RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262315.13

CHTF18-201, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHTF18, Length 3,090 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-201ENST00000262315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.32■■■□□ 2.28
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.51■■□□□ 1.67
CHTF18-201ENST00000262315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.94■■□□□ 1.58
CHTF18-201ENST00000262315 ABCC9O60706 1549 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-201ENST00000262315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CHTF18-201ENST00000262315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.17■■□□□ 1.46
CHTF18-201ENST00000262315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.04■■□□□ 1.44
CHTF18-201ENST00000262315 NACADO15069 1562 aa23.95■■□□□ 1.42
CHTF18-201ENST00000262315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.88■■□□□ 1.41
CHTF18-201ENST00000262315 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-201ENST00000262315 SCRIBQ14160 1630 aa23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-201ENST00000262315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 33
CHTF18-201ENST00000262315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.27■■□□□ 1.32
CHTF18-201ENST00000262315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
CHTF18-201ENST00000262315 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-201ENST00000262315 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-201ENST00000262315 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-201ENST00000262315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-201ENST00000262315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CHTF18-201ENST00000262315 SMARCA4P51532 1647 aa22.58■■□□□ 1.2
CHTF18-201ENST00000262315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-201ENST00000262315 WIZO95785 1651 aa22.5■■□□□ 1.19
CHTF18-201ENST00000262315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.35■■□□□ 1.17
CHTF18-201ENST00000262315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.29■■□□□ 1.16
CHTF18-201ENST00000262315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CHTF18-201ENST00000262315 SMARCA2P51531 1590 aa22.28■■□□□ 1.16
CHTF18-201ENST00000262315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-201ENST00000262315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-201ENST00000262315 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-201ENST00000262315 NCAPD3P42695 1498 aa22.15■■□□□ 1.14
CHTF18-201ENST00000262315 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.15■■□□□ 1.14
CHTF18-201ENST00000262315 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-201ENST00000262315 HMGXB3Q12766 1538 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-201ENST00000262315 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.78■■□□□ 1.08
CHTF18-201ENST00000262315 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-201ENST00000262315 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.68■■□□□ 1.06
CHTF18-201ENST00000262315 NESP48681 1621 aa21.67■■□□□ 1.06
CHTF18-201ENST00000262315 TRIM41Q8WV44 630 aa21.66■■□□□ 1.06
CHTF18-201ENST00000262315 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.61■■□□□ 1.05
CHTF18-201ENST00000262315 CFTRP13569 1480 aa21.61■■□□□ 1.05
CHTF18-201ENST00000262315 ABCC8Q09428 1581 aa21.57■■□□□ 1.04
CHTF18-201ENST00000262315 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CHTF18-201ENST00000262315 HRCP23327 699 aa21.49■■□□□ 1.03
CHTF18-201ENST00000262315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.45■■□□□ 1.02
CHTF18-201ENST00000262315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
CHTF18-201ENST00000262315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.42■■□□□ 1.02
CHTF18-201ENST00000262315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.42■■□□□ 1.02
CHTF18-201ENST00000262315 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CHTF18-201ENST00000262315 ERCC6Q03468 1493 aa21.36■■□□□ 1.01
CHTF18-201ENST00000262315 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.34■■□□□ 1.01
CHTF18-201ENST00000262315 SYNJ1O43426 1573 aa21.27■■□□□ 1
CHTF18-201ENST00000262315 PRDM2Q13029 1718 aa21.24■□□□□ 0.99
CHTF18-201ENST00000262315 CUX1P39880 1505 aa21.23■□□□□ 0.99
CHTF18-201ENST00000262315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.23■□□□□ 0.99
CHTF18-201ENST00000262315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CHTF18-201ENST00000262315 TOPBP1Q92547 1522 aa21.14■□□□□ 0.97
CHTF18-201ENST00000262315 TOP2BQ02880 1626 aa21.13■□□□□ 0.97
CHTF18-201ENST00000262315 SOGA1O94964 1423 aa21.13■□□□□ 0.97
CHTF18-201ENST00000262315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.11■□□□□ 0.97
CHTF18-201ENST00000262315 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.1■□□□□ 0.97
CHTF18-201ENST00000262315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.08■□□□□ 0.96
CHTF18-201ENST00000262315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.06■□□□□ 0.96
CHTF18-201ENST00000262315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.06■□□□□ 0.96
CHTF18-201ENST00000262315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.04■□□□□ 0.96
CHTF18-201ENST00000262315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CHTF18-201ENST00000262315 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CHTF18-201ENST00000262315 CUX2O14529 1486 aa20.99■□□□□ 0.95
CHTF18-201ENST00000262315 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.98■□□□□ 0.95
CHTF18-201ENST00000262315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CHTF18-201ENST00000262315 KIF27Q86VH2 1401 aa20.92■□□□□ 0.94
CHTF18-201ENST00000262315 WDR62O43379 1518 aa20.91■□□□□ 0.94
CHTF18-201ENST00000262315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CHTF18-201ENST00000262315 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CHTF18-201ENST00000262315 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CHTF18-201ENST00000262315 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CHTF18-201ENST00000262315 EEA1Q15075 1411 aa20.83■□□□□ 0.93
CHTF18-201ENST00000262315 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.935e-7■■■■■ 29
CHTF18-201ENST00000262315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.81■□□□□ 0.92
CHTF18-201ENST00000262315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CHTF18-201ENST00000262315 IFT140Q96RY7 1462 aa20.78■□□□□ 0.92
CHTF18-201ENST00000262315 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.76■□□□□ 0.91
CHTF18-201ENST00000262315 IGF1RP08069 1367 aa20.76■□□□□ 0.91
CHTF18-201ENST00000262315 FBLN2P98095 1184 aa20.75■□□□□ 0.91
CHTF18-201ENST00000262315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CHTF18-201ENST00000262315 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.7■□□□□ 0.9
CHTF18-201ENST00000262315 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.67■□□□□ 0.9
CHTF18-201ENST00000262315 GOLGA3Q08378 1498 aa20.63■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 WDR97A6NE52 1622 aa20.62■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 GRIN2BQ13224 1484 aa20.61■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 PRXQ9BXM0 1461 aa20.59■□□□□ 0.89
CHTF18-201ENST00000262315 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CHTF18-201ENST00000262315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.56■□□□□ 0.88
CHTF18-201ENST00000262315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.54■□□□□ 0.88
CHTF18-201ENST00000262315 KIF21BO75037 1637 aa20.52■□□□□ 0.88
CHTF18-201ENST00000262315 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CHTF18-201ENST00000262315 PBRM1Q86U86 1689 aa20.5■□□□□ 0.87
CHTF18-201ENST00000262315 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.49■□□□□ 0.87
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