RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.86■■■■□ 3.49
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.02■■■□□ 2.72
CHTF18-202ENST00000317063 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.95■■■□□ 2.55
CHTF18-202ENST00000317063 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC9O60706 1549 aa30.79■■■□□ 2.52
CHTF18-202ENST00000317063 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.39■■■□□ 2.45
CHTF18-202ENST00000317063 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.26■■■□□ 2.43
CHTF18-202ENST00000317063 NACADO15069 1562 aa29.91■■■□□ 2.38
CHTF18-202ENST00000317063 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.9■■■□□ 2.38
CHTF18-202ENST00000317063 SCRIBQ14160 1630 aa29.74■■■□□ 2.35
CHTF18-202ENST00000317063 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.73■■■□□ 2.35
CHTF18-202ENST00000317063 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.27■■■□□ 2.28
CHTF18-202ENST00000317063 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CHTF18-202ENST00000317063 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.267e-7■■■■■ 33
CHTF18-202ENST00000317063 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.93■■■□□ 2.22
CHTF18-202ENST00000317063 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.83■■■□□ 2.21
CHTF18-202ENST00000317063 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CHTF18-202ENST00000317063 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.58■■■□□ 2.17
CHTF18-202ENST00000317063 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CHTF18-202ENST00000317063 WIZO95785 1651 aa28.37■■■□□ 2.13
CHTF18-202ENST00000317063 SMARCA4P51532 1647 aa28.36■■■□□ 2.13
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CHTF18-202ENST00000317063 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.96■■■□□ 2.07
CHTF18-202ENST00000317063 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
CHTF18-202ENST00000317063 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.88■■■□□ 2.05
CHTF18-202ENST00000317063 SMARCA2P51531 1590 aa27.83■■■□□ 2.05
CHTF18-202ENST00000317063 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.75■■■□□ 2.03
CHTF18-202ENST00000317063 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.74■■■□□ 2.03
CHTF18-202ENST00000317063 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.69■■■□□ 2.02
CHTF18-202ENST00000317063 NCAPD3P42695 1498 aa27.67■■■□□ 2.02
CHTF18-202ENST00000317063 HMGXB3Q12766 1538 aa27.54■■■□□ 2
CHTF18-202ENST00000317063 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.43■■□□□ 1.98
CHTF18-202ENST00000317063 TRIM41Q8WV44 630 aa27.28■■□□□ 1.96
CHTF18-202ENST00000317063 ABCC8Q09428 1581 aa27.22■■□□□ 1.95
CHTF18-202ENST00000317063 CFTRP13569 1480 aa27.05■■□□□ 1.92
CHTF18-202ENST00000317063 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.03■■□□□ 1.92
CHTF18-202ENST00000317063 NESP48681 1621 aa27.01■■□□□ 1.91
CHTF18-202ENST00000317063 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CHTF18-202ENST00000317063 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
CHTF18-202ENST00000317063 SYNJ1O43426 1573 aa26.85■■□□□ 1.89
CHTF18-202ENST00000317063 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.83■■□□□ 1.89
CHTF18-202ENST00000317063 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.8■■□□□ 1.88
CHTF18-202ENST00000317063 PRDM2Q13029 1718 aa26.8■■□□□ 1.88
CHTF18-202ENST00000317063 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.75■■□□□ 1.87
CHTF18-202ENST00000317063 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.71■■□□□ 1.87
CHTF18-202ENST00000317063 CUX1P39880 1505 aa26.7■■□□□ 1.86
CHTF18-202ENST00000317063 SOGA1O94964 1423 aa26.68■■□□□ 1.86
CHTF18-202ENST00000317063 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.64■■□□□ 1.86
CHTF18-202ENST00000317063 TOP2BQ02880 1626 aa26.64■■□□□ 1.86
CHTF18-202ENST00000317063 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.58■■□□□ 1.85
CHTF18-202ENST00000317063 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.58■■□□□ 1.85
CHTF18-202ENST00000317063 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.56■■□□□ 1.84
CHTF18-202ENST00000317063 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.55■■□□□ 1.84
CHTF18-202ENST00000317063 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CHTF18-202ENST00000317063 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CHTF18-202ENST00000317063 TOPBP1Q92547 1522 aa26.43■■□□□ 1.82
CHTF18-202ENST00000317063 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.43■■□□□ 1.82
CHTF18-202ENST00000317063 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.43■■□□□ 1.82
CHTF18-202ENST00000317063 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.39■■□□□ 1.82
CHTF18-202ENST00000317063 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.35■■□□□ 1.81
CHTF18-202ENST00000317063 ERCC6Q03468 1493 aa26.33■■□□□ 1.81
CHTF18-202ENST00000317063 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CHTF18-202ENST00000317063 EEA1Q15075 1411 aa26.29■■□□□ 1.8
CHTF18-202ENST00000317063 CUX2O14529 1486 aa26.27■■□□□ 1.8
CHTF18-202ENST00000317063 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.24■■□□□ 1.79
CHTF18-202ENST00000317063 KIF27Q86VH2 1401 aa26.22■■□□□ 1.79
CHTF18-202ENST00000317063 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CHTF18-202ENST00000317063 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CHTF18-202ENST00000317063 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.09■■□□□ 1.77
CHTF18-202ENST00000317063 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.09■■□□□ 1.77
CHTF18-202ENST00000317063 IGF1RP08069 1367 aa26.09■■□□□ 1.77
CHTF18-202ENST00000317063 WDR62O43379 1518 aa26.06■■□□□ 1.76
CHTF18-202ENST00000317063 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CHTF18-202ENST00000317063 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CHTF18-202ENST00000317063 GOLGA3Q08378 1498 aa26.05■■□□□ 1.76
CHTF18-202ENST00000317063 KIF21BO75037 1637 aa26.01■■□□□ 1.75
CHTF18-202ENST00000317063 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CHTF18-202ENST00000317063 PRXQ9BXM0 1461 aa25.99■■□□□ 1.75
CHTF18-202ENST00000317063 WDR97A6NE52 1622 aa25.99■■□□□ 1.75
CHTF18-202ENST00000317063 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.755e-7■■■■■ 29
CHTF18-202ENST00000317063 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.95■■□□□ 1.74
CHTF18-202ENST00000317063 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.94■■□□□ 1.74
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CHTF18-202ENST00000317063 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.93■■□□□ 1.74
CHTF18-202ENST00000317063 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.89■■□□□ 1.73
CHTF18-202ENST00000317063 CEP162Q5TB80 1403 aa25.88■■□□□ 1.73
CHTF18-202ENST00000317063 MYT1Q01538 1121 aa25.88■■□□□ 1.73
CHTF18-202ENST00000317063 IFT140Q96RY7 1462 aa25.87■■□□□ 1.73
CHTF18-202ENST00000317063 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.84■■□□□ 1.73
CHTF18-202ENST00000317063 PBRM1Q86U86 1689 aa25.75■■□□□ 1.71
CHTF18-202ENST00000317063 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CHTF18-202ENST00000317063 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CHTF18-202ENST00000317063 CLIP1P30622 1438 aa25.71■■□□□ 1.71
CHTF18-202ENST00000317063 CUL7Q14999 1698 aa25.71■■□□□ 1.71
CHTF18-202ENST00000317063 GRIN2BQ13224 1484 aa25.69■■□□□ 1.7
CHTF18-202ENST00000317063 FBLN2P98095 1184 aa25.62■■□□□ 1.69
CHTF18-202ENST00000317063 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.62■■□□□ 1.69
CHTF18-202ENST00000317063 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
CHTF18-202ENST00000317063 P3H3Q8IVL6 736 aa25.58■■□□□ 1.69
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