Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MAN1B1-213ENST00000544448 2090 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-215ENST00000602022 3082 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-204ENST00000592031 2788 ntTSL 211.28□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-203ENST00000535753 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 50.2
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TBRG4Q969Z0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 ACTN4-211ENST00000589528 441 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 ACTN4-207ENST00000495553 586 ntTSL 59.5□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 MCF2L-215ENST00000433807 557 ntTSL 412.93□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 CHTF18-216ENST00000565787 607 ntTSL 523.11■■□□□ 1.292e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)22.82■■□□□ 1.242e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 50
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TBRG4Q969Z0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 214.86□□□□□ -0.032e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-217ENST00000567620 701 ntTSL 514.65□□□□□ -0.062e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-13■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 HDLBP-246ENST00000496569 374 ntTSL 411.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 HDLBP-206ENST00000417540 525 ntTSL 49.93□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 HDLBP-230ENST00000462130 464 ntTSL 49.74□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 NT5C2-201ENST00000343289 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 NT5C2-202ENST00000369857 2625 ntTSL 26.68□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 50
TBRG4Q969Z0 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 49.9
TBRG4Q969Z0 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 49.9
TBRG4Q969Z0 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.173e-6■■■■■ 49.9
TBRG4Q969Z0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 HADHB-203ENST00000412805 574 ntTSL 419.61■□□□□ 0.731e-15■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.411e-15■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.089e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.051e-15■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.077e-8■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 49.7
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TBRG4Q969Z0 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-8■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-15■■■■■ 49.7
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TBRG4Q969Z0 RSBN1L-203ENST00000445288 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-15■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 HADHB-204ENST00000425035 696 ntTSL 49.63□□□□□ -0.871e-15■■■■■ 49.7
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TBRG4Q969Z0 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 HADHB-205ENST00000448743 557 ntTSL 55.61□□□□□ -1.511e-15■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 ARHGEF12-208ENST00000529970 3786 ntTSL 23.96□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)20.19■□□□□ 0.827e-20■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.577e-20■■■■■ 49.7
TBRG4Q969Z0 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 37.18□□□□□ -1.263e-9■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)6.85□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 49.6
TBRG4Q969Z0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 49.5
TBRG4Q969Z0 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 49.5
TBRG4Q969Z0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 416.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 49.4
TBRG4Q969Z0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 49.3
TBRG4Q969Z0 TNS3-207ENST00000450444 1832 ntTSL 512.93□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 49.3
TBRG4Q969Z0 TNS3-206ENST00000442536 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 49.3
TBRG4Q969Z0 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 49.3
TBRG4Q969Z0 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 49.1
TBRG4Q969Z0 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 49.1
TBRG4Q969Z0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.81e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 TCF12-222ENST00000561152 675 ntTSL 525.42■■□□□ 1.667e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 223.67■■□□□ 1.382e-6■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 49
TBRG4Q969Z0 CARS2-209ENST00000535398 1878 ntTSL 221.2■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 49
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