48681	1621 aa		30.09	■■■□□ 2.41
ARIH2-222	ENST00000483333	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.97	■■■□□ 2.39
ARIH2-222	ENST00000483333	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ARIH2-222	ENST00000483333	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.78	■■■□□ 2.36
ARIH2-222	ENST00000483333	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
ARIH2-222	ENST00000483333	WIZ	O95785	1651 aa		29.72	■■■□□ 2.35
ARIH2-222	ENST00000483333	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ARIH2-222	ENST00000483333	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
ARIH2-222	ENST00000483333	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.55	■■■□□ 2.32
ARIH2-222	ENST00000483333	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ARIH2-222	ENST00000483333	WDR62	O43379	1518 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ARIH2-222	ENST00000483333	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
ARIH2-222	ENST00000483333	CFTR	P13569	1480 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ARIH2-222	ENST00000483333	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ARIH2-222	ENST00000483333	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.1	■■■□□ 2.25
ARIH2-222	ENST00000483333	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
ARIH2-222	ENST00000483333	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.99	■■■□□ 2.23
ARIH2-222	ENST00000483333	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ARIH2-222	ENST00000483333	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ARIH2-222	ENST00000483333	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ARIH2-222	ENST00000483333	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ARIH2-222	ENST00000483333	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ARIH2-222	ENST00000483333	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
ARIH2-222	ENST00000483333	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.72	■■■□□ 2.19
ARIH2-222	ENST00000483333	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
ARIH2-222	ENST00000483333	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
ARIH2-222	ENST00000483333	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
ARIH2-222	ENST00000483333	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
ARIH2-222	ENST00000483333	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.52	■■■□□ 2.16	3e-6	■■□□□ 12.5
ARIH2-222	ENST00000483333	SOGA1	O94964	1423 aa		28.46	■■■□□ 2.15
ARIH2-222	ENST00000483333	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ARIH2-222	ENST00000483333	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ARIH2-222	ENST00000483333	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.41	■■■□□ 2.14
ARIH2-222	ENST00000483333	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.4	■■■□□ 2.14
ARIH2-222	ENST00000483333	FBLN2	P98095	1184 aa		28.39	■■■□□ 2.14
ARIH2-222	ENST00000483333	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.38	■■■□□ 2.13
ARIH2-222	ENST00000483333	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
ARIH2-222	ENST00000483333	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.36	■■■□□ 2.13
ARIH2-222	ENST00000483333	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.33	■■■□□ 2.13
ARIH2-222	ENST00000483333	CUX1	P39880	1505 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ARIH2-222	ENST00000483333	CHD1	O14646	1710 aa		28.29	■■■□□ 2.12
ARIH2-222	ENST00000483333	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.24	■■■□□ 2.11
ARIH2-222	ENST00000483333	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ARIH2-222	ENST00000483333	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
ARIH2-222	ENST00000483333	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ARIH2-222	ENST00000483333	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
ARIH2-222	ENST00000483333	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ARIH2-222	ENST00000483333	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ARIH2-222	ENST00000483333	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ARIH2-222	ENST00000483333	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ARIH2-222	ENST00000483333	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.08	■■■□□ 2.08
ARIH2-222	ENST00000483333	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARIH2-222	ENST00000483333	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.01	■■■□□ 2.08
ARIH2-222	ENST00000483333	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARIH2-222	ENST00000483333	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.95	■■■□□ 2.07
ARIH2-222	ENST00000483333	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
ARIH2-222	ENST00000483333	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.89	■■■□□ 2.05
ARIH2-222	ENST00000483333	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ARIH2-222	ENST00000483333	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARIH2-222	ENST00000483333	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ARIH2-222	ENST00000483333	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARIH2-222	ENST00000483333	NUP160	Q12769	1436 aa		27.73	■■■□□ 2.03
ARIH2-222	ENST00000483333	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.72	■■■□□ 2.03
ARIH2-222	ENST00000483333	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ARIH2-222	ENST00000483333	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.54	■■■□□ 2
ARIH2-222	ENST00000483333	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.53	■■■□□ 2
ARIH2-222	ENST00000483333	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ARIH2-222	ENST00000483333	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.47	■■□□□ 1.99
ARIH2-222	ENST00000483333	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.44	■■□□□ 1.98
ARIH2-222	ENST00000483333	IGF1R	P08069	1367 aa		27.4	■■□□□ 1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms