RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.99■■■■■ 5.27
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CHTF18-218ENST00000569270 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.82■■■■■ 4.45
CHTF18-218ENST00000569270 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.78■■■■■ 4.12
CHTF18-218ENST00000569270 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.62■■■■■ 4.09
CHTF18-218ENST00000569270 NACADO15069 1562 aa40.55■■■■■ 4.08
CHTF18-218ENST00000569270 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.08■■■■■ 4.01
CHTF18-218ENST00000569270 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.04■■■■■ 4
CHTF18-218ENST00000569270 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.03■■■■■ 41e-11■■■■■ 42.3
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CHTF18-218ENST00000569270 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.65■■■■□ 3.94
CHTF18-218ENST00000569270 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.6■■■■□ 3.93
CHTF18-218ENST00000569270 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.57■■■■□ 3.92
CHTF18-218ENST00000569270 SCRIBQ14160 1630 aa39.18■■■■□ 3.86
CHTF18-218ENST00000569270 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.05■■■■□ 3.84
CHTF18-218ENST00000569270 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.63■■■■□ 3.77
CHTF18-218ENST00000569270 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
CHTF18-218ENST00000569270 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.58■■■■□ 3.77
CHTF18-218ENST00000569270 NCAPD3P42695 1498 aa37.49■■■■□ 3.59
CHTF18-218ENST00000569270 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.42■■■■□ 3.58
CHTF18-218ENST00000569270 SMARCA4P51532 1647 aa37.34■■■■□ 3.57
CHTF18-218ENST00000569270 SMARCA2P51531 1590 aa37.27■■■■□ 3.56
CHTF18-218ENST00000569270 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
CHTF18-218ENST00000569270 HMGXB3Q12766 1538 aa37.16■■■■□ 3.54
CHTF18-218ENST00000569270 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
CHTF18-218ENST00000569270 ERCC6Q03468 1493 aa37.01■■■■□ 3.51
CHTF18-218ENST00000569270 MROH2BQ7Z745 1585 aa37■■■■□ 3.51
CHTF18-218ENST00000569270 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.96■■■■□ 3.51
CHTF18-218ENST00000569270 NESP48681 1621 aa36.85■■■■□ 3.49
CHTF18-218ENST00000569270 CUX2O14529 1486 aa36.8■■■■□ 3.48
CHTF18-218ENST00000569270 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.64■■■■□ 3.46
CHTF18-218ENST00000569270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.54■■■■□ 3.44
CHTF18-218ENST00000569270 WIZO95785 1651 aa36.5■■■■□ 3.43
CHTF18-218ENST00000569270 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
CHTF18-218ENST00000569270 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.4■■■■□ 3.42
CHTF18-218ENST00000569270 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-218ENST00000569270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-218ENST00000569270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.23■■■■□ 3.39
CHTF18-218ENST00000569270 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-218ENST00000569270 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.08■■■■□ 3.37
CHTF18-218ENST00000569270 CFTRP13569 1480 aa35.99■■■■□ 3.35
CHTF18-218ENST00000569270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.98■■■■□ 3.35
CHTF18-218ENST00000569270 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.98■■■■□ 3.35
CHTF18-218ENST00000569270 WDR62O43379 1518 aa35.93■■■■□ 3.34
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.74■■■■□ 3.31
CHTF18-218ENST00000569270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
CHTF18-218ENST00000569270 PRDM2Q13029 1718 aa35.37■■■■□ 3.25
CHTF18-218ENST00000569270 TOPBP1Q92547 1522 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-218ENST00000569270 IFT140Q96RY7 1462 aa35.26■■■■□ 3.23
CHTF18-218ENST00000569270 OSCARQ8IYS5 282 aa35.25■■■■□ 3.23
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CHTF18-218ENST00000569270 ABCC8Q09428 1581 aa35.2■■■■□ 3.23
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM41Q8WV44 630 aa35.19■■■■□ 3.22
CHTF18-218ENST00000569270 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.13■■■■□ 3.21
CHTF18-218ENST00000569270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
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CHTF18-218ENST00000569270 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.184e-7■■■■■ 39.8
CHTF18-218ENST00000569270 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CHTF18-218ENST00000569270 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CHTF18-218ENST00000569270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.85■■■■□ 3.17
CHTF18-218ENST00000569270 SOGA1O94964 1423 aa34.84■■■■□ 3.17
CHTF18-218ENST00000569270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
CHTF18-218ENST00000569270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.77■■■■□ 3.16
CHTF18-218ENST00000569270 FBLN2P98095 1184 aa34.75■■■■□ 3.15
CHTF18-218ENST00000569270 CUX1P39880 1505 aa34.75■■■■□ 3.15
CHTF18-218ENST00000569270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.63■■■■□ 3.13
CHTF18-218ENST00000569270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.63■■■■□ 3.13
CHTF18-218ENST00000569270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.63■■■■□ 3.13
CHTF18-218ENST00000569270 ARHGEF11O15085 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
CHTF18-218ENST00000569270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.56■■■■□ 3.12
CHTF18-218ENST00000569270 CHD1O14646 1710 aa34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-218ENST00000569270 WDR97A6NE52 1622 aa34.51■■■■□ 3.11
CHTF18-218ENST00000569270 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
CHTF18-218ENST00000569270 GRIN2BQ13224 1484 aa34.48■■■■□ 3.11
CHTF18-218ENST00000569270 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.45■■■■□ 3.11
CHTF18-218ENST00000569270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
CHTF18-218ENST00000569270 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-218ENST00000569270 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.36■■■■□ 3.09
CHTF18-218ENST00000569270 SYNJ2O15056 1496 aa34.33■■■■□ 3.09
CHTF18-218ENST00000569270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-218ENST00000569270 ARAP1Q96P48 1450 aa34.29■■■■□ 3.08
CHTF18-218ENST00000569270 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-218ENST00000569270 SYNJ1O43426 1573 aa34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-218ENST00000569270 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.22■■■■□ 3.07
CHTF18-218ENST00000569270 TOP2BQ02880 1626 aa34.19■■■■□ 3.06
CHTF18-218ENST00000569270 PBRM1Q86U86 1689 aa34.19■■■■□ 3.06
CHTF18-218ENST00000569270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-218ENST00000569270 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CHTF18-218ENST00000569270 GRIN2AQ12879 1464 aa34.02■■■■□ 3.04
CHTF18-218ENST00000569270 ADAMTS12P58397 1594 aa33.98■■■■□ 3.03
CHTF18-218ENST00000569270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.97■■■■□ 3.03
CHTF18-218ENST00000569270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-218ENST00000569270 NUP160Q12769 1436 aa33.9■■■■□ 3.02
CHTF18-218ENST00000569270 CEP170Q5SW79 1584 aa33.86■■■■□ 3.01
CHTF18-218ENST00000569270 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.77■■■■□ 3
CHTF18-218ENST00000569270 KIF27Q86VH2 1401 aa33.64■■■□□ 2.98
CHTF18-218ENST00000569270 JPH4Q96JJ6 628 aa33.64■■■□□ 2.98
CHTF18-218ENST00000569270 IGF1RP08069 1367 aa33.62■■■□□ 2.97
CHTF18-218ENST00000569270 SHROOM2Q13796 1616 aa33.62■■■□□ 2.97
CHTF18-218ENST00000569270 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
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